AHI1

AHI1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4ESR

Ідентифікатори
Символи AHI1, AHI-1, JBTS3, ORF1, dJ71N10.1, Abelson helper integration site 1
Зовнішні ІД OMIM: 608894 MGI: 87971 HomoloGene: 9762 GeneCards: AHI1
Пов'язані генетичні захворювання
розсіяний склероз, Joubert syndrome 3, Joubert syndrome with ocular defect, Joubert syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001948, GO:0016582 protein binding
identical protein binding

Клітинна компонента

цитоплазма
ciliary basal body
гіалоплазма
центросома
cell projection
MKS complex
cell-cell junction
Адгезивні контакти
міжклітинні контакти
цитоскелет
Центріоль
війка
non-motile cilium

Біологічний процес

cilium assembly
pronephric nephron tubule morphogenesis
regulation of behavior
retina layer formation
positive regulation of receptor internalization
transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway
hindbrain development
negative regulation of apoptotic process
morphogenesis of a polarized epithelium
photoreceptor cell outer segment organization
otic vesicle development
Kupffer's vesicle development
heart looping
specification of axis polarity
central nervous system development
cell projection organization
cloaca development
pronephric duct morphogenesis
positive regulation of polarized epithelial cell differentiation
vesicle-mediated transport
left/right axis specification
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
диференціація клітин
ciliary basal body-plasma membrane docking
multicellular organism development

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
54806
52906
Ensembl
ENSG00000135541
ENSMUSG00000019986
UniProt
Q8N157
Q8K3E5
RefSeq (мРНК)
NM_001134830
NM_001134831
NM_001134832
NM_017651
NM_001350503
NM_001350504
NM_001177776
NM_026203
NM_001358561
RefSeq (білок)
NP_001128302
NP_001128303
NP_001128304
NP_060121
NP_001337432
NP_001337433
XP_006512862.1
Локус (UCSC) Хр. 6: 135.28 – 135.5 Mb Хр. 10: 20.83 – 20.96 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

AHI1 (англ. Abelson helper integration site 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 196 амінокислот, а молекулярна маса — 137 115[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPTAESEAKVKTKVRFEELLKTHSDLMREKKKLKKKLVRSEENISPDTIR
SNLHYMKETTSDDPDTIRSNLPHIKETTSDDVSAANTNNLKKSTRVTKNK
LRNTQLATENPNGDASVEEDKQGKPNKKVIKTVPQLTTQDLKPETPENKV
DSTHQKTHTKPQPGVDHQKSEKANEGREETDLEEDEELMQAYQCHVTEEM
AKEIKRKIRKKLKEQLTYFPSDTLFHDDKLSSEKRKKKKEVPVFSKAETS
TLTISGDTVEGEQKKESSVRSVSSDSHQDDEISSMEQSTEDSMQDDTKPK
PKKTKKKTKAVADNNEDVDGDGVHEITSRDSPVYPKCLLDDDLVLGVYIH
RTDRLKSDFMISHPMVKIHVVDEHTGQYVKKDDSGRPVSSYYEKENVDYI
LPIMTQPYDFKQLKSRLPEWEEQIVFNENFPYLLRGSDESPKVILFFEIL
DFLSVDEIKNNSEVQNQECGFRKIAWAFLKLLGANGNANINSKLRLQLYY
PPTKPRSPLSVVEAFEWWSKCPRNHYPSTLYVTVRGLKVPDCIKPSYRSM
MALQEEKGKPVHCERHHESSSVDTEPGLEESKEVIKWKRLPGQACRIPNK
HLFSLNAGERGCFCLDFSHNGRILAAACASRDGYPIILYEIPSGRFMREL
CGHLNIIYDLSWSKDDHYILTSSSDGTARIWKNEINNTNTFRVLPHPSFV
YTAKFHPAVRELVVTGCYDSMIRIWKVEMREDSAILVRQFDVHKSFINSL
CFDTEGHHMYSGDCTGVIVVWNTYVKINDLEHSVHHWTINKEIKETEFKG
IPISYLEIHPNGKRLLIHTKDSTLRIMDLRILVARKFVGAANYREKIHST
LTPCGTFLFAGSEDGIVYVWNPETGEQVAMYSDLPFKSPIRDISYHPFEN
MVAFCAFGQNEPILLYIYDFHVAQQEAEMFKRYNGTFPLPGIHQSQDALC
TCPKLPHQGSFQIDEFVHTESSSTKMQLVKQRLETVTEVIRSCAAKVNKN
LSFTSPPAVSSQQSKLKQSNMLTAQEILHQFGFTQTGIISIERKPCNHQV
DTAPTVVALYDYTANRSDELTIHRGDIIRVFFKDNEDWWYGSIGKGQEGY
FPANHVASETLYQELPPEIKERSPPLSPEEKTKIEKSPAPQKQSINKNKS
QDFRLGSESMTHSEMRKEQSHEDQGHIMDTRMRKNKQAGRKVTLIE

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, клітинних відростках, війках.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з AHI1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21575 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
  5. UniProt, Q8N157 (англ.) . Архів оригіналу за 11 лютого 2018. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»