AHCTF1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | AHCTF1, ELYS, MST108, TMBS62, MSTP108, AT-hook containing transcription factor 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610853 MGI: 1915033 HomoloGene: 9142 GeneCards: AHCTF1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • ядерна мембрана • nuclear periphery • nuclear matrix • ядерна пора • нуклеоплазма • хромосома • nuclear pore outer ring • Хроматин • екзосома • центромера • клітинне ядро • кінетохор • nuclear envelope |
---|
Біологічний процес | • mRNA transport • nuclear pore complex assembly • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Цитокінез • поділ клітини • protein transport • клітинний цикл • sister chromatid cohesion • GO:0015915 транспорт • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cytokinesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/26/PBB_GE_AHCTF1_214766_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_AHCTF1_214766_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_015446 NM_001323342 NM_001323343 NM_175865 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001310271 NP_001310272 NP_056261 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 246.84 – 246.93 Mb | Хр. 1: 179.57 – 179.63 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
AHCTF1 (англ. AT-hook containing transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 266 амінокислот, а молекулярна маса — 252 498[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRDLRAQVTS | | GLLPFPEVTL | | QALGEDEITL | | ESVLRGKFAA | | GKNGLACLAC |
GPQLEVVNSI | | TGERLSAYRF | | SGVNEQPPVV | | LAVKEFSWQK | | RTGLLIGLEE |
TEGSVLCLYD | | LGISKVVKAV | | VLPGRVTAIE | | PIINHGGASA | | STQHLHPSLR |
WLFGVAAVVT | | DVGQILLVDL | | CLDDLSCNQN | | EVEASDLEVL | | TGIPAEVPHI |
RESVMRQGRH | | LCFQLVSPTG | | TAVSTLSYIS | | RTNQLAVGFS | | DGYLALWNMK |
SMKREYYIQL | | ESGQVPVYAV | | TFQEPENDPR | | NCCYLWAVQS | | TQDSEGDVLS |
LHLLQLAFGN | | RKCLASGQIL | | YEGLEYCEER | | YTLDLTGGMF | | PLRGQTSNTK |
LLGCQSIEKF | | RSHGDREEGV | | NEALSPDTSV | | SVFTWQVNIY | | GQGKPSVYLG |
LFDINRWYHA | | QMPDSLRSGE | | YLHNCSYFAL | | WSLESVVSRT | | SPHGILDILV |
HERSLNRGVP | | PSYPPPEQFF | | NPSTYNFDAT | | CLLNSGVVHL | | TCTGFQKETL |
TFLKKSGPSL | | NELIPDGYNR | | CLVAGLLSPR | | FVDVQPSSLS | | QEEQLEAILS |
AAIQTSSLGL | | LTGYIRRWIT | | EEQPNSATNL | | RFVLEWTWNK | | VVLTKEEFDR |
LCVPLFDGSC | | HFMDPQTIQS | | IQQCYLLLSN | | LNIVLSCFAS | | EAREITERGL |
IDLSNKFVVS | | HLICQYAQVV | | LWFSHSGLLP | | EGIDDSVQLS | | RLCYNYPVIQ |
NYYTSRRQKF | | ERLSRGKWNP | | DCLMIDGLVS | | QLGERIEKLW | | KRDEGGTGKY |
PPASLHAVLD | | MYLLDGVTEA | | AKHSITIYLL | | LDIMYSFPNK | | TDTPIESFPT |
VFAISWGQVK | | LIQGFWLIDH | | NDYESGLDLL | | FHPATAKPLS | | WQHSKIIQAF |
