IDH1

IDH1
Visualisation de la protéine Cristallisée IDH1
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

1T09, 1T0L, 3INM, 3MAP, 3MAR, 3MAS, 4I3K, 4I3L, 4KZO, 4L03, 4L04, 4L06, 4UMX, 4UMY, 4XRX, 5DE1, 4XS3, 5K10, 5K11

Identifiants
AliasesIDH1
IDs externesOMIM: 147700 MGI: 96413 HomoloGene: 21195 GeneCards: IDH1
Position du gène (Homme)
Chromosome 2 humain
Chr.Chromosome 2 humain[1]
Chromosome 2 humain
Localisation génomique pour IDH1
Localisation génomique pour IDH1
Locus2q34Début208,236,229 bp[1]
Fin208,266,074 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 1 (souris)
Chr.Chromosome 1 (souris)[2]
Chromosome 1 (souris)
Localisation génomique pour IDH1
Localisation génomique pour IDH1
Locus1 C2- C3|1 32.91 cMDébut65,197,775 bp[2]
Fin65,225,659 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • corpus epididymis

  • muqueuse jéjunale

  • right adrenal cortex

  • mucosa of sigmoid colon

  • left adrenal gland

  • left adrenal cortex

  • secondary oocyte

  • duodénum

  • vésicule séminale

  • caput epididymis
Fortement exprimé dans
  • cumulus cell

  • transitional epithelium of urinary bladder

  • right kidney

  • medial ganglionic eminence

  • left lobe of liver

  • glande surrénale

  • human kidney

  • antre du pylore

  • barrel cortex

  • ganglion cervical supérieur
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
n/a
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • magnesium ion binding
  • protein homodimerization activity
  • oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor
  • signaling receptor binding
  • isocitrate dehydrogenase (NADP+) activity
  • activité d'oxydoréductase
  • NAD binding
  • isocitrate dehydrogenase activity
  • NADP binding
  • liaison ion métal
  • (R)-2-hydroxyglutarate dehydrogenase activity
  • cadherin binding
  • identical protein binding
Composant cellulaire
  • peroxysome
  • cytosol
  • exosome
  • peroxisomal matrix
  • cytoplasme
  • mitochondrie
  • région extracellulaire
  • secretory granule lumen
  • tertiary granule lumen
  • ficolin-1-rich granule lumen
Processus biologique
  • female gonad development
  • NADPH regeneration
  • response to oxidative stress
  • response to organic cyclic compound
  • response to steroid hormone
  • 2-oxoglutarate metabolic process
  • regulation of phospholipid catabolic process
  • isocitrate metabolic process
  • cycle du glyoxylate
  • cycle de Krebs
  • regulation of phospholipid biosynthetic process
  • glutathione metabolic process
  • neutrophil degranulation
  • protein targeting to peroxisome
  • NADP metabolic process
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

3417

15926

Ensembl

ENSG00000138413

ENSMUSG00000025950

UniProt

O75874

O88844

RefSeq (mRNA)

NM_005896
NM_001282386
NM_001282387

NM_001111320
NM_010497

RefSeq (protéine)

NP_001269315
NP_001269316
NP_005887

NP_001104790
NP_034627

Localisation (UCSC)Chr 2: 208.24 – 208.27 MbChr 1: 65.2 – 65.23 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

L'IDH1 est l'une des trois isocitrate déshydrogénases. Son gène est IDH1 situé le chromosome 2 humain.

En médecine

La mutation de son gène augmente la synthèse du 2-hydroxyglutarate avec un effet cancerigène[5]. Le mécanisme de cette dernière serait une hyperméthylation de l'ADN modifiant l'expression de certains gènes, dont celui du TET2[6], intervenant dans la différenciation cellulaire.

Ces mutations sont décrites dans plusieurs types de tumeurs cérébrales[5], dans certaines leucémies myéloïdes aiguës[7]et dans certains types de tumeurs osseuses comme le chondrosarcome.

Cible thérapeutique

L'ivosidénib est un inhibiteur de la forme mutée de la protéine[8] qui a une certaine efficacité sur les leucémies aiguës myéloblastiques réfractaires ou récidivantes[9].

Notes et références

  1. ↑ a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000138413 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000025950 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. ↑ « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. ↑ a et b Dang L, White DW, Gross S et al. Cancer-associated IDH1 mutations produce 2-hydroxyglutarate, Nature, 2009;462:739-744
  6. ↑ Figueroa ME, Abdel-Wahab O, Lu C et al. Leukemic IDH1 and IDH2 mutations result in a hypermethylation phenotype, disrupt TET2 function, and impair hematopoietic differentiation, Cancer Cell, 2010;18:553-567
  7. ↑ Ward PS, Patel J, Wise DR et al. The common feature of leukemia-associated IDH1 and IDH2 mutations is a neomorphic enzyme activity converting alpha-ketoglutarate to 2-hydroxyglutarate, Cancer Cell, 2010;17:225-234
  8. ↑ Popovici-Muller J, Lemieux RM, Artin E et al. Discovery of AG-120 (ivosidenib): a first-in-class mutant IDH1 inhibitor for the treatment of IDH1 mutant cancers, ACS Med Chem Lett, 2018;9:300-305
  9. ↑ DiNardo CD, Stein EM, de Botton S et al. Durable remissions with ivosidenib in IDH1-mutated relapsed or refractory AML, N Engl J Med, 2018;378:2386-2398
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