SnoN

SKIL
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue: PDBe RCSB Identifiants PDB 3EQ5
Identifiants
Aliases	SKIL, La protéine SnoN
IDs externes	OMIM: 165340 MGI: 106203 HomoloGene: 3948 GeneCards: SKIL
Position du gène (Homme) Chr. Chromosome 3 humain[1] Locus 3q26.2 Début 170,357,678 bp[1] Fin 170,396,835 bp[1]
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 3 (souris)[2] Locus 3 A3|3 15.12 cM Début 31,149,207 bp[2] Fin 31,176,726 bp[2]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans tendon of biceps brachii mucosa of paranasal sinus muqueuse jéjunale tendon calcanéen Skeletal muscle tissue of biceps brachii pleura viscéral epithelium of nasopharynx epithelium of colon cellule endothéliale artère temporale superficielle Fortement exprimé dans molaire cumulus cell artère carotide externe glande pinéale tunica media of zone of aorta corps ciliaire corps du fémur ganglion mésentérique artère carotide interne cordon ombilical Plus de données d'expression de référence BioGPS Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology Fonction moléculaire liaison ADN transcription corepressor activity protein domain specific binding RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific liaison protéique SMAD binding liaison de chromatine DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific liaison de complexe macromoléculaire Composant cellulaire cytoplasme PML body nucléoplasme Acrosome noyau complexe macromoléculaire Processus biologique positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors response to cytokine lymphocyte homeostasis response to antibiotic negative regulation of transcription by RNA polymerase II blastocyst formation positive regulation of axonogenesis protein homotrimerization lens fiber cell differentiation positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage spermatogenèse protein heterotrimerization response to growth factor skeletal muscle tissue development negative regulation of BMP signaling pathway transforming growth factor beta receptor signaling pathway negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway développement d'un neurone negative regulation of cell differentiation Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 6498 20482 Ensembl ENSG00000136603 ENSMUSG00000027660 UniProt P12757 Q60665 RefSeq (mRNA) NM_001145097 NM_001145098 NM_001248008 NM_005414 NM_001039090 NM_001271772 NM_011386 NM_001398558 NM_001398559 NM_001398560 RefSeq (protéine) NP_001138569 NP_001138570 NP_001234937 NP_005405 NP_001034179 NP_001258701 NP_035516 NP_001385487 NP_001385488 NP_001385489 Localisation (UCSC) Chr 3: 170.36 – 170.4 Mb Chr 3: 31.15 – 31.18 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
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La SnoN est une protéine. Son gène est le SKIL situé sur le chromosome 3 humain.

L’équilibre dans la régulation de la voie de signalisation de la cytokine TGF-β (en) est un facteur important de plusieurs pathologies. La surexpression tout comme la diminution de l’activité des protéines Ski et SnoN sont associés à la pathogenèse de ces maladies. Il est donc important de conserver un équilibre étroit dans la régulation de ces deux corépresseurs.

Le gène de la protéine SnoN est localisé sur le chromosome 3 humain en position 3q26. L’épissage alternatif de ce gène, le gène Sno, permet la production de cette protéine d’une longueur de 684 acides aminés et d’environ 80 kilodaltons. En plus d’être produite chez l’humain, la protéine SnoN est aussi produite chez le Gallus gallus domesticus, la souris, le Poisson zèbre, le Xenopus et le tilapia.

La protéine SnoN fait partie de la famille de protéines Ski, qui est composée des protéines v-Ski (protéine virale), c-Ski (protéine humaine), c-SnoN, SnoN2, SnoA et SnoI.

Dans leur région N-terminale, toutes ces protéines possèdent un domaine d’homologie, nommé Ski, d’environ 270 acides aminés. Celui-est hautement conservé et inclut le domaine SAND (nommé en l’honneur d’un motif retrouvé aussi chez les protéines nucléaires Sp100, AIRE-1, Nuc/P41/75 et DEAF-1). Les résidus Cys247, Cys250, His262 et His264 du domaine SAND sont présents chez toutes les protéines de la famille et sont responsables de la stabilité de ces mêmes protéines. Le domaine SAND est aussi le domaine qui interagit avec la protéine co-Smad-4 détaillé plus loin. L’interaction directe de SnoN avec co-Smad-4 se fait via les résidus Trp274, Thr271, et Cys272 du domaine SAND. Finalement, le domaine d’homologie de la région C-terminale des protéines c-Ski, c-SnoN et SnoN2 leur permet de s'homo et/ou de s'hétéro-dimériser.

