ABI1

Ідентифікатори

Символи

ABI1, ABI-1, ABLBP4, E3B1, NAP1BP, SSH3BP, SSH3BP1, abl interactor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 603050 MGI: 104913 HomoloGene: 38053 GeneCards: ABI1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein tyrosine kinase activator activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • cytoskeletal protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SH3 domain binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • postsynaptic membrane • cell projection • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • SCAR complex • мембрана • Філоподія • growth cone • клітинна мембрана • синапс • внутрішньоклітинний • міжклітинні контакти • cell leading edge • ендоплазматичний ретикулум • neuron projection • екзосома • цитоскелет • клітинне ядро • lamellipodium • filopodium tip
Біологічний процес	• somitogenesis • megakaryocyte development • Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • positive regulation of protein tyrosine kinase activity • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • peptidyl-tyrosine phosphorylation • GO:0022415 viral process • lamellipodium morphogenesis • negative regulation of cell population proliferation • dendrite morphogenesis • actin polymerization or depolymerization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10006


11308

Ensembl


ENSG00000136754


ENSMUSG00000058835

UniProt


Q8IZP0


Q8CBW3

RefSeq (мРНК)

NM_001012750 NM_001012751 NM_001012752 NM_001178116 NM_001178119
NM_001178120 NM_001178121 NM_001178122 NM_001178123 NM_001178124 NM_001178125 NM_005470 NM_001348029 NM_001348030 NM_001348031 NM_001348032 NM_001348033 NM_001348034

NM_001077190 NM_001077192 NM_001077193 NM_007380 NM_145994
NM_001331043 NM_001331044 NM_001331045 NM_001377510 NM_001377511 NM_001377512 NM_001377513

RefSeq (білок)

NP_001012768 NP_001012769 NP_001012770 NP_001171587 NP_001171590
NP_001171591 NP_001171592 NP_001171593 NP_001171594 NP_001171595 NP_001171596 NP_005461 NP_001334958 NP_001334959 NP_001334960 NP_001334961 NP_001334962 NP_001334963

NP_001070658 NP_001070660 NP_001070661 NP_001317972 NP_001317973
NP_001317974 NP_031406 NP_666106 NP_001364439 NP_001364440 NP_001364441 NP_001364442

Локус (UCSC)

Хр. 10: 26.75 – 26.86 Mb

Хр. 2: 22.83 – 22.93 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ABI1 (англ. Abl interactor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 508 амінокислот, а молекулярна маса — 55 081^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAELQMLLEE	EIPSGKRALI	ESYQNLTRVA	DYCENNYIQA	TDKRKALEET
KAYTTQSLAS	VAYQINALAN	NVLQLLDIQA	SQLRRMESSI	NHISQTVDIH
KEKVARREIG	ILTTNKNTSR	THKIIAPANM	ERPVRYIRKP	IDYTVLDDVG
HGVKWLKAKH	GNNQPARTGT	LSRTNPPTQK	PPSPPMSGRG	TLGRNTPYKT
LEPVKPPTVP	NDYMTSPARL	GSQHSPGRTA	SLNQRPRTHS	GSSGGSGSRE
NSGSSSIGIP	IAVPTPSPPT	IGPENISVPP	PSGAPPAPPL	APLLPVSTVI
AAPGSAPGSQ	YGTMTRQISR	HNSTTSSTSS	GGYRRTPSVT	AQFSAQPHVN
GGPLYSQNSI	SIAPPPPPMP	QLTPQIPLTG	FVARVQENIA	DSPTPPPPPP
PDDIPMFDDS	PPPPPPPPVD	YEDEEAAVVQ	YNDPYADGDP	AWAPKNYIEK
VVAIYDYTKD	KDDELSFMEG	AIIYVIKKND	DGWYEGVCNR	VTGLFPGNYV
ESIMHYTD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

Biesova Z., Piccoli C., Wong W.T. (1997). Isolation and characterization of e3B1, an eps8 binding protein that regulates cell growth. Oncogene. 14: 233—241. PMID 9010225 DOI:10.1038/sj.onc.1200822
Yamamoto A., Suzuki T., Sakaki Y. (2001). Isolation of hNap1BP which interacts with human Nap 1 (NCKAP1) whose expression is down-regulated in Alzheimer's disease. Gene. 271: 159—169. PMID 11418237 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00521-2
Gu Y., Souza R.F., Wu R.F., Xu Y.C., Terada L.S. (2003). Induction of colonic epithelial cell apoptosis by p47-dependent oxidants(1). FEBS Lett. 540: 195—200. PMID 12681507 DOI:10.1016/S0014-5793(03)00262-X
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fan P.-D., Goff S.P. (2000). Abl interactor 1 binds to sos and inhibits epidermal growth factor- and v-Abl-induced activation of extracellular signal-regulated kinases. Mol. Cell. Biol. 20: 7591—7601. PMID 11003655 DOI:10.1128/MCB.20.20.7591-7601.2000

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11320 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8IZP0 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.