Calreticulina

Infotaula de genCalreticulina
Estructures disponibles
PDBCerca ortòloga: PDBe RCSB
Llista de codis id de PDB

3POW, 2CLR, 3DOW, 3POS

Identificadors
ÀliesCALR (HUGO), CRT, HEL-S-99n, RO, SSA, cC1qR, calreticulin
IDs externesOMIM: 109091   MGI: 88252   HomoloGene: 37911   GeneCards: CALR   OMA: CALR - orthologs
Localització del gen (humà)
Cromosoma 19 (humà)
Crom.Cromosoma 19 (humà)[1]
Cromosoma 19 (humà)
Localització genòmica per Calreticulina
Localització genòmica per Calreticulina
Banda19p13.13Inici12.938.578 bp[1]
Fi12.944.489 bp[1]
Localització del gen (ratolí)
Cromosoma 8 (ratolí)
Crom.Cromosoma 8 (ratolí)[2]
Cromosoma 8 (ratolí)
Localització genòmica per Calreticulina
Localització genòmica per Calreticulina
Banda8 C3|8 41.21 cMInici85.568.479 bp[2]
Fi85.573.563 bp[2]
Patró d'expressió d'ARN
Bgee
HumàRatolí (ortòleg)
Més explicacions
Més explicacions
Més dades d'expressió de referència
BioGPS




Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica
Funció molecular
  • calcium ion binding Podeu traduir-lo
  • protein folding chaperone activity Podeu traduir-lo
  • carbohydrate binding Podeu traduir-lo
  • hormone binding Podeu traduir-lo
  • metal ion binding Podeu traduir-lo
  • complement component C1q complex binding Podeu traduir-lo
  • mRNA binding Podeu traduir-lo
  • iron ion binding Podeu traduir-lo
  • unfolded protein binding Podeu traduir-lo
  • zinc ion binding Podeu traduir-lo
  • integrin binding Podeu traduir-lo
  • DNA binding Podeu traduir-lo
  • chaperone binding Podeu traduir-lo
  • peptide binding Podeu traduir-lo
  • androgen receptor binding Podeu traduir-lo
  • unió de la proteïna de la ubiquitina Podeu corregir-lo
  • RNA binding Podeu traduir-lo
  • unió proteica 
Component cel·lular
  • citoplasma 
  • citosol 
  • endoplasmic reticulum lumen Podeu traduir-lo
  • membrana Podeu corregir-lo
  • focal adhesion Podeu traduir-lo
  • regió extracel·lular Podeu corregir-lo
  • perinuclear region of cytoplasm Podeu traduir-lo
  • sarcoplasmic reticulum lumen Podeu traduir-lo
  • nucli cel·lular 
  • endocytic vesicle lumen Podeu traduir-lo
  • superfície cel·lular Podeu corregir-lo
  • reticle endoplasmàtic 
  • exosoma extracel·lular Podeu corregir-lo
  • aparell de Golgi 
  • intracellular membrane-bounded organelle Podeu traduir-lo
  • matriu extracel·lular 
  • Intracel·lular 
  • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane Podeu traduir-lo
  • sarcoplasmic reticulum Podeu traduir-lo
  • reticle endoplasmàtic llis 
  • MHC class I peptide loading complex Podeu traduir-lo
  • acrosoma 
  • external side of plasma membrane Podeu traduir-lo
  • polisoma 
  • phagocytic vesicle membrane Podeu traduir-lo
  • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane Podeu traduir-lo
  • extracel·lular 
  • nuclear envelope Podeu traduir-lo
  • complex macromolecular Podeu corregir-lo
  • endoplasmic reticulum quality control compartment Podeu traduir-lo
  • collagen-containing extracellular matrix Podeu traduir-lo
Procés biològic
  • negative regulation of neuron differentiation Podeu traduir-lo
  • protein folding in endoplasmic reticulum Podeu traduir-lo
  • Endocitosi mediada per receptors Podeu corregir-lo
  • resposta a una substància orgànica Podeu corregir-lo
  • envelliment cel·lular 
  • espermatogènesi 
  • positive regulation of dendritic cell chemotaxis Podeu traduir-lo
  • regulation of apoptotic process Podeu traduir-lo
  • cellular response to organic substance Podeu traduir-lo
  • positive regulation of phagocytosis Podeu traduir-lo
  • negative regulation of intracellular steroid hormone receptor signaling pathway Podeu traduir-lo
  • regulació de la transcripció, modelat amb ADN Podeu corregir-lo
  • negative regulation of retinoic acid receptor signaling pathway Podeu traduir-lo
  • cardiac muscle cell differentiation Podeu traduir-lo
  • regulation of meiotic nuclear division Podeu traduir-lo
  • protein maturation by protein folding Podeu traduir-lo
  • positive regulation of cell cycle Podeu traduir-lo
  • protein export from nucleus Podeu traduir-lo
  • cellular response to lithium ion Podeu traduir-lo
  • peptide antigen assembly with MHC class I protein complex Podeu traduir-lo
  • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I Podeu traduir-lo
  • protein stabilization Podeu traduir-lo
  • cellular calcium ion homeostasis Podeu traduir-lo
  • negative regulation of transcription by RNA polymerase II Podeu traduir-lo
  • positive regulation of DNA replication Podeu traduir-lo
  • plegament proteic 
  • negative regulation of transcription, DNA-templated Podeu traduir-lo
  • cortical actin cytoskeleton organization Podeu traduir-lo
  • chaperone-mediated protein folding Podeu traduir-lo
  • response to estradiol Podeu traduir-lo
  • response to testosterone Podeu traduir-lo
  • ATF6-mediated unfolded protein response Podeu traduir-lo
  • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading Podeu traduir-lo
  • sequestering of calcium ion Podeu traduir-lo
  • positive regulation of gene expression Podeu traduir-lo
  • positive regulation of cell population proliferation Podeu traduir-lo
  • protein localization to nucleus Podeu traduir-lo
  • glucocorticoid receptor signaling pathway Podeu traduir-lo
  • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling Podeu traduir-lo
  • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent Podeu traduir-lo
  • negative regulation of translation Podeu traduir-lo
  • vesicle fusion with endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment (ERGIC) membrane Podeu traduir-lo
  • positive regulation of endothelial cell migration Podeu traduir-lo
  • negative regulation of trophoblast cell migration Podeu traduir-lo
Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs
EspèciesHumàRatolí
Entrez

