CDC40

CDC40
Identificadores
Nomes alternativosCDC40
IDs externosOMIM: 605585 HomoloGene: 5716 GeneCards: CDC40
Ontologia genética
Função molecular• GO:0001948, GO:0016582 ligação a proteínas plasmáticas
• RNA binding
Componente celular• catalytic step 2 spliceosome
• spliceosomal complex
• cariolinfa
• núcleo celular
• U2-type catalytic step 2 spliceosome
• nuclear speck
Processo biológico• mRNA splicing, via spliceosome
• termination of RNA polymerase II transcription
• mRNA processing
• mRNA export from nucleus
• mRNA 3'-end processing
• Splicing
• RNA export from nucleus
Sources:Amigo / QuickGO
Padrão de expressão RNA


Mais dados de referência de expressão
Ortólogos
EspécieHumanoRato
Entrez

51362

n/a

Ensembl

ENSG00000168438

n/a

UniProt

O60508

n/a

RefSeq (mRNA)

NM_015891

n/a

RefSeq (proteína)

NP_056975

n/a

Localização (UCSC)n/an/a
Pesquisa PubMed[1]n/a
Wikidata
Ver/Editar Humano

O fator de pré-processamento de mRNA 17 é uma proteína que em humanos é codificada pelo gene CDC40.[2][3][4]

A junção pré-mRNA ocorre em duas etapas de transesterificação sequenciais. A proteína codificada por este gene é considerada essencial para a etapa catalítica II no processo de emenda do pré-mRNA. É encontrado no spliceossomo e contém sete repetições WD, que funcionam nas interações proteína-proteína.[5][4]

Referências

  1. ↑ «Human PubMed Reference:» 
  2. ↑ Ben Yehuda S, Dix I, Russell CS, Levy S, Beggs JD, Kupiec M (outubro de 1998). «Identification and functional analysis of hPRP17, the human homologue of the PRP17/CDC40 yeast gene involved in splicing and cell cycle control». RNA. 4 (10): 1304–12. PMC 1369702Acessível livremente. PMID 9769104. doi:10.1017/S1355838298980712 
  3. ↑ Lindsey LA, Garcia-Blanco MA (janeiro de 1999). «Functional conservation of the human homolog of the yeast pre-mRNA splicing factor Prp17p». J Biol Chem. 273 (49): 32771–5. PMID 9830021. doi:10.1074/jbc.273.49.32771 
  4. ↑ a b «Entrez Gene: CDC40 cell division cycle 40 homolog (S. cerevisiae)» 
  5. ↑ «Gabriela Pintar de Oliveira Análise da participação das células». dokumen.tips. Consultado em 28 de agosto de 2020 

Leitura adicional

  • Wong WT, Schumacher C, Salcini AE, et al. (1995). «A protein-binding domain, EH, identified in the receptor tyrosine kinase substrate Eps15 and conserved in evolution». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92 (21): 9530–4. PMC 40835Acessível livremente. PMID 7568168. doi:10.1073/pnas.92.21.9530 
  • Maruyama K, Sugano S (1994). «Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides». Gene. 138 (1–2): 171–4. PMID 8125298. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8 
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). «Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery». Genome Res. 6 (9): 791–806. PMID 8889548. doi:10.1101/gr.6.9.791 
  • Salcini AE, Confalonieri S, Doria M, et al. (1997). «Binding specificity and in vivo targets of the EH domain, a novel protein-protein interaction module». Genes Dev. 11 (17): 2239–49. PMC 275390Acessível livremente. PMID 9303539. doi:10.1101/gad.11.17.2239 
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). «Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library». Gene. 200 (1–2): 149–56. PMID 9373149. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3 
  • Zhou Z, Reed R (1998). «Human homologs of yeast prp16 and prp17 reveal conservation of the mechanism for catalytic step II of pre-mRNA splicing». EMBO J. 17 (7): 2095–106. PMC 1170554Acessível livremente. PMID 9524131. doi:10.1093/emboj/17.7.2095 
  • Ben-Yehuda S, Dix I, Russell CS, et al. (2001). «Genetic and physical interactions between factors involved in both cell cycle progression and pre-mRNA splicing in Saccharomyces cerevisiae». Genetics. 156 (4): 1503–17. PMC 1461362Acessível livremente. PMID 11102353 
  • Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, et al. (2002). «Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis». RNA. 8 (4): 426–39. PMC 1370266Acessível livremente. PMID 11991638. doi:10.1017/S1355838202021088 
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. PMC 139241Acessível livremente. PMID 12477932. doi:10.1073/pnas.242603899 
  • Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, et al. (2003). «The DNA sequence and analysis of human chromosome 6». Nature. 425 (6960): 805–11. PMID 14574404. doi:10.1038/nature02055 
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. PMID 14702039. doi:10.1038/ng1285 
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. PMC 528928Acessível livremente. PMID 15489334. doi:10.1101/gr.2596504 
  • Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, et al. (2005). «High-throughput mapping of a dynamic signaling network in mammalian cells». Science. 307 (5715): 1621–5. PMID 15761153. doi:10.1126/science.1105776 
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). «Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks». Cell. 127 (3): 635–48. PMID 17081983. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026 
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