GATA4

GATA4
Visualisation de la protéine Cristallisée GATA4
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

2M9W

Identifiants
AliasesGATA4
IDs externesOMIM: 600576 MGI: 95664 HomoloGene: 1551 GeneCards: GATA4
Position du gène (Homme)
Chromosome 8 humain
Chr.Chromosome 8 humain[1]
Chromosome 8 humain
Localisation génomique pour GATA4
Localisation génomique pour GATA4
Locus8p23.1Début11,676,959 bp[1]
Fin11,760,002 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 14 (souris)
Chr.Chromosome 14 (souris)[2]
Chromosome 14 (souris)
Localisation génomique pour GATA4
Localisation génomique pour GATA4
Locus14 D1|14 33.24 cMDébut63,436,371 bp[2]
Fin63,509,141 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • auricule droit

  • ventricule gauche

  • duodénum

  • apex of heart

  • left ovary

  • artère coronaire droite

  • right ovary

  • body of pancreas

  • artère coronaire gauche

  • right testis
Fortement exprimé dans
  • epithelium of stomach

  • germinal epithelium

  • antre du pylore

  • duodénum

  • granulosa cell of ovary

  • mucous cell of stomach

  • crête génitale

  • cellule de Leydig

  • theca folliculi

  • Vésicule vitelline
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison ADN
  • sequence-specific DNA binding
  • co-SMAD binding
  • DNA-binding transcription factor activity
  • transcription coactivator activity
  • zinc ion binding
  • transcription factor binding
  • liaison de chromatine
  • liaison ion métal
  • liaison protéique
  • cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
  • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
  • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
  • protein kinase binding
  • NFAT protein binding
  • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Composant cellulaire
  • nucléoplasme
  • RNA polymerase II transcription regulator complex
  • noyau
  • corps nucléaire
Processus biologique
  • endoderm development
  • male gonad development
  • regulation of transcription, DNA-templated
  • ventricular septum development
  • cell growth involved in cardiac muscle cell development
  • embryonic foregut morphogenesis
  • endocardial cushion development
  • cardiac muscle cell differentiation
  • cell-cell signaling
  • response to mechanical stimulus
  • coagulation sanguine
  • transcription by RNA polymerase II
  • transcription, DNA-templated
  • positive regulation of angiogenesis
  • régulation positive de la transcription dépendante de l'ADN
  • heart looping
  • atrial septum morphogenesis
  • response to vitamin A
  • regulation of cardiac muscle cell contraction
  • atrial septum secundum morphogenesis
  • atrial septum primum morphogenesis
  • intestinal epithelial cell differentiation
  • embryonic heart tube anterior/posterior pattern specification
  • positive regulation of BMP signaling pathway
  • positive regulation of cardioblast differentiation
  • positive regulation of vascular endothelial growth factor production
  • negative regulation of autophagy
  • cardiac ventricle morphogenesis
  • cardiac right ventricle morphogenesis
  • cellular response to glucose stimulus
  • positive regulation of transcription by RNA polymerase II
  • transdifférenciation
  • aortic valve morphogenesis
  • développement du cœur
  • morphogenèse d'un organe animal
  • histogenèse
  • développement d'une cellule
  • structure anatomique impliquée dans la morphogenèse
  • digestive tract development
  • cardiac muscle tissue development
  • atrioventricular valve formation
  • negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process
  • regulation of protein kinase B signaling
  • cardiac muscle tissue regeneration
  • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
  • negative regulation of oxidative stress-induced cell death
  • negative regulation of apoptotic signaling pathway
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

2626

14463

Ensembl

ENSG00000136574
ENSG00000285109

ENSMUSG00000021944

UniProt

P43694

Q08369

RefSeq (mRNA)

NM_001308093
NM_001308094
NM_002052
NM_001374273
NM_001374274

NM_008092
NM_001310610

RefSeq (protéine)

NP_001295022
NP_001295023
NP_002043
NP_001361202
NP_001361203

NP_001297539
NP_032118

Localisation (UCSC)Chr 8: 11.68 – 11.76 MbChr 14: 63.44 – 63.51 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

La protéine GATA4 est un facteur de transcription codé chez l'homme par le gène GATA4[5].

La protéine GATA4 appartient à la famille des facteurs transcription GATA avec domaines en doigts de zinc. Les membres de cette famille reconnaissent le motif d'ADN GATA, qui est présent dans les promoteurs d'une multitude de gènes. GATA4 semble réguler des gènes impliqués dans l'embryogénèse et dans la différenciation et fonction du myocarde. Des mutations dans ce gène ont été associées avec des défauts du septum arteriosum[6].

Interactions

La protéine GATA4 s'est montrée être capable d'interagir avec:

  • NKX2-5[7],[8],[9]
  • TBX5[7]
  • ZFPM2 (en)[10]
  • Facteur de réponse au sérum[11],[12]
  • HAND2[13]

Notes et références

  1. a b et c ENSG00000285109 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136574, ENSG00000285109 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021944 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. (en) White RA, Dowler LL, Pasztor LM, Gatson LL, Adkison LR, Angeloni SV, Wilson DB, « Assignment of the transcription factor GATA4 gene to human chromosome 8 and mouse chromosome 14: Gata4 is a candidate gene for Ds (disorganization) », Genomics, vol. 27, no 1,‎ , p. 20–6. (PMID 7665171, DOI 10.1006/geno.1995.1003)
  6. « Entrez Gene: GATA4 GATA binding protein 4 »
  7. a et b Vidu Garg, « GATA4 mutations cause human congenital heart defects and reveal an interaction with TBX5 », Nature, vol. 424, no 6947,‎ , p. 443–447 (PMID 12845333, DOI 10.1038/nature01827)
  8. D Durocher, « The cardiac transcription factors Nkx2-5 and GATA-4 are mutual cofactors », EMBO J, vol. 16, no 18,‎ , p. 5687–96 (ISSN 0261-4189, PMID 9312027, DOI 10.1093/emboj/16.18.5687)
  9. W Zhu, « Functional analyses of three Csx/Nkx-2.5 mutations that cause human congenital heart disease », J Biol Chem, vol. 275, no 45,‎ , p. 35291–6 (ISSN 0021-9258, PMID 10948187, DOI 10.1074/jbc.M000525200)
  10. E C Svensson, « Molecular cloning of FOG-2: a modulator of transcription factor GATA-4 in cardiomyocytes », Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 96, no 3,‎ , p. 956–61 (ISSN 0027-8424, PMID 9927675)
  11. N S Belaguli, « Cardiac tissue enriched factors serum response factor and GATA-4 are mutual coregulators », Mol. Cell. Biol., vol. 20, no 20,‎ , p. 7550–8 (ISSN 0270-7306, PMID 11003651)
  12. S Morin, « Serum response factor-GATA ternary complex required for nuclear signaling by a G-protein-coupled receptor », Mol. Cell. Biol., vol. 21, no 4,‎ , p. 1036–44 (ISSN 0270-7306, PMID 11158291, DOI 10.1128/MCB.21.4.1036-1044.2001)
  13. Yan-Shan Dai, « The transcription factors GATA4 and dHAND physically interact to synergistically activate cardiac gene expression through a p300-dependent mechanism », J. Biol. Chem., vol. 277, no 27,‎ , p. 24390–8 (ISSN 0021-9258, PMID 11994297, DOI 10.1074/jbc.M202490200)
v · m
Introduction à la génétique
Transcription
Régulation de la transcription
Régulation post-transcriptionnelle
Traduction
Régulation de la traduction
Régulation post-traductionnelle
Contrôle épigénétique
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Liens externes

  • Infobiogen