CYC1
CYC1 | |
![]() | |
Azonosítók | |
Jel | CYC1, MC3DN6, UQCR4 |
Entrez | 1537} |
OMIM | 123980 |
UniProt | P08574 |
Egyéb adatok | |
Lokusz | 8. krom. q24.3 |
A citokróm c1 mitokondriális hemoprotein (CYC1), más néven UQCR4, MC3DN6, III. komplex 4. alegység, citokróm b-c1 komplex 4. alegység vagy ubikinol-citokróm c-reduktáz komplex citokróm c1 alegység a CYC1 gén által kódolt fehérje. Ez a ubikinol-citokróm c-reduktáz (III. komplex) légzési alegysége, mely a mitokondrium belső membránjában van, és az elektrontranszportlánc része. E gén mutációi magi 6. típusú mitokondriális III. komplex-hiányt okozhatnak.[1][2][3]
Szerkezet
A CYC1 a 8. kromoszóma q karjának a 24.3 sávján van, és 8 exonja van.[1] A CYC1 gén 13,5 kDa-os, 130 aminosavas fehérjét kódol.[4][5] A CYC1 a citokróm c-család tagja. Hemkötő foszfoprotein, az ubikinol-citokróm c-reduktáz része. α-hélix, jelzőpeptid és transzmembrán doménből áll, és 9 α-hélixe, 5 β-redője és 3 gyűrűje van. A transzmembrán fehérje a belső mitokondriális membránon egyszer halad át, a fehérje nagy része a mitokondriális intermembrán térben van. A CYC1 kovalens hemkötő helyekkel rendelkezik a 121. és 124. helyen, valamint axiális vaskötő helyekkel a 125. és 244. helyeken.[2][3]
Funkció
A CYC1 a belső mitokondriális membránban lévő fehérjét kódol, mely az ubikinol-citokróm c-reduktáz része. E fehérje, a CYC1 légzési fehérjealegység, melynek fontos szerepe van a mitokondriális légzésben, mivel elektronokat szállít a Rieske-vas-kén fehérjétől a citokróm c felé.[1][2][3]
Fajok
A CYC1 állandó humán gén, mely megtalálható a csimpánzban, Rhesus-makákóban, kutyában, marhában, egérben, patkányban, zebradánióban, Drosophila melanogasterben, szúnyogban, Caenorhabditis elegansban, élesztőgombában, K. lactisban, E. gossypiiben, S. pombében, N. crassában, A. thalianában, rizsben és békában.[6] 137 fajról ismert, hogy van benne CYC1-ortológ.[7]
Klinikai jelentőség
A CYC1 mutációi összefüggésben vannak a magi 6. típusú mitokondriális III. komplex-hiánnyal. Ez a mitokondriális légzési lánc autoszomális recesszív rendellenessége, mely az ubikinol-citokróm c-reduktáz hibájából ered, és csökkent III. komplex-aktivitáshoz vezet. Tünetei – jellemzően laktacidózis, ketoacidózis, inzulinreszponzív hiperglikémia, májdiszfunkció, enkefalopátia és megfelelő fertőzések – jellemzően a gyermekkor elején jelennek meg , de a pszichomotoros fejlődés megfelelő maradhat. Patogén mutációk például a c.288G>T, a p. Trp96Cys és a c.643C>T p. Leu215Phe.[2][3][8]
Interakciók
A CYC1 78 fehérje-fehérje kölcsönhatása ismert, ebből 72 kokomplex.[9] A CYC1 az ubikinol-citokróm c-reduktáz (b1-c komplex) 11 alegységének egyike a citokróm b, a citokróm c1, az UQCRFS1, a fő fehérjék, az UQCRC1 és UQCRC2 és a kis molekulatömegű fehérjék, az UQCRH, az UQCRB, az UQCRQ, az UQCR10 és az UQCR11, valamint egy UQCRFS1-leválási termék mellett.[2][3] Ezenkívül a CCP1, a CDKA-1 és a CDKB1-1 is kölcsönhatnak a CYC1-gyel.[9]
Jegyzetek
- ↑ a b c Entrez Gene: CYC1 cytochrome c-1
- ↑ a b c d e CYC1 - Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial precursor - Homo sapiens (Human) - CYC1 gene & protein (angol nyelven). www.uniprot.org . (Hozzáférés: 2018. július 31.)
- ↑ a b c d e (2017. január 1.) „UniProt: the universal protein knowledgebase”. Nucleic Acids Research 45 (D1), D158–D169. o. DOI:10.1093/nar/gkw1099. PMID 27899622.
- ↑ Yao, Daniel: Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB) —— Protein Information. amino.heartproteome.org . [2018. augusztus 1-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2018. július 31.)
- ↑ (2013. október 1.) „Integration of cardiac proteome biology and medicine by a specialized knowledgebase”. Circulation Research 113 (9), 1043–53. o. DOI:10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMID 23965338.
- ↑ CYC1 cytochrome c1 [Homo sapiens (human)]. National Center for Biotechnology Information . U.S. National Library of Medicine. (Hozzáférés: 2016. július 29.)
- ↑ ortholog_gene_1537[group]. National Center for Biotechnology Information . U.S. National Library of Medicine. (Hozzáférés: 2016. július 29.)
