CLDN18

CLDN18
Идентификаторы
ПсевдонимыCLDN18, SFTA5, SFTPJ, claudin 18
Внешние IDOMIM: 609210 MGI: 1929209 HomoloGene: 9489 GeneCards: CLDN18
Расположение гена (человек)
3-я хромосома человека
Хр.3-я хромосома человека[1]
3-я хромосома человека
Расположение в геноме CLDN18
Расположение в геноме CLDN18
Локус3q22.3Начало137,998,735 bp[1]
Конец138,033,655 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
9-я хромосома мыши
Хр.9-я хромосома мыши[2]
9-я хромосома мыши
Расположение в геноме CLDN18
Расположение в геноме CLDN18
Локус9|9 E3.3Начало99,571,514 bp[2]
Конец99,599,320 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • lower lobe of lung

  • upper lobe of lung

  • upper lobe of left lung

  • body of stomach

  • visceral pleura

  • fundus
Наибольшая экспрессия в
  • mucous cell of stomach

  • right lung lobe

  • epithelium of stomach

  • pyloric antrum

  • left lung lobe
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • structural molecule activity
  • связывание похожих белков
Компонент клетки
  • часть мембраны
  • межклеточные контакты
  • клеточная мембрана
  • мембрана
  • bicellular tight junction
Биологический процесс
  • negative regulation of protein localization to nucleus
  • TNFSF11-mediated signaling pathway
  • calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules
  • digestive tract development
  • negative regulation of osteoclast development
  • negative regulation of bone resorption
  • response to ethanol
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

51208

56492

Ensembl

ENSG00000066405

ENSMUSG00000032473

UniProt

P56856

P56857

RefSeq (мРНК)

NM_016369
NM_001002026

NM_001194921
NM_001194922
NM_001194923
NM_019815

RefSeq (белок)

NP_001002026
NP_057453

NP_001181850
NP_001181851
NP_001181852
NP_062789

Локус (UCSC)Chr 3: 138 – 138.03 MbChr 9: 99.57 – 99.6 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Клаудин 18 (англ. Claudin-18) — мембранный белок семейства клаудинов, продукт гена CLDN18.

Функции

Клаудины участвуют в образовании плотных контактов между эпителиальными клетками.[5][6], занимая наиболее апикальную позицию. CLDN18 экспрессируется на эпителиальных клетках лёгких и желудка. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию двух изоформ. Изоформа 1 экспрессирована на пневмоцитах (главным образом типа I), а изоформа 2 — в эпителии желудка.

Клиническое значение

Изоформа 2 (Клаудин 18.2) сильно экспрессируется клетками рака желудка[7]. Антитела к клаудину 18.2 (IMAB362, или Zolbetuximab) исследуются как потенциальное терапевтическое средство при раке желудка.[7]

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000066405 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032473 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Niimi T., Nagashima K., Ward J.M. et al. claudin-18, a Novel Downstream Target Gene for the T/EBP/NKX2.1 Homeodomain Transcription Factor, Encodes Lung- and Stomach-Specific Isoforms through Alternative Splicing (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2001. — Vol. 21, no. 21. — P. 7380—7390. — doi:10.1128/MCB.21.21.7380-7390.2001. — PMID 11585919. — PMC 99911.
  6. ↑ Entrez Gene: CLDN18 claudin 18  (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
  7. ↑ 1 2 Antibody Shines in Advanced Gastric Cancer - IMAB362 leads to longer remission, better survival. June 2016  (неопр.). Дата обращения: 2 ноября 2018. Архивировано 3 апреля 2018 года.

Литература

  • Kniesel U., Wolburg H. Tight junctions of the blood–brain barrier. (неопр.) // Cell. Mol. Neurobiol.[англ.]. — Springer, 2000. — Т. 20, № 1. — С. 57—76. — doi:10.1023/A:1006995910836. — PMID 10690502.
  • Heiskala M., Peterson P.A., Yang Y. The roles of claudin superfamily proteins in paracellular transport. (англ.) // Traffic : journal. — 2001. — Vol. 2, no. 2. — P. 93—8. — doi:10.1034/j.1600-0854.2001.020203.x. — PMID 11247307.
  • Tsukita S., Furuse M., Itoh M. Multifunctional strands in tight junctions. (англ.) // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. : journal. — 2001. — Vol. 2, no. 4. — P. 285—293. — doi:10.1038/35067088. — PMID 11283726.
  • Tsukita S., Furuse M. Claudin-based barrier in simple and stratified cellular sheets. (англ.) // Curr. Opin. Cell Biol.[англ.] : journal. — Elsevier, 2003. — Vol. 14, no. 5. — P. 531—536. — doi:10.1016/S0955-0674(02)00362-9. — PMID 12231346.
  • González-Mariscal L., Betanzos A., Nava P., Jaramillo B.E. Tight junction proteins. (неопр.) // Prog. Biophys. Mol. Biol.. — 2003. — Т. 81, № 1. — С. 1—44. — doi:10.1016/S0079-6107(02)00037-8. — PMID 12475568.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E. et al. The Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), a Large-Scale Effort to Identify Novel Human Secreted and Transmembrane Proteins: A Bioinformatics Assessment (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 10. — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
  • Oh J.H., Yang J.O., Hahn Y. et al. Transcriptome analysis of human gastric cancer (англ.) // Mamm. Genome[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 16, no. 12. — P. 942—954. — doi:10.1007/s00335-005-0075-2. — PMID 16341674.
  • Matsuda Y., Semba S., Ueda J. et al. Gastric and intestinal claudin expression at the invasive front of gastric carcinoma (англ.) // Cancer Sci.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 98, no. 7. — P. 1014—1019. — doi:10.1111/j.1349-7006.2007.00490.x. — PMID 17459057.
  • Liu F., Koval M., Ranganathan S., Fanayan S., Hancock W.S., Lundberg E.K., Beavis R.C., Lane L., Duek P., McQuade L., Kelleher N.L., Baker M.S. A systems proteomics view of the endogenous human claudin protein family (англ.) // J Proteome Res[англ.] : journal. — 2015. — doi:10.1021/acs.jproteome.5b00769. — PMID 26680015.