POLR2H

Полипептид H РНК-полимеразы II (управляемой ДНК)
PDB rendering based on 2f3i.PDB rendering based on 2f3i.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

2F3I

Идентификаторы
Символ POLR2H ; RPABC3; RPB17; RPB8
Внешние ID OMIM: 606023 MGI: 2384309 HomoloGene: 4540 GeneCards: Ген POLR2H
номер EC 2.7.7.6
Функция • RNA polymerase I activity

• RNA polymerase II activity
• RNA polymerase III activity

• DNA binding
Компонент клетки • nucleus

• nucleoplasm
• DNA-directed RNA polymerase II, core complex
• DNA-directed RNA polymerase III complex
• DNA-directed RNA polymerase I complex

• cytosol
Биологический процесс • mRNA splicing, via spliceosome

• DNA repair
• transcription-coupled nucleotide-excision repair
• nucleotide-excision repair
• transcription from RNA polymerase I promoter
• transcription initiation from RNA polymerase I promoter
• transcription elongation from RNA polymerase I promoter
• termination of RNA polymerase I transcription
• transcription from RNA polymerase II promoter
• transcription initiation from RNA polymerase II promoter
• transcription elongation from RNA polymerase II promoter
• 7-methylguanosine mRNA capping
• transcription from RNA polymerase III promoter
• transcription elongation from RNA polymerase III promoter
• termination of RNA polymerase III transcription
• RNA splicing
• gene expression
• viral process
• positive regulation of type I interferon production
• innate immune response

• positive regulation of viral transcription
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 5437 245841
Ensembl ENSG00000163882 ENSMUSG00000021018
UniProt P52434 Q923G2
RefSeq (мРНК) NM_001278698 NM_145632
RefSeq (белок) NP_001265627 NP_663607
Локус (UCSC) Chr 3:
184.08 – 184.09 Mb		 Chr 16:
20.72 – 20.72 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Субъединица RPABC3 ДНК-управляемой РНК-полимеразы I, II и III  — белок, кодируемый у человека геном POLR2H .

Этот ген кодирует одну из важнейших субъединиц РНК-полимеразы II, участвующей совместно с двумя другими эукариотическими ДНК-управляемыми РНК-полимеразами — I и III.[1]

Взаимодействия

POLR2H, как было выявлено, взаимодействует с POLR2C,[2] POLR2G,[2] POLR2A,[2] POLR2B[2] и POLR2E.[2]

Примечания

  1. ↑ Entrez Gene: POLR2H polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide H  (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
  2. ↑ 1 2 3 4 5 Acker, J; de Graaff M; Cheynel I; Khazak V; Kedinger C; Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II subunits (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — UNITED STATES, 1997. — July (vol. 272, no. 27). — P. 16815—16821. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.272.27.16815. — PMID 9201987.

