Mioferlina

Infotaula de genMioferlina
Estructures disponibles
PDBCerca ortòloga: PDBe RCSB
Llista de codis id de PDB

2DMH, 2K2O

Identificadors
ÀliesMYOF (HUGO), FER1L3, myoferlin, HAE7
IDs externesOMIM: 604603   MGI: 1919192   HomoloGene: 40882   GeneCards: MYOF   OMA: MYOF - orthologs
Localització del gen (humà)
Cromosoma 10 (humà)
Crom.Cromosoma 10 (humà)[1]
Cromosoma 10 (humà)
Localització genòmica per Mioferlina
Localització genòmica per Mioferlina
Banda10q23.33Inici93.306.429 bp[1]
Fi93.482.334 bp[1]
Localització del gen (ratolí)
Cromosoma 19 (ratolí)
Crom.Cromosoma 19 (ratolí)[2]
Cromosoma 19 (ratolí)
Localització genòmica per Mioferlina
Localització genòmica per Mioferlina
Banda19|19 C2Inici37.887.484 bp[2]
Fi38.032.025 bp[2]
Patró d'expressió d'ARN
Bgee
HumàRatolí (ortòleg)
Més explicacions
  • skin of hip Podeu traduir-lo

  • gingival epithelium Podeu traduir-lo

  • nasal epithelium Podeu traduir-lo

  • skin of thigh Podeu traduir-lo

  • stromal cell of endometrium Podeu traduir-lo

  • mucosa of paranasal sinus Podeu traduir-lo

  • epithelium of nasopharynx Podeu traduir-lo

  • uretra

  • conjuntiva palpebral Podeu corregir-lo

  • decidu
Més explicacions
Més dades d'expressió de referència
BioGPS


Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica
Funció molecular
  • unió proteica 
  • phospholipid binding Podeu traduir-lo
Component cel·lular
  • caveola Podeu traduir-lo
  • component integral de la membrana Podeu corregir-lo
  • membrana plasmàtica 
  • Membrana nuclear 
  • exosoma extracel·lular Podeu corregir-lo
  • nuclear envelope Podeu traduir-lo
  • cytoplasmic vesicle membrane Podeu traduir-lo
  • cytoplasmic vesicle Podeu traduir-lo
  • intracellular membrane-bounded organelle Podeu traduir-lo
  • nucli cel·lular 
  • membrana Podeu corregir-lo
Procés biològic
  • cellular response to heat Podeu traduir-lo
  • plasma membrane repair Podeu traduir-lo
  • contracció muscular 
  • blood circulation Podeu traduir-lo
  • regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway Podeu traduir-lo
  • myoblast fusion Podeu traduir-lo
  • glycerol metabolic process Podeu traduir-lo
  • T-tubule organization Podeu traduir-lo
Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs
EspèciesHumàRatolí
Entrez

26509

226101

Ensembl

ENSG00000138119

ENSMUSG00000048612

UniProt

Q9NZM1

Q69ZN7

RefSeq (ARNm)

NM_013451
NM_133337

NM_001099634
NM_001302140
NM_177035

RefSeq (proteïna)

NP_038479
NP_579899

NP_001093104
NP_001289069

Localització (UCSC)Chr 10: 93.31 – 93.48 MbChr 19: 37.89 – 38.03 Mb
Cerca a PubMed[3][4]
Wikidata
Veure/Editar HumàVeure/Editar Ratolí

La mioferlina és una proteïna que en humans està codificada pel gen MYOF .[5][6][7][8]

Funció

La disferlina i l'otoferlina són proteïnes que es troben en humans que són homòlogues a la mioferlina

