C9orf72

C9orf72
Identifiants
AliasesC9orf72, Chromosome 9, phase de lecture ouverte 72
IDs externesOMIM: 614260 MGI: 1920455 HomoloGene: 10137 GeneCards: C9orf72
Position du gène (Homme)
Chromosome 9 humain
Chr.Chromosome 9 humain[1]
Chromosome 9 humain
Localisation génomique pour C9orf72
Localisation génomique pour C9orf72
Locus9p21.2Début27,535,640 bp[1]
Fin27,573,866 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 4 (souris)
Chr.Chromosome 4 (souris)[2]
Chromosome 4 (souris)
Localisation génomique pour C9orf72
Localisation génomique pour C9orf72
Locus4|4 A5Début35,191,285 bp[2]
Fin35,226,175 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • monocyte

  • mucosa of paranasal sinus

  • cellule épithéliale bronchiale

  • Vermis du cervelet

  • poumon droit

  • right uterine tube

  • cerebellar hemisphere

  • Brodmann area 23

  • right hemisphere of cerebellum

  • sang
Fortement exprimé dans
  • facial motor nucleus

  • tissu adipeux blanc

  • subcutaneous adipose tissue

  • stroma of bone marrow

  • épithélium olfactif

  • valve auriculo-ventriculaire

  • ganglion sensitif d’un nerf spinal

  • Corne antérieure

  • pontine nuclei

  • atrium
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
n/a
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison protéique
  • guanyl-nucleotide exchange factor activity
Composant cellulaire
  • autophagosome
  • région extracellulaire
  • endosome
  • lysosome
  • vésicule cytoplasmique
  • noyau
  • milieu extracellulaire
  • guanyl-nucleotide exchange factor complex
  • cytoplasme
  • Atg1/ULK1 kinase complex
  • axonal growth cone
  • main axon
  • P-body
  • membrane
  • axone
  • dendrite
  • cône de croissance
  • membrane nucléaire
  • prolongement cellulaire
  • péricaryon
  • cytoplasmic stress granule
  • neuron projection
Processus biologique
  • endocytose
  • positive regulation of macroautophagy
  • regulation of autophagy
  • regulation of TORC1 signaling
  • autophagie
  • negative regulation of protein phosphorylation
  • stress granule assembly
  • axon extension
  • regulation of actin filament organization
  • late endosome to lysosome transport
  • regulation of autophagosome assembly
  • negative regulation of GTP binding
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

203228

73205

Ensembl

ENSG00000147894

ENSMUSG00000028300

UniProt

Q96LT7

Q6DFW0

RefSeq (mRNA)

NM_145005
NM_001256054
NM_018325

NM_001081343
NM_028466

RefSeq (protéine)

NP_001242983
NP_060795
NP_659442

NP_001074812
NP_082742

Localisation (UCSC)Chr 9: 27.54 – 27.57 MbChr 4: 35.19 – 35.23 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

C9orf72 (chromosome 9 open reading frame 72, cadre de lecture ouvert 72 sur le chromosome 9) est un gène codant chez l’être humain pour la protéine homonyme C9orf72.

Le gène C9orf72 se situe sur le bras court (p) du chromosome 9, au niveau du cadre de lecture ouvert 72 depuis la paire de bases 27 546 542 jusqu’à la paire de bases 27 573 863. Son locus se trouve en 9p21.2[5].

La protéine C9orf72 se retrouve dans de nombreuses régions du cerveau, dans le cytoplasme des neurones ainsi que dans leurs terminaisons synaptiques. Les maladies causées par les mutations du gène C9orf72 ont été découvertes par deux équipes de chercheurs indépendantes, celle de Rosa Rademakers de la Mayo Clinic et celle de Bryan Traynor du National Institutes of Health, et ont été publiées pour la première fois en [6],[7]. Les mutations du gène C9orf72 sont d’importance particulière car il s’agit du mécanisme pathogénique le plus fréquemment observé en relation avec des formes familiales de DFT/DLFT et/ou de SLA.

Interactions

Il a été démontré que C9orf72 interagit avec les gènes suivants :

  • ELAVL1 (en)[8]
  • UBC (gène) (en)[8]

Références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000147894 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028300 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. C9orf72 chromosome 9 open reading frame 72 [Homo sapiens] - Gene - NCBI
  6. DOI 10.1016/j.neuron.2011.09.011
  7. DOI 10.1016/j.neuron.2011.09.010
  8. a et b C9ORF72. (2012b). Interaction Summary, 2012, from http://thebiogrid.org/128456/table/homo-sapiens/c9orf72.html
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