Литература

  • Jeang K.T. Tat, Tat-associated kinase, and transcription. (англ.) // J. Biomed. Sci.[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 5, no. 1. — P. 24—7. — doi:10.1007/BF02253352. — PMID 9570510.
  • Yankulov K., Bentley D. Transcriptional control: Tat cofactors and transcriptional elongation. (англ.) // Curr. Biol. : journal. — 1998. — Vol. 8, no. 13. — P. R447—9. — doi:10.1016/S0960-9822(98)70289-1. — PMID 9651670.
  • Romano G., Kasten M., De Falco G., et al. Regulatory functions of Cdk9 and of cyclin T1 in HIV tat transactivation pathway gene expression. (англ.) // J. Cell. Biochem.[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 75, no. 3. — P. 357—368. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. — PMID 10536359.
  • Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Multiple modes of transcriptional regulation by the HIV-1 Tat transactivator. (англ.) // IUBMB Life : journal. — 2002. — Vol. 51, no. 3. — P. 175—181. — doi:10.1080/152165401753544241. — PMID 11547919.
  • Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. The regulation of HIV-1 transcription: molecular targets for chemotherapeutic intervention. (англ.) // Med Res Rev : journal. — 2007. — Vol. 26, no. 5. — P. 595—625. — doi:10.1002/med.20081. — PMID 16838299.
  • Harrich D., McMillan N., Munoz L., et al. Will diverse Tat interactions lead to novel antiretroviral drug targets? (англ.) // Current drug targets : journal. — 2007. — Vol. 7, no. 12. — P. 1595—1606. — doi:10.2174/138945006779025338. — PMID 17168834.
  • Jang K.L., Collins M.K., Latchman D.S. The human immunodeficiency virus tat protein increases the transcription of human Alu repeated sequences by increasing the activity of the cellular transcription factor TFIIIC. (англ.) // J. Acquir. Immune Defic. Syndr.[англ.] : journal. — 1992. — Vol. 5, no. 11. — P. 1142—1147. — PMID 1403646.
  • Kato H., Sumimoto H., Pognonec P., et al. HIV-1 Tat acts as a processivity factor in vitro in conjunction with cellular elongation factors. (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1992. — Vol. 6, no. 4. — P. 655—666. — doi:10.1101/gad.6.4.655. — PMID 1559613.
  • Southgate C., Zapp M.L., Green M.R. Activation of transcription by HIV-1 Tat protein tethered to nascent RNA through another protein. (англ.) // Nature : journal. — 1990. — Vol. 345, no. 6276. — P. 640—642. — doi:10.1038/345640a0. — PMID 2190099.
  • Freund E., McGuire P.M. Characterization of RNA polymerase type II from human term placenta. (англ.) // J. Cell. Physiol.[англ.] : journal. — 1986. — Vol. 127, no. 3. — P. 432—438. — doi:10.1002/jcp.1041270312. — PMID 3754875.
  • Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor R.B. Specific binding of RNA polymerase II to the human immunodeficiency virus trans-activating region RNA is regulated by cellular cofactors and Tat. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1995. — Vol. 92, no. 16. — P. 7153—7157. — doi:10.1073/pnas.92.16.7153. — PMID 7638159. — PMC 41297.
  • Shpakovski G.V., Acker J., Wintzerith M., et al. Four subunits that are shared by the three classes of RNA polymerase are functionally interchangeable between Homo sapiens and Saccharomyces cerevisiae. (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1995. — Vol. 15, no. 9. — P. 4702—4710. — PMID 7651387. — PMC 230713.
  • Herrmann C.H., Rice A.P. Lentivirus Tat proteins specifically associate with a cellular protein kinase, TAK, that hyperphosphorylates the carboxyl-terminal domain of the large subunit of RNA polymerase II: candidate for a Tat cofactor. (англ.) // J. Virol.[англ.] : journal. — 1995. — Vol. 69, no. 3. — P. 1612—1620. — PMID 7853496. — PMC 188757.
  • McKune K., Moore P.A., Hull M.W., Woychik N.A. Six human RNA polymerase subunits functionally substitute for their yeast counterparts. (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1996. — Vol. 15, no. 12. — P. 6895—6900. — PMID 8524256. — PMC 230944.
  • Keen N.J., Gait M.J., Karn J. Human immunodeficiency virus type-1 Tat is an integral component of the activated transcription-elongation complex. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 6. — P. 2505—2510. — doi:10.1073/pnas.93.6.2505. — PMID 8637904. — PMC 39827.
  • Yang X., Herrmann C.H., Rice A.P. The human immunodeficiency virus Tat proteins specifically associate with TAK in vivo and require the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II for function. (англ.) // J. Virol.[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 70, no. 7. — P. 4576—4584. — PMID 8676484. — PMC 190394.
  • Agostini I., Navarro J.M., Rey F., et al. The human immunodeficiency virus type 1 Vpr transactivator: cooperation with promoter-bound activator domains and binding to TFIIB. (англ.) // J. Mol. Biol.[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 261, no. 5. — P. 599—606. — doi:10.1006/jmbi.1996.0485. — PMID 8800208.
  • Zhou Q., Sharp P.A. Tat-SF1: cofactor for stimulation of transcriptional elongation by HIV-1 Tat. (англ.) // Science : journal. — 1996. — Vol. 274, no. 5287. — P. 605—610. — doi:10.1126/science.274.5287.605. — PMID 8849451.
  • Okamoto H., Sheline C.T., Corden J.L., et al. Trans-activation by human immunodeficiency virus Tat protein requires the C-terminal domain of RNA polymerase II. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 21. — P. 11575—11579. — doi:10.1073/pnas.93.21.11575. — PMID 8876177. — PMC 38099.
  • Chun R.F., Jeang K.T. Requirements for RNA polymerase II carboxyl-terminal domain for activated transcription of human retroviruses human T-cell lymphotropic virus I and HIV-1. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1996. — Vol. 271, no. 44. — P. 27888—27894. — doi:10.1074/jbc.271.44.27888. — PMID 8910388.