- ↑ (2013. augusztus 1.) „Mutations in CYC1, encoding cytochrome c1 subunit of respiratory chain complex III, cause insulin-responsive hyperglycemia”. American Journal of Human Genetics 93 (2), 384–389. o. DOI:10.1016/j.ajhg.2013.06.015. PMID 23910460.
- ↑ a b 81 binary interactions found for search term CYC1. IntAct Molecular Interaction Database. EMBL-EBI. (Hozzáférés: 2018. augusztus 25.)
További információk
- Humán CYC1 genombeli helye és CYC1 géninformációs lap a UCSC Genome Browserben.
- (2006. február 1.) „Role of HIV Vpr as a regulator of apoptosis and an effector on bystander cells”. Molecules and Cells 21 (1), 7–20. o. PMID 16511342.
- (1989. január 1.) „Structural organization of the human mitochondrial cytochrome c1 gene”. The Journal of Biological Chemistry 264 (3), 1368–74. o. DOI:10.1016/S0021-9258(18)94196-7. PMID 2536365.
- (1988. április 1.) „Nucleotide sequence of a cDNA encoding the precursor to human cytochrome c1”. Nucleic Acids Research 16 (8), 3577. o. DOI:10.1093/nar/16.8.3577. PMID 2836796.
- (1988. június 1.) „Construction of a human cytochrome c gene and its functional expression in Saccharomyces cerevisiae”. Journal of Biochemistry 103 (6), 954–61. o. DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a122393. PMID 2844747.
- (1985. december 1.) „Novel purification of cytochrome c1 from mitochondrial Complex III. Reconstitution of antimycin-insensitive electron transfer with the iron-sulfur protein and cytochrome c1”. The Journal of Biological Chemistry 260 (28), 15075–80. o. DOI:10.1016/S0021-9258(18)95704-2. PMID 2999105.
- (1987. május 1.) „Isolation of a cDNA clone for human cytochrome c1 from a lambda gt11 expression library”. Biochemical and Biophysical Research Communications 145 (1), 34–9. o. DOI:10.1016/0006-291X(87)91283-6. PMID 3036122.
- (1981. május 1.) „Electrostatic interaction of cytochrome c with cytochrome c1 and cytochrome oxidase”. The Journal of Biological Chemistry 256 (10), 4984–90. o. DOI:10.1016/S0021-9258(19)69355-5. PMID 6262312.
- (1994. január 1.) „Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides”. Gene 138 (1–2), 171–4. o. DOI:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- (1994. január 1.) „Assignment of the gene for the cytochrome c1 subunit of the mitochondrial cytochrome bc1 complex (CYC1) to human chromosome 8q24.3”. Genomics 19 (2), 400–1. o. DOI:10.1006/geno.1994.1084. PMID 8188279.
- (1997. október 1.) „Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library”. Gene 200 (1–2), 149–56. o. DOI:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- (1999. június 1.) „A mitochondrial cytochrome b mutation but no mutations of nuclearly encoded subunits in ubiquinol cytochrome c reductase (complex III) deficiency”. Human Genetics 104 (6), 460–6. o. DOI:10.1007/s004390050988. PMID 10453733.
- (2001. február 1.) „Control of mitochondrial membrane permeabilization by adenine nucleotide translocator interacting with HIV-1 viral protein rR and Bcl-2”. The Journal of Experimental Medicine 193 (4), 509–19. o. DOI:10.1084/jem.193.4.509. PMID 11181702.
- (2002. március 1.) „Cytochrome c release upon Fas receptor activation depends on translocation of full-length bid and the induction of the mitochondrial permeability transition”. The Journal of Biological Chemistry 277 (12), 10073–82. o. DOI:10.1074/jbc.M111350200. PMID 11790791.
- (2002. október 1.) „HIV-1 Vpr induces apoptosis through caspase 9 in T cells and peripheral blood mononuclear cells”. The Journal of Biological Chemistry 277 (40), 37820–31. o. DOI:10.1074/jbc.M205313200. PMID 12095993.
- (2002. július 1.) „Adenovirus encoding HIV-1 Vpr activates caspase 9 and induces apoptotic cell death in both p53 positive and negative human tumor cell lines”. Oncogene 21 (30), 4613–25. o. DOI:10.1038/sj.onc.1205549. PMID 12096338.
- (2003. május 1.) „The mitochondriotoxic domain of Vpr determines HIV-1 virulence”. The Journal of Clinical Investigation 111 (10), 1455–7. o. DOI:10.1172/JCI18609. PMID 12750393.
- (2003. május 1.) „Vpr R77Q is associated with long-term nonprogressive HIV infection and impaired induction of apoptosis”. The Journal of Clinical Investigation 111 (10), 1547–54. o. DOI:10.1172/JCI16233. PMID 12750404.
- (2003. június 1.) „Involvement of cytochrome c release and caspase-3 activation in the oxidative stress-induced apoptosis in human tendon fibroblasts”. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research 1641 (1), 35–41. o. DOI:10.1016/S0167-4889(03)00047-8. PMID 12788227.
- (2004. április 1.) „Critical upstream signals of cytochrome C release induced by a novel Bcl-2 inhibitor”. The Journal of Biological Chemistry 279 (18), 19133–40. o. DOI:10.1074/jbc.M400295200. PMID 14966123.