ABCE1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ABCE1, ABC38, OABP, RLI, RNASEL1, RNASELI, RNS4I, ATP binding cassette subfamily E member 1, RLI1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601213 MGI: 1195458 HomoloGene: 2205 GeneCards: ABCE1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • iron ion binding • ribosomal small subunit binding • ATP binding • endoribonuclease inhibitor activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • мітохондріальний матрикс • мембрана • мітохондрія • eukaryotic translation initiation factor 3 complex • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0022415 viral process • ribosomal subunit export from nucleus • translational termination • negative regulation of endoribonuclease activity • translational initiation • regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • defense response to virus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 145.1 – 145.13 Mb | Хр. 8: 80.41 – 80.44 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ABCE1 (англ. ATP binding cassette subfamily E member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 599 амінокислот, а молекулярна маса — 67 314[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MADKLTRIAI | | VNHDKCKPKK | | CRQECKKSCP | | VVRMGKLCIE | | VTPQSKIAWI |
SETLCIGCGI | | CIKKCPFGAL | | SIVNLPSNLE | | KETTHRYCAN | | AFKLHRLPIP |
RPGEVLGLVG | | TNGIGKSTAL | | KILAGKQKPN | | LGKYDDPPDW | | QEILTYFRGS |
ELQNYFTKIL | | EDDLKAIIKP | | QYVDQIPKAA | | KGTVGSILDR | | KDETKTQAIV |
CQQLDLTHLK | | ERNVEDLSGG | | ELQRFACAVV | | CIQKADIFMF | | DEPSSYLDVK |
QRLKAAITIR | | SLINPDRYII | | VVEHDLSVLD | | YLSDFICCLY | | GVPSAYGVVT |
MPFSVREGIN | | IFLDGYVPTE | | NLRFRDASLV | | FKVAETANEE | | EVKKMCMYKY |
PGMKKKMGEF | | ELAIVAGEFT | | DSEIMVMLGE | | NGTGKTTFIR | | MLAGRLKPDE |
GGEVPVLNVS | | YKPQKISPKS | | TGSVRQLLHE | | KIRDAYTHPQ | | FVTDVMKPLQ |
IENIIDQEVQ | | TLSGGELQRV | | ALALCLGKPA | | DVYLIDEPSA | | YLDSEQRLMA |
ARVVKRFILH | | AKKTAFVVEH | | DFIMATYLAD | | RVIVFDGVPS | | KNTVANSPQT |
LLAGMNKFLS | | QLEITFRRDP | | NNYRPRINKL | | NSIKDVEQKK | | SGNYFFLDD |
Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.
Література
- Bisbal C., Martinand C., Silhol M., Lebleu B., Salehzada T. (1995). Cloning and characterization of a RNase L inhibitor. A new component of the interferon-regulated 2-5A pathway. J. Biol. Chem. 270: 13308—13317. PMID 7539425 DOI:10.1074/jbc.270.22.13308
- Aubry F., Mattei M.-G., Barque J.-P., Galibert F. (1996). Chromosomal localization and expression pattern of the RNase L inhibitor gene. FEBS Lett. 381: 135—139. PMID 8641422 DOI:10.1016/0014-5793(96)00099-3
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Martinand C., Salehzada T., Silhol M., Lebleu B., Bisbal C. (1998). RNase L inhibitor (RLI) antisense constructions block partially the down regulation of the 2-5A/RNase L pathway in encephalomyocarditis-virus-(EMCV)-infected cells. Eur. J. Biochem. 254: 248—255. PMID 9660177 DOI:10.1046/j.1432-1327.1998.2540248.x
- Dooher J.E., Lingappa J.R. (2004). Conservation of a stepwise, energy-sensitive pathway involving HP68 for assembly of primate lentivirus capsids in cells. J. Virol. 78: 1645—1656. PMID 14747530 DOI:10.1128/JVI.78.4.1645-1656.2004
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:69 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 18 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P61221 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |