H2AFY

H2AFY
Structure de la protéine H2AFY. Basé sur l'identifiant PDB 1u35.
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue: PDBe RCSB Identifiants PDB 1U35, 1ZR3, 1ZR5, 2F8N, 2FXK, 3HQH, 3HSV, 3IID, 3IIF, 3IVB, 5IIT
Identifiants
Aliases	MACROH2A1, Histone de cœur macro-H2A.1
IDs externes	OMIM: 610054 MGI: 1349392 HomoloGene: 3598 GeneCards: MACROH2A1
Position du gène (Homme) Chr. Chromosome 5 humain[1] Locus 5q31.1 Début 135,334,381 bp[1] Fin 135,399,914 bp[1]
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 13 (souris)[2] Locus 13|13 B1 Début 56,221,432 bp[2] Fin 56,284,174 bp[2]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans epithelium of nasopharynx monocyte mucosa of pharynx pénis humain os spongieux éminence ganglionnaire buccal mucosa cell liquide amniotique palpebral conjunctiva lobe inférieur du poumon Fortement exprimé dans saccule otic vesicle Rostral migratory stream otic placode artère carotide interne somite ventricular zone éminence ganglionnaire mandibular prominence maxillary prominence Plus de données d'expression de référence BioGPS Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology Fonction moléculaire protein kinase binding rDNA binding protein serine/threonine kinase inhibitor activity RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding liaison de chromatine double-stranded methylated DNA binding protein heterodimerization activity RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding core promoter sequence-specific DNA binding liaison ADN chromatin DNA binding liaison enzymatique liaison protéique nucleosomal DNA binding promoter-specific chromatin binding Composant cellulaire exosome ESC/E(Z) complex nucléole condensed chromosome chromosome pericentric heterochromatin nucléosome noyau nuclear chromosome chromatine sexuelle Corpuscule de Barr chromatine Processus biologique negative regulation of histone H3-K4 methylation regulation of ribosomal DNA heterochromatin assembly dosage compensation negative regulation of cell cycle G2/M phase transition epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation regulation of cell growth positive regulation of keratinocyte differentiation negative regulation of protein serine/threonine kinase activity negative regulation of transcription by RNA polymerase II assemblage du nucléosome negative regulation of protein localization to chromosome, telomeric region negative regulation of gene expression, epigenetic negative regulation of histone H3-K27 methylation regulation of gene expression, epigenetic positive regulation of maintenance of mitotic sister chromatid cohesion establishment of protein localization to chromatin negative regulation of transcription of nucleolar large rRNA by RNA polymerase I regulation of lipid metabolic process regulation of response to oxidative stress negative regulation of response to oxidative stress positive regulation of response to oxidative stress organisation de la chromatine Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 9555 26914 Ensembl ENSG00000113648 ENSMUSG00000015937 UniProt O75367 Q9QZQ8 RefSeq (mRNA) NM_001040158 NM_004893 NM_138609 NM_138610 NM_001159513 NM_001159514 NM_001159515 NM_012015 RefSeq (protéine) NP_001035248 NP_004884 NP_613075 NP_613258 NP_001152985 NP_001152986 NP_001152987 NP_036145 Localisation (UCSC) Chr 5: 135.33 – 135.4 Mb Chr 13: 56.22 – 56.28 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
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L'histone de cœur macro-H2A.1 est une protéine qui est codée par le gène H2AFY chez l'homme^[5],[6],[7].

Les histones sont des protéines nucléaires de base responsables de la structure nucléosomale de la fibre chromosomique chez les eucaryotes. Les nucléosomes consistent en environ 146 pb d'ADN enroulé autour d'un octamère d'histone composé de paires de chacune des quatre histones principales (H2A, H2B, H3 et H4). La fibre de chromatine est ensuite compactée par l'interaction d'une histone de liaison, H1, avec l'ADN inter-nucléosomal pour former des structures de chromatine d'ordre supérieur. Ce gène code un membre de la famille des histones H2A. Il s'agit d'un variant d'histone qui remplace les histones H2A conventionnelles dans un sous-ensemble de nucléosomes où il réprime la transcription et participe à l'inactivation stable du chromosome X. L'épissage alternatif de ce transcrit résulte en plusieurs variants de transcription codant différentes isoformes^[7]. L'expression de ces isoformes est associée à plusieurs cancers, tels que le carcinome hépatocellulaire^[8].

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