MSQGEHRQAL | | RYIQTMKPTV | | SSGNDVILHL | | TVLLFNRCMV | | EAWNFLRQHC |
NRLNIEELLK | | HMYEVCQEMG | | LMEDLLKLPF | | TDTEQECLVK | | FLQSSASVQN |
HEFLLVHHLQ | | RANYVPALKL | | NQTLKINVMN | | DRDPRLRERS | | LARNSILDQY |
GKILPRVHRK | | LAIERAKPYH | | LSTSSVFRLV | | SRPKPLSAVP | | KQVVTGTVLT |
RSVFINNVLS | | KIGEVWASKE | | PINSTTPFNS | | SKIEEPSPIV | | YSLPAPELPE |
AFFGTPISKA | | SQKISRLLDL | | VVQPVPRPSQ | | CSEFIQQSSM | | KSPLYLVSRS |
LPSSSQLKGS | | PQAISRASEL | | HLLETPLVVK | | KAKSLAMSVT | | TSGFSEFTPQ |
SILRSTLRST | | PLASPSPSPG | | RSPQRLKETR | | ISFVEEDVHP | | KWIPGAADDS |
KLEVFTTPKK | | CAVPVETEWL | | KSKDRTTSFF | | LNSPEKEHQE | | MDEGSQSLEK |
LDVSKGNSSV | | SITSDETTLE | | YQDAPSPEDL | | EETVFTASKP | | KSSSTALTTN |
VTEQTEKDGD | | KDVFASEVTP | | SDLQKQMGNL | | EDAETKDLLV | | AAEAFSELNH |
LSPVQGTEAS | | LCAPSVYEGK | | IFTQKSKVPV | | LDEGLTSVET | | YTPAIRANDN |
KSMADVLGDG | | GNSSLTISEG | | PIVSERRLNQ | | EVALNLKEDH | | EVEVGVLKES |
VDLPEEKLPI | | SDSPPDTQEI | | HVIEQEKLEA | | QDSGEEARNL | | SFNELYPSGT |
LKLQYNFDTI | | DQQFCDLADN | | KDTAECDIAE | | VDGELFVAQS | | NFTLILEGEE |
GEVEPGDFAS | | SDVLPKAANT | | ATEEKLVCSG | | ENDNHGQIAN | | LPSAVTSDQK |
SQKVDTLPYV | | PEPIKVAIAE | | NLLDVIKDTR | | SKEITSDTME | | QSIHETIPLV |
SQNIMCPTKL | | VKSAFKTAQE | | TSTMTMNVSQ | | VDDVVSSKTR | | TRGQRIQNVN |
VKSAQQEASA | | DVATPKMPGQ | | SVRKKTRKAK | | EISEASENIY | | SDVRGLSQNQ |
QIPQNSVTPR | | RGRRKKEVNQ | | DILENTSSVE | | QELQITTGRE | | SKRLKSSQLL |
EPAVEETTKK | | EVKVSSVTKR | | TPRRIKRSVE | | NQESVEIIND | | LKVSTVTSPS |
RMIRKLRSTN | | LDASENTGNK | | QDDKSSDKQL | | RIKHVRRVRG | | REVSPSDVRE |
DSNLESSQLT | | VQAEFDMSAI | | PRKRGRPRKI | | NPSEDVGSKA | | VKEERSPKKK |
EAPSIRRRST | | RNTPAKSENV | | DVGKPALGKS | | ILVPNEELSM | | VMSSKKKLTK |
KTESQSQKRS | | LHSVSEERTD | | EMTHKETNEQ | | EERLLATASF | | TKSSRSSRTR |
SSKAILLPDL | | SEPNNEPLFS | | PASEVPRKAK | | AKKIEVPAQL | | KELVSDLSSQ |
FVISPPALRS | | RQKNTSNKNK | | LEDELKDDAQ | | SVETLGKPKA | | KRIRTSKTKQ |
ASKNTEKESA | | WSPPPIEIRL | | ISPLASPADG | | VKSKPRKTTE | | VTGTGLGRNR |
KKLSSYPKQI | | LRRKML |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, транспорт мРНК, транслокація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах, комплексі ядерної пори, центромерах, кінетохорі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Rasala B.A., Orjalo A.V., Shen Z., Briggs S., Forbes D.J. (2006). ELYS is a dual nucleoporin/kinetochore protein required for nuclear pore assembly and proper cell division. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 17801—17806. PMID 17098863 DOI:10.1073/pnas.0608484103
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24618 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q8WYP5 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |