ALPK3

ALPK3
Identifiants
AliasesALPK3
IDs externesOMIM: 617608 MGI: 2151224 HomoloGene: 10813 GeneCards: ALPK3
Position du gène (Homme)
Chromosome 15 humain
Chr.Chromosome 15 humain[1]
Chromosome 15 humain
Localisation génomique pour ALPK3
Localisation génomique pour ALPK3
Locus15q25.3Début84,817,356 bp[1]
Fin84,873,479 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 7 (souris)
Chr.Chromosome 7 (souris)[2]
Chromosome 7 (souris)
Localisation génomique pour ALPK3
Localisation génomique pour ALPK3
Locus7|7 D3Début80,707,348 bp[2]
Fin80,755,360 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • muscle gastrocnémien

  • muscle de la cuisse

  • muscle glutéal

  • apex of heart

  • ventricule gauche

  • Skeletal muscle tissue of biceps brachii

  • Skeletal muscle tissue of rectus abdominis

  • muscle tibial antérieur

  • muscle deltoïde

  • auricule droit
Fortement exprimé dans
  • muscle temporal

  • cheville

  • muscle digastrique

  • muscle vaste latéral

  • muscle de la cuisse

  • muscle triceps brachial

  • muscle sterno-cléido-mastoïdien

  • muscle extra-oculaire

  • chef médial du muscle gastrocnémien

  • muscle tibial antérieur
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
n/a
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • activité de transférase
  • protein serine/threonine kinase activity
  • liaison ATP
  • activité kinase
Composant cellulaire
  • noyau
Processus biologique
  • développent d'un organisme multicellulaire
  • phosphorylation des protéines
  • développement du cœur
  • phosphorylation
  • cardiac muscle cell development
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

57538

116904

Ensembl

ENSG00000136383

ENSMUSG00000038763

UniProt

Q96L96

Q924C5

RefSeq (mRNA)

NM_020778

NM_054085

RefSeq (protéine)

NP_065829

NP_473426

Localisation (UCSC)Chr 15: 84.82 – 84.87 MbChr 7: 80.71 – 80.76 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

L'ALPK3 (pour « Alpha-protein kinase 3 ») est une protéine kinase. Son gène, ALPK3 est situé le chromosome 15 humain.

Rôle

Bien qu'ayant un domaine de type kinase, il n'a pas été retrouvé d'activité catalytique[5].

Il intervient dans la régulation du calcium intra-cellulaire[6].

Il est exprimé dans la membrane nucléaire des cardiomyocytes ainsi que par le disque M du sarcomère où il régule l'activité des myomésines[5].

En médecine

La mutation de ce gène peut provoquer, si elle est bi-allélique, une cardiomyopathie sévère de l'enfant[7], avec une présentation variable[8] : cardiomyopathie hypertrophique, non-compaction ventriculaire gauche. Le syndrome peut comporter des déformations squelettiques ou une fente labio-palatine[9].

La présence d'un seul allèle muté est également responsable de cardiomyopathie découverte à l'âge adulte[10].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136383 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038763 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. a et b Agarwal R, Wakimoto H, Paulo JA et al. Pathogenesis of cardiomyopathy caused by variants in ALPK3, an essential pseudokinase in the cardiomyocyte nucleus and sarcomere, Circulation, 2022;146:1674–1693
  6. Phelan DG, Anderson DJ, Howden SE et al. ALPK3-deficient cardiomyocytes generated from patient-derived induced pluripotent stem cells and mutant human embryonic stem cells display abnormal calcium handling and establish that ALPK3 deficiency underlies familial cardiomyopathy, Eur Heart J, 2016;37:2586–2590
  7. Almomani R, Verhagen JMA, Herkert JC et al. Biallelic truncating mutations in ALPK3 cause severe pediatric cardiomyopathy, J Am Coll Cardiol, 2016;67:515–525
  8. Al Senaidi K, Niranjan S, Maryam J, Al A, Khalid F, Al-maawali A, Phenotypic spectrum of ALPK3-related cardiomyopathy, Am J Mol Genet, 2019;179:1235–1240
  9. Jaouadi H, Kraoua L, Chaker L et al. Novel ALPK3 mutation in a Tunisian patient with pediatric cardiomyopathy and facio-thoraco-skeletal features, J Hum Genet, 2018;63:1077–1082
  10. Herkert JC, Verhagen JMA, Yotti R et al. Expanding the clinical and genetic spectrum of ALPK3 variants: phenotypes identified in pediatric cardiomyopathy patients and adults with heterozygous variants, Am Heart J, 2020;225:108–119


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