Каспаза 9

CASP9
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4RHW, 1JXQ, 1NW9, 2AR9, 3D9T, 3V3K, 3YGS

Ідентифікатори
Символи CASP9, APAF-3, APAF3, ICE-LAP6, MCH6, PPP1R56, caspase 9
Зовнішні ІД OMIM: 602234 MGI: 1277950 HomoloGene: 31024 GeneCards: CASP9
Реагує на сполуку
emricasan[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• cysteine-type peptidase activity
• SH3 domain binding
• GO:0070122 peptidase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• GO:0010577 enzyme activator activity
• hydrolase activity
• protein kinase binding
• cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis
• cysteine-type endopeptidase activity
• identical protein binding
• cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway
• cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма
• мітохондрія
• apoptosome
• клітинне ядро
• GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

• regulation of apoptotic process
• response to estradiol
• GO:1904578 response to organic cyclic compound
• signal transduction in response to DNA damage
• cellular response to UV
• GO:1904576 response to antibiotic
• GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound
• GO:0010260 старіння людини
• Тромбоцитопоез
• glial cell apoptotic process
• cellular response to dexamethasone stimulus
• протеоліз
• cellular response to DNA damage stimulus
• response to lipopolysaccharide
• positive regulation of neuron apoptotic process
• activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c
• intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
• extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand
• regulation of response to DNA damage stimulus
• response to cobalt ion
• activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
• response to UV
• execution phase of apoptosis
• positive regulation of apoptotic process
• GO:0097285 апоптоз
• розвиток нирки
• response to ischemia
• leukocyte apoptotic process

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
842
12371
Ensembl
ENSG00000132906
ENSMUSG00000028914
UniProt
P55211
Q8C3Q9
RefSeq (мРНК)
NM_001229
NM_001278054
NM_032996
NM_001277932
NM_015733
NM_001355176
RefSeq (білок)
NP_001220
NP_001264983
NP_127463
NP_001264861
NP_056548
NP_001342105
Локус (UCSC) Хр. 1: 15.49 – 15.53 Mb Хр. 4: 141.52 – 141.54 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CASP9 (англ. Caspase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 416 амінокислот, а молекулярна маса — 46 281[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDEADRRLLRRCRLRLVEELQVDQLWDALLSRELFRPHMIEDIQRAGSGS
RRDQARQLIIDLETRGSQALPLFISCLEDTGQDMLASFLRTNRQAAKLSK
PTLENLTPVVLRPEIRKPEVLRPETPRPVDIGSGGFGDVGALESLRGNAD
LAYILSMEPCGHCLIINNVNFCRESGLRTRTGSNIDCEKLRRRFSSLHFM
VEVKGDLTAKKMVLALLELAQQDHGALDCCVVVILSHGCQASHLQFPGAV
YGTDGCPVSVEKIVNIFNGTSCPSLGGKPKLFFIQACGGEQKDHGFEVAS
TSPEDESPGSNPEPDATPFQEGLRTFDQLDAISSLPTPSDIFVSYSTFPG
FVSWRDPKSGSWYVETLDDIFEQWAHSEDLQSLLLRVANAVSVKGIYKQM
PGCFNFLRKKLFFKTS

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як апоптоз.

Література

  • Seol D.W., Billiar T.R. (1999). A caspase-9 variant missing the catalytic site is an endogenous inhibitor of apoptosis. J. Biol. Chem. 274: 2072—2076. PMID 9890966 DOI:10.1074/jbc.274.4.2072
  • Wang P., Shi T., Ma D. (2006). Cloning of a novel human caspase-9 splice variant containing only the CARD domain. Life Sci. 79: 934—940. PMID 16780893 DOI:10.1016/j.lfs.2006.04.026
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Bartke T., Pohl C., Pyrowolakis G., Jentsch S. (2004). Dual role of BRUCE as an antiapoptotic IAP and a chimeric E2/E3 ubiquitin ligase. Mol. Cell. 14: 801—811. PMID 15200957 DOI:10.1016/j.molcel.2004.05.018
  • Checinska A., Giaccone G., Rodriguez J.A., Kruyt F.A.E., Jimenez C.R. (2009). Comparative proteomics analysis of caspase-9-protein complexes in untreated and cytochrome c/dATP stimulated lysates of NSCLC cells. J. Proteomics. 72: 575—585. PMID 19118655 DOI:10.1016/j.jprot.2008.11.016
  • Renatus M., Stennicke H.R., Scott F.L., Liddington R.C., Salvesen G.S. (2001). Dimer formation drives the activation of the cell death protease caspase 9. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 14250—14255. PMID 11734640 DOI:10.1073/pnas.231465798

Примітки

  1. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Caspase 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1511 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
  5. ↑ UniProt, P55211 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»