AGAP1

Ідентифікатори

Символи

AGAP1, AGAP-1, CENTG2, GGAP1, cnt-g2, ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1

Зовнішні ІД

OMIM: 608651 MGI: 2653690 HomoloGene: 56689 GeneCards: AGAP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GTP binding • phospholipid binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0006184 GTPase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• protein transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


116987


347722

Ensembl


ENSG00000157985


ENSMUSG00000055013

UniProt


Q9UPQ3


Q8BXK8

RefSeq (мРНК)


NM_001037131 NM_001244888 NM_014914


NM_001037136 NM_178119

RefSeq (білок)


NP_001032208 NP_001231817 NP_055729


NP_001032213 NP_835220

Локус (UCSC)

Хр. 2: 235.49 – 236.13 Mb

Хр. 1: 89.38 – 89.83 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

AGAP1 (англ. ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 857 амінокислот, а молекулярна маса — 94 470^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNYQQQLANS	AAIRAEIQRF	ESVHPNIYSI	YELLERVEEP	VLQNQIREHV
IAIEDAFVNS	QEWTLSRSVP	ELKVGIVGNL	ASGKSALVHR	YLTGTYVQEE
SPEGGRFKKE	IVVDGQSYLL	LIRDEGGPPE	AQFAMWVDAV	IFVFSLEDEI
SFQTVYHYYS	RMANYRNTSE	IPLVLVGTQD	AISSANPRVI	DDARARKLSN
DLKRCTYYET	CATYGLNVER	VFQDVAQKIV	ATRKKQQLSI	GPCKSLPNSP
SHSSVCSAQV	SAVHISQTSN	GGGSLSDYSS	SVPSTPSTSQ	KELRIDVPPT
ANTPTPVRKQ	SKRRSNLFTS	RKGSDPDKEK	KGLESRADSI	GSGRAIPIKQ
GMLLKRSGKS	LNKEWKKKYV	TLCDNGVLTY	HPSLHDYMQN	VHGKEIDLLR
TTVKVPGKRP	PRATSACAPI	SSPKTNGLSK	DMSSLHISPN	SGNVTSASGS
QMASGISLVS	FNSRPDGMHQ	RSYSVSSADQ	WSEATVIANS	AISSDTGLGD
SVCSSPSISS	TTSPKLDPPP	SPHANRKKHR	RKKSTSNFKA	DGLSGTAEEQ
EENFEFIIVS	LTGQTWHFEA	TTYEERDAWV	QAIESQILAS	LQSCESSKNK
SRLTSQSEAM	ALQSIRNMRG	NSHCVDCETQ	NPNWASLNLG	ALMCIECSGI
HRNLGTHLSR	VRSLDLDDWP	VELIKVMSSI	GNELANSVWE	ESSQGRTKPS
VDSTREEKER	WIRAKYEQKL	FLAPLPCTEL	SLGQHLLRAT	ADEDLRTAIL
LLAHGSRDEV	NETCGEGDGR	TALHLACRKG	NVVLAQLLIW	YGVDVTARDA
HGNTALAYAR	QASSQECIDV	LLQYGCPDER	FVLMATPNLS	RRNNNRNNSS
GRVPTII

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Meurer S., Pioch S., Wagner K., Mueller-Esterl W., Gross S. (2004). AGAP1, a novel binding partner of nitric oxide-sensitive guanylyl cyclase. J. Biol. Chem. 279: 49346—49354. PMID 15381706 DOI:10.1074/jbc.M410565200
Nie Z., Fei J., Premont R.T., Randazzo P.A. (2005). The Arf GAPs AGAP1 and AGAP2 distinguish between the adaptor protein complexes AP-1 and AP-3. J. Cell Sci. 118: 3555—3566. PMID 16079295 DOI:10.1242/jcs.02486

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16922 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UPQ3 (англ.) . Архів оригіналу за 6 жовтня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.