Pseudouridine synthase

ARNt pseudouridine38-40 synthase
Données clés
N° EC EC 5.4.99.12
N° CAS 61506-89-6
Activité enzymatique
IUBMB Entrée IUBMB
IntEnz Vue IntEnz
BRENDA Entrée BRENDA
KEGG Entrée KEGG
MetaCyc Voie métabolique
PRIAM Profil
PDB RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum

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Les pseudouridine synthases sont une famille d'isomérases qui catalysent les réactions :

résidu d'uridine d'ARN ribosomique   {\displaystyle \rightleftharpoons }   résidu de pseudouridine d'ARN ribosomique ;
résidu d'uridine d'ARN de transfert   {\displaystyle \rightleftharpoons }   résidu de pseudouridine d'ARN de transfert.

Par exemple, l’ARNt pseudouridine synthase I (TruA), ou ARNt pseudouridine38-40 synthase (EC 5.4.99.12), isomérise l'uridine en pseudouridine en position 38, 39 et 40 d'à peu près tous les ARN de transfert[1].

Il existe une grande variété de pseudouridine synthases, qui se distinguent par la nature de l'ARN traité et par la position et le nombre de résidus d'uridine isomérisés :

Enzyme N° EC
ARNt pseudouridine38-40 synthase EC 5.4.99.12
ARNr 16S pseudouridine516 synthase EC 5.4.99.19
ARNr 23S pseudouridine2457 synthase EC 5.4.99.20
ARNr 23S pseudouridine2604 synthase EC 5.4.99.21
ARNr 23S pseudouridine2605 synthase EC 5.4.99.22
ARNr 23S pseudouridine1911/1915/1917 synthase EC 5.4.99.23
ARNr 23S pseudouridine955/2504/2580 synthase EC 5.4.99.24
ARNt pseudouridine55 synthase EC 5.4.99.25
ARNt pseudouridine65 synthase EC 5.4.99.26
ARNt pseudouridine13 synthase EC 5.4.99.27
ARNt pseudouridine32 synthase EC 5.4.99.28
ARNr 23S pseudouridine746 synthase EC 5.4.99.29
ARNt pseudouridine31 synthase EC 5.4.99.42
ARNr 21S pseudouridine2819 synthase EC 5.4.99.43
ARNt mitochondrial pseudouridine27/28 synthase EC 5.4.99.44
ARNt pseudouridine38/39 synthase EC 5.4.99.45

Notes et références

  1. (en) Sun Hur et Robert M. Stroud, « How U38, 39, and 40 of Many tRNAs Become the Targets for Pseudouridylation by TruA », Molecular Cell, vol. 26, no 2,‎ , p. 189–203 (PMID 17466622, PMCID 3562137, DOI 10.1016/j.molcel.2007.02.027, lire en ligne)
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