ABLIM3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1UJS, 2DJ7

Ідентифікатори

Символи

ABLIM3, HMFN1661, actin binding LIM protein family member 3

Зовнішні ІД

OMIM: 611305 MGI: 2442582 HomoloGene: 69175 GeneCards: ABLIM3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • stress fiber • lamellipodium
Біологічний процес	• cytoskeleton organization • actin cytoskeleton organization • transcription, DNA-templated • lamellipodium assembly • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • cilium assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


22885


319713

Ensembl


ENSG00000173210


ENSMUSG00000032735

UniProt


O94929


Q69ZX8

RefSeq (мРНК)

NM_001301015 NM_001301018 NM_001301027 NM_001301028 NM_014945
NM_001345858 NM_001345859 NM_001345860 NM_001345861 NM_001370417 NM_001370418


NM_001164491 NM_198649 NM_001360868

RefSeq (білок)

NP_001287944 NP_001287947 NP_001287957 NP_001332787 NP_001332788
NP_001332789 NP_001332790 NP_055760 NP_001357346 NP_001357347


NP_001157963 NP_941051 NP_001347797

Локус (UCSC)

Хр. 5: 149.14 – 149.26 Mb

Хр. 18: 61.93 – 62.04 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ABLIM3 (англ. Actin binding LIM protein family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 683 амінокислот, а молекулярна маса — 77 802^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNTSIPYQQN	PYNPRGSSNV	IQCYRCGDTC	KGEVVRVHNN	HFHIRCFTCQ
VCGCGLAQSG	FFFKNQEYIC	TQDYQQLYGT	RCDSCRDFIT	GEVISALGRT
YHPKCFVCSL	CRKPFPIGDK	VTFSGKECVC	QTCSQSMASS	KPIKIRGPSH
CAGCKEEIKH	GQSLLALDKQ	WHVSCFKCQT	CSVILTGEYI	SKDGVPYCES
DYHAQFGIKC	ETCDRYISGR	VLEAGGKHYH	PTCARCVRCH	QMFTEGEEMY
LTGSEVWHPI	CKQAARAEKK	LKHRRTSETS	ISPPGSSIGS	PNRVICAKVD
NEILNYKDLA	ALPKVKSIYE	VQRPDLISYE	PHSRYMSDEM	LERCGYGESL
GTLSPYSQDI	YENLDLRQRR	ASSPGYIDSP	TYSRQGMSPT	FSRSPHHYYR
SGPESGRSSP	YHSQLDVRSS	TPTSYQAPKH	FHIPAGDSNI	YRKPPIYKRH
GDLSTATKSK	TSEDISQTSK	YSPIYSPDPY	YASESEYWTY	HGSPKVPRAR
RFSSGGEEDD	FDRSMHKLQS	GIGRLILKEE	MKARSSSYAD	PWTPPRSSTS
SREALHTAGY	EMSLNGSPRS	HYLADSDPLI	SKSASLPAYR	RNGLHRTPSA
DLFHYDSMNA	VNWGMREYKI	YPYELLLVTT	RGRNRLPKDV	DRTRLERHLS
QEEFYQVFGM	TISEFDRLAL	WKRNELKKQA	RLF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29132 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, O94929 (англ.) . Архів оригіналу за 9 лютого 2018. Процитовано 5 вересня 2017.