L'armée, avec ce nom fut de courte durée, étant donné qu'après Bull Run, l'Armée du Shenandoah a été incorporée dans l'armée du Potomac, le général Joseph E. Johnston, qui commandait l'armée de la Shenandoah en prenant le commandement. L'armée a pris le nom Armée de Virginie du Nord le , et l'armée d'origine Beauregard est devenue par la suite le Premier Corps d'Armée du Nord Virginie.