BAR domen

BAR domain
Struktura amfifizinskog BAR.[1]
Identifikatori
SimbolBAR
PfamPF03114
InterProIPR004148
SMARTSM00721
PROSITEPDOC51021
SCOP1uru
SUPERFAMILY1uru
CDDcd07307
Dostupne proteinske strukture:
Pfamstructures
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary

BAR (Bin–Amfifizin–Rvs) domeni su visoko konzervirani proteinski dimerizacioni domeni koji se javljaju u mnogim proteinima, i koji učestvuju u membranskoj dinamici ćelije. BAR domen ima oblik banane i vezuje se za membranu putem svoje konkavne površine. On ima sposobnost detektovanja membranske zakrivljenosti putem preferentnog vezivanja za zakrivljene membrane.

BAR domeni se javljaju u kombinaciji sa drugim domenima

Mnogi proteini BAR familije sadrže alternativne domene lipidne specifičnosti koji pomažu u selektivnom vezivanju određenih membranskih sekcija. Neki takođe imaju SH3 domene za koje se vezuje dinamin, te su proteini poput amfifizina i endofilina implicirani u orkestraciju odvajanja vezikula.

Ljudski proteini koji sadrže ovaj domen

AMPH; ARHGAP17; BIN1; BIN2; BIN3; DNMBP; GMIP; RICH2; SH3BP1; SH3GL1; SH3GL2; SH3GL3; SH3GLB1; SH3GLB2;

Reference

  1. ^ Peter BJ; Kent HM; Mills IG; et al. (2004). „BAR domains as sensors of membrane curvature: the amphiphysin BAR structure”. Science. 303 (5657): 495—9. PMID 14645856. doi:10.1126/science.1092586. 

Literatura

  • Leventis PA, Chow BM, Stewart BA, Iyengar B, Campos AR, Boulianne GL (2001). „Drosophila Amphiphysin is a post-synaptic protein required for normal locomotion but not endocytosis”. Traffic. 2 (11): 839—50. PMID 11733051. doi:10.1034/j.1600-0854.2001.21113.x. 
  • Zhang B, Zelhof AC (2002). „Amphiphysins: raising the BAR for synaptic vesicle recycling and membrane dynamics. Bin-Amphiphysin-Rvsp”. Traffic. 3 (7): 452—60. PMID 12047553. doi:10.1034/j.1600-0854.2002.30702.x. 
  • Zelhof AC, Bao H, Hardy RW, Razzaq A, Zhang B, Doe CQ (2001). „Drosophila Amphiphysin is implicated in protein localization and membrane morphogenesis but not in synaptic vesicle endocytosis”. Development. 128 (24): 5005—15. PMID 11748137. 
  • Mathew D, Popescu A, Budnik V (2003). „Drosophila amphiphysin functions during synaptic Fasciclin II membrane cycling”. J. Neurosci. 23 (33): 10710—6. PMID 14627656. 
  • Peter BJ; Kent HM; Mills IG; et al. (2004). „BAR domains as sensors of membrane curvature: the amphiphysin BAR structure”. Science. 303 (5657): 495—9. PMID 14645856. doi:10.1126/science.1092586. 
  • Weissenhorn W (2005). „Crystal structure of the endophilin-A1 BAR domain”. J. Mol. Biol. 351 (3): 653—61. PMID 16023669. doi:10.1016/j.jmb.2005.06.013. 
  • Gallop JL; Jao CC; Kent HM; et al. (2006). „Mechanism of endophilin N-BAR domain-mediated membrane curvature”. EMBO J. 25 (12): 2898—910. PMC 1500843 Слободан приступ. PMID 16763559. doi:10.1038/sj.emboj.7601174. 
  • Masuda M; Takeda S; Sone M; et al. (2006). „Endophilin BAR domain drives membrane curvature by two newly identified structure-based mechanisms”. EMBO J. 25 (12): 2889—97. PMC 1500852 Слободан приступ. PMID 16763557. doi:10.1038/sj.emboj.7601176. 
  • Frost A; Perera R; Roux A; et al. (2008). „Structural basis of membrane invagination by F-BAR domains”. Cell. 132 (5): 807—17. PMC 2384079 Слободан приступ. PMID 18329367. doi:10.1016/j.cell.2007.12.041. 

Vidi još

  • Epsin

Spoljašnje veze

  • Structure of a BAR module
  • п
  • р
  • у
BAR • BIR • BZIP • CARD • C1 • C2 • DED • ENTH • FYVE • HEAT • Kringl • LIM • LRR • NACHT • PAS • PDZ • Pirin • PH • PX • SH2 • SH3 • SUN • TRIO • WD40 • Cinkov prst