Les mutacions de la disferlina, una proteïna associada a la membrana plasmàtica poden causar debilitat muscular que afecta tant els músculs proximals com els distals. La proteïna codificada per aquest gen és una proteïna de membrana de tipus II que és estructuralment similar a la disferlina. És membre de la família dels ferlins i s'associa amb les membranes plasmàtiques i nuclears. La mioferlina conté dominis C2 que tenen un paper en els esdeveniments de fusió de membrana mediats pel calci, cosa que suggereix que pot estar implicat en la regeneració i reparació de la membrana . Myoferlin també conté un domini FerA. S'ha demostrat que els dominis FerA interaccionen amb la membrana, cosa que suggereix que el domini FerA de la mioferlina pot contribuir al mecanisme d'interacció de la membrana de la mioferlina.[9] La mioferlina està sobreexpressada en diversos tipus de càncer, especialment de pàncrees i de mama triple negatiu. La sobreexpressió de la mioferlina s'associa amb la proliferació, la migració i la invasió de cèl·lules canceroses i silenciar el gen de la mioferlina en el càncer de mama triple negatiu pot reduir significativament el creixement del tumor i la progressió metastàtica.[10] S'han trobat dues variants de transcripció que codifiquen diferents isoformes per a aquest gen. S'han detectat altres variants possibles, però no s'han determinat la seva naturalesa de longitud completa.[8]

Referències

  1. 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000138119 - Ensembl, May 2017
  2. 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000048612 – Ensembl, May 2017
  3. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. Hum Mol Genet, 9, 2, Feb 2000, pàg. 217–26. DOI: 10.1093/hmg/9.2.217. PMID: 10607832.
  6. Genomics, 68, 3, Nov 2000, pàg. 313–21. DOI: 10.1006/geno.2000.6290. PMID: 10995573.
  7. J Biol Chem, 282, 42, Oct 2007, pàg. 30745–53. DOI: 10.1074/jbc.M704798200. PMID: 17702744 [Consulta: free].
  8. 8,0 8,1 «Entrez Gene: FER1L3 fer-1-like 3, myoferlin (C. elegans)».
  9. Harsini, Faraz M; Chebrolu, Sukanya; Fuson, Kerry L; White, Mark A; Rice, Anne M Scientific Reports, 8, 1, 19-07-2018, pàg. 10949. Bibcode: 2018NatSR...810949H. DOI: 10.1038/s41598-018-29184-1. PMC: 6053371. PMID: 30026467.
  10. Blomme, A; Costanza, B; de Tullio, P; Thiry, M; Van Simaeys, G Oncogene, 36, 15, abril 2017, pàg. 2116–2130. DOI: 10.1038/onc.2016.369. PMID: 27775075 [Consulta: free].

Bibliografia

  • «Construction of expression-ready cDNA clones for KIAA genes: manual curation of 330 KIAA cDNA clones.». DNA Res., 9, 3, 2003, pàg. 99–106. DOI: 10.1093/dnares/9.3.99. PMID: 12168954.
  • «Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XV. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.». DNA Res., 6, 5, 2000, pàg. 337–45. DOI: 10.1093/dnares/6.5.337. PMID: 10574462.
  • «Directed proteomic analysis of the human nucleolus.». Curr. Biol., 12, 1, 2002, pàg. 1–11. DOI: 10.1016/S0960-9822(01)00650-9. PMID: 11790298.
  • «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 99, 26, 2003, pàg. 16899–903. Bibcode: 2002PNAS...9916899M. DOI: 10.1073/pnas.242603899. PMC: 139241. PMID: 12477932.
  • «Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs.». Nat. Genet., 36, 1, 2004, pàg. 40–5. DOI: 10.1038/ng1285. PMID: 14702039.
  • «The DNA sequence and comparative analysis of human chromosome 10.». Nature, 429, 6990, 2004, pàg. 375–81. Bibcode: 2004Natur.429..375D. DOI: 10.1038/nature02462. PMID: 15164054.
  • «Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 101, 33, 2004, pàg. 12130–5. Bibcode: 2004PNAS..10112130B. DOI: 10.1073/pnas.0404720101. PMC: 514446. PMID: 15302935.
  • «The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).». Genome Res., 14, 10B, 2004, pàg. 2121–7. DOI: 10.1101/gr.2596504. PMC: 528928. PMID: 15489334.
  • «Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks.». Cell, 127, 3, 2006, pàg. 635–48. DOI: 10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID: 17081983.

Enllaços externs

  • «Gene and Cell Therapy Group».