811

12317

Ensembl

ENSG00000179218

ENSMUSG00000003814

UniProt

P27797

P14211

RefSeq (ARNm)

NM_004343

NM_007591

RefSeq (proteïna)

NP_004334

NP_031617

Localització (UCSC)Chr 19: 12.94 – 12.94 MbChr 8: 85.57 – 85.57 Mb
Cerca a PubMed[3][4]
Wikidata
Veure/Editar HumàVeure/Editar Ratolí
Infotaula de proteïnaCalreticulina
Substànciaproteïna Modifica el valor a Wikidata
Identificadors
RefSeqNP_004334 Modifica el valor a Wikidata
P27797 Modifica el valor a Wikidata
PDB3POW, 2CLR, 3DOW i 3POS Modifica el valor a Wikidata

La calreticulina és una proteïna resident al reticle endoplasmàtic rugós. Es tracta d'una lectina (proteïna de reconeixement de glúcids) amb funció de xaperona, ja que ajuda al correcte plegament de les proteïnes. La calreticulina té una mida aproximada de 400 residus, i és l'homòloga soluble de la calnexina.[5] Té un domini de reconeixement de sucres similar al de la concanavalina A, i un domini amb el qual s'uneix a la proteïna ERp57.[6] La calreticulina requereix cations Ca2+ per al seu funcionament.

Funció

La funció de la calreticulina és retenir les proteïnes en procés de plegament al reticle endoplasmàtic rugós (RER), de forma que s'evita la seva degradació o el seu trasllat prematur a l'aparell de Golgi.[5] La calreticulina s'uneix a l'oligosacàrid monoglucosilat de les glicoproteïnes que no estan completament plegades. Mentrestant, la proteïna es comença a plegar. Aquí intervé les protein disulfur isomerases (PDI), com la ERp57,[7] que catalitzen la formació de ponts disulfur. Posteriorment, la proteïna es desprèn i s'elimina un residu de glucosa. Si està ben plegada, s'eliminaran 3 residus glucosil més i la proteïna serà transportada a l'aparell de Golgi. Si no, la proteïna glucosil-transferasa, que només reconeix proteïnes mal plegades, torna a afegir un residu de glucosa. D'aquesta forma, la calreticulina o la calnexina la poden tornar a reconèixer i el cicle comença de nou.[5][6]

Referències

  1. 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000179218 - Ensembl, May 2017
  2. 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000003814 – Ensembl, May 2017
  3. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. 5,0 5,1 5,2 Voet, Donald; Voet, Judith G. BIOQUÍMICA (en castellà). 3ª edición. Buenos Aires: Editorial Médica Panamericana, 2006. ISBN 950-06-2301-3. 
  6. 6,0 6,1 Stryer, Lubert; Berg, Jeremy M.; Tymoczko, John L. BIOQUÍMICA (en castellà). 5ª edición. Barcelona: Editorial Reverté, S.A., 2003. ISBN 84-291-7584-9. 
  7. Oliver, Jason D.; et. al. «ERp57 Functions as a Subunit of Specific Complexes Formed with the ER Lectins Calreticulin and Calnexin». Molecular Biology of the Cell, 10, 1999, pàg. 2573-2582.