AHCTF1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4I0O

Ідентифікатори

Символи

AHCTF1, ELYS, MST108, TMBS62, MSTP108, AT-hook containing transcription factor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 610853 MGI: 1915033 HomoloGene: 9142 GeneCards: AHCTF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • ядерна мембрана • nuclear periphery • nuclear matrix • ядерна пора • нуклеоплазма • хромосома • nuclear pore outer ring • Хроматин • екзосома • центромера • клітинне ядро • кінетохор • nuclear envelope
Біологічний процес	• mRNA transport • nuclear pore complex assembly • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Цитокінез • поділ клітини • protein transport • клітинний цикл • sister chromatid cohesion • GO:0015915 транспорт • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cytokinesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


25909


226747

Ensembl


ENSG00000153207


ENSMUSG00000026491

UniProt


Q8WYP5


Q8CJF7

RefSeq (мРНК)


NM_015446 NM_001323342 NM_001323343 NM_175865


NM_026375

RefSeq (білок)


NP_001310271 NP_001310272 NP_056261


NP_080651

Локус (UCSC)

Хр. 1: 246.84 – 246.93 Mb

Хр. 1: 179.57 – 179.63 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

AHCTF1 (англ. AT-hook containing transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 266 амінокислот, а молекулярна маса — 252 498^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRDLRAQVTS	GLLPFPEVTL	QALGEDEITL	ESVLRGKFAA	GKNGLACLAC
GPQLEVVNSI	TGERLSAYRF	SGVNEQPPVV	LAVKEFSWQK	RTGLLIGLEE
TEGSVLCLYD	LGISKVVKAV	VLPGRVTAIE	PIINHGGASA	STQHLHPSLR
WLFGVAAVVT	DVGQILLVDL	CLDDLSCNQN	EVEASDLEVL	TGIPAEVPHI
RESVMRQGRH	LCFQLVSPTG	TAVSTLSYIS	RTNQLAVGFS	DGYLALWNMK
SMKREYYIQL	ESGQVPVYAV	TFQEPENDPR	NCCYLWAVQS	TQDSEGDVLS
LHLLQLAFGN	RKCLASGQIL	YEGLEYCEER	YTLDLTGGMF	PLRGQTSNTK
LLGCQSIEKF	RSHGDREEGV	NEALSPDTSV	SVFTWQVNIY	GQGKPSVYLG
LFDINRWYHA	QMPDSLRSGE	YLHNCSYFAL	WSLESVVSRT	SPHGILDILV
HERSLNRGVP	PSYPPPEQFF	NPSTYNFDAT	CLLNSGVVHL	TCTGFQKETL
TFLKKSGPSL	NELIPDGYNR	CLVAGLLSPR	FVDVQPSSLS	QEEQLEAILS
AAIQTSSLGL	LTGYIRRWIT	EEQPNSATNL	RFVLEWTWNK	VVLTKEEFDR
LCVPLFDGSC	HFMDPQTIQS	IQQCYLLLSN	LNIVLSCFAS	EAREITERGL
IDLSNKFVVS	HLICQYAQVV	LWFSHSGLLP	EGIDDSVQLS	RLCYNYPVIQ
NYYTSRRQKF	ERLSRGKWNP	DCLMIDGLVS	QLGERIEKLW	KRDEGGTGKY
PPASLHAVLD	MYLLDGVTEA	AKHSITIYLL	LDIMYSFPNK	TDTPIESFPT
VFAISWGQVK	LIQGFWLIDH	NDYESGLDLL	FHPATAKPLS	WQHSKIIQAF
MSQGEHRQAL	RYIQTMKPTV	SSGNDVILHL	TVLLFNRCMV	EAWNFLRQHC
NRLNIEELLK	HMYEVCQEMG	LMEDLLKLPF	TDTEQECLVK	FLQSSASVQN
HEFLLVHHLQ	RANYVPALKL	NQTLKINVMN	DRDPRLRERS	LARNSILDQY
GKILPRVHRK	LAIERAKPYH	LSTSSVFRLV	SRPKPLSAVP	KQVVTGTVLT
RSVFINNVLS	KIGEVWASKE	PINSTTPFNS	SKIEEPSPIV	YSLPAPELPE
AFFGTPISKA	SQKISRLLDL	VVQPVPRPSQ	CSEFIQQSSM	KSPLYLVSRS
LPSSSQLKGS	PQAISRASEL	HLLETPLVVK	KAKSLAMSVT	TSGFSEFTPQ
SILRSTLRST	PLASPSPSPG	RSPQRLKETR	ISFVEEDVHP	KWIPGAADDS
KLEVFTTPKK	CAVPVETEWL	KSKDRTTSFF	LNSPEKEHQE	MDEGSQSLEK
LDVSKGNSSV	SITSDETTLE	YQDAPSPEDL	EETVFTASKP	KSSSTALTTN
VTEQTEKDGD	KDVFASEVTP	SDLQKQMGNL	EDAETKDLLV	AAEAFSELNH
LSPVQGTEAS	LCAPSVYEGK	IFTQKSKVPV	LDEGLTSVET	YTPAIRANDN
KSMADVLGDG	GNSSLTISEG	PIVSERRLNQ	EVALNLKEDH	EVEVGVLKES
VDLPEEKLPI	SDSPPDTQEI	HVIEQEKLEA	QDSGEEARNL	SFNELYPSGT
LKLQYNFDTI	DQQFCDLADN	KDTAECDIAE	VDGELFVAQS	NFTLILEGEE
GEVEPGDFAS	SDVLPKAANT	ATEEKLVCSG	ENDNHGQIAN	LPSAVTSDQK
SQKVDTLPYV	PEPIKVAIAE	NLLDVIKDTR	SKEITSDTME	QSIHETIPLV
SQNIMCPTKL	VKSAFKTAQE	TSTMTMNVSQ	VDDVVSSKTR	TRGQRIQNVN
VKSAQQEASA	DVATPKMPGQ	SVRKKTRKAK	EISEASENIY	SDVRGLSQNQ
QIPQNSVTPR	RGRRKKEVNQ	DILENTSSVE	QELQITTGRE	SKRLKSSQLL
EPAVEETTKK	EVKVSSVTKR	TPRRIKRSVE	NQESVEIIND	LKVSTVTSPS
RMIRKLRSTN	LDASENTGNK	QDDKSSDKQL	RIKHVRRVRG	REVSPSDVRE
DSNLESSQLT	VQAEFDMSAI	PRKRGRPRKI	NPSEDVGSKA	VKEERSPKKK
EAPSIRRRST	RNTPAKSENV	DVGKPALGKS	ILVPNEELSM	VMSSKKKLTK
KTESQSQKRS	LHSVSEERTD	EMTHKETNEQ	EERLLATASF	TKSSRSSRTR
SSKAILLPDL	SEPNNEPLFS	PASEVPRKAK	AKKIEVPAQL	KELVSDLSSQ
FVISPPALRS	RQKNTSNKNK	LEDELKDDAQ	SVETLGKPKA	KRIRTSKTKQ
ASKNTEKESA	WSPPPIEIRL	ISPLASPADG	VKSKPRKTTE	VTGTGLGRNR
KKLSSYPKQI	LRRKML

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, транспорт мРНК, транслокація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах, комплексі ядерної пори, центромерах, кінетохорі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Rasala B.A., Orjalo A.V., Shen Z., Briggs S., Forbes D.J. (2006). ELYS is a dual nucleoporin/kinetochore protein required for nuclear pore assembly and proper cell division. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 17801—17806. PMID 17098863 DOI:10.1073/pnas.0608484103

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24618 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8WYP5 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.