La fonction principale de la protéine SnoN, en association avec la protéine SKI, est de réguler négativement la voie de signalisation TGF-β. En effet, Ski et SnoN sont deux corépresseurs des Smad-2 et 3 et co-Smad-4.

Le TGF-β (en) est sécrété en situation de stress ou dans un contexte inflammatoire par les lymphocytes, les mastocytes et les macrophages. Le TGF-β est aussi sécrété par les plaquettes.

Le TGF-β se lie à son récepteur sur la cellule cible. Le récepteur du TGF-β est un récepteur Sérine/Thréonine kinase de type II. À la suite de la liaison du TGF-β, le récepteur de type II recrute par phosphorylation un autre récepteur Sérine/Thréonine kinase, mais de type I cette fois. Le récepteur type I recruté se dimérise avec le récepteur de type II et phosphoryle les protéines Smad-2 et Smad-3. Ces deux effecteurs se dimérisent pour former un complexe avec la protéine co-Smad-4 qui est ensuite transloqué dans le noyau. Le facteur de transcription TFE-3 est présent dans le complexe qui se lie à l’ADN. Le complexe des Smads se lie sur le motif SBE de l’ADN, tandis que le facteur de transcription TFE-3 se lie au motif E-box de l’ADN.

Les gènes transcrits par la voie de signalisation TGF-β activent la dégradation protéasomale de Ski/SnoN via les ubiquitines ligases Anaphase Promoting Complex (APC) et Smurf2. L’ubiquitination se produit sur les résidus Lys440, Lys446, Lys 449.

Avant tout, Ski et SnoN s’associent à différents co-répresseurs, soit N-CoR, mSin-3, MeCP2, HIPK2 et HDAC. Ensuite, le groupe de co-répresseurs déstabilise le complexe des Smads lié à l’ADN en s’insérant entre les Smads.

Lorsque la voie de signalisation TGF-β est induite, il y a tout d’abord activation des ubiquitines ligases APC et Smurf2 et dégradation de Ski/SnoN via la voie du protéasome. Cependant, si Ski/SnoN est surexprimé, il y aura dégradation insuffisante de Ski/SnoN et excès de ces protéines dans le noyau.

Donc, le complexe des Smads sera inhibé et il n’y aura plus de production des protéines ciblées par les facteurs de transcription activés par le TGF-β. Ainsi, il n’y aura pas d’activation des protéines P21 et P15 et il n’y aura pas d’arrêt du cycle cellulaire en phase G1. Ce qui veut dire que le cycle cellulaire se poursuivra en phase S, G2 et M sans que la cellule ne se soit différentiée suffisamment et il y aura promotion de l’apparition de cellule cancéreuse. Effectivement, la surexpression de la protéine SnoN a été observée dans les cas de mélanomes, de cancer du sein, de la prostate, du poumon, de l’œsophage et de l’estomac.

La diminution de l’activité de Ski/SnoN est un facteur impliqué dans la pathogenèse de la fibrose rénale^[5]. Puisque son activité est diminuée, la voie de signalisation induite par TGF-β est amplifiée.

• (en) L. Kunxin, « Ski and SnoN: negative regulators of TGF-β signaling », dans Oncogene and cell proliferation, vol. 14, p. 65-70, 2004.
• (en) L. Xuedong et al., « Ski/Sno and TGF-β signaling », dans Cytokine and growth factor reviews, vol. 12, p. 1-8, 2001 DOI 10.1016/S1359-6101(00)00031-9.
• (en) M. Kohei et al., « Regulation of TGF- β signaling and its roles in progression of tumors », dans Cancer Sci (en), vol. 94, n^o 3, p. 230-234, 2003.
• (en) D. Javelaud, « Crosstalk mechanism between the mitogen-activated protein kinase pathways and Smad signaling downstream of TGF-β: implcations for carcinogenesis », dans Oncogene, vol. 24, p. 5742-5750, 2005 DOI 10.1038/sj.onc.1208928.
• (en) Y. Junwei et al., « Downregulation of Smad transcriptional Corepressors SnoN and Ski in the fibrotic Kidney: An amplification mechanism for TGF- β1 signaling », 2003.
• (en) J. J. Wilson et al., « Crystal structure of the Dachshund Homology Domain of Human SKI », dans Structure (en), vol. 12, p. 785-792, 2004.

• Voie de signalisation TGF-β
• Signalisation intracellulaire, prolifération et différenciation

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