AKAP13

AKAP13
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2DRN, 2LG1, 4D0N, 4D0O

Ідентифікатори
Символи AKAP13, A kinase (PRKA) anchor protein 13, AKAP-13, AKAP-Lbc, ARHGEF13, BRX, HA-3, Ht31, LBC, PRKA13, PROTO-LB, PROTO-LBC, c-lbc, p47, A-kinase anchoring protein 13, A-kinase anchor protein 13
Зовнішні ІД OMIM: 604686 MGI: 2676556 HomoloGene: 4903 GeneCards: AKAP13
Онтологія гена
Молекулярна функція

• зв'язування з іоном металу
• MAP-kinase scaffold activity
• guanyl-nucleotide exchange factor activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• GO:0032947 molecular adaptor activity
• protein kinase A binding
• signal transducer activity
• cAMP-dependent protein kinase activity

Клітинна компонента

• мембрана
• гіалоплазма
• actin cytoskeleton
• perinuclear region of cytoplasm
• клітинне ядро
• cell cortex
• мікрофіламент
• cortical actin cytoskeleton
• цитоплазма
• внутрішньоклітинний

Біологічний процес

• regulation of cardiac muscle hypertrophy
• bone development
• GO:0007243 intracellular signal transduction
• regulation of glucocorticoid mediated signaling pathway
• positive regulation of Rho protein signal transduction
• regulation of sarcomere organization
• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• adrenergic receptor signaling pathway
• regulation of small GTPase mediated signal transduction
• adenylate cyclase-activating adrenergic receptor signaling pathway involved in heart process
• heart development
• positive regulation of apoptotic process
• cardiac muscle cell differentiation
• regulation of Rho protein signal transduction
• protein phosphorylation
• regulation of protein kinase activity
• nuclear export
• G protein-coupled receptor signaling pathway
• positive regulation of MAP kinase activity
• cell growth involved in cardiac muscle cell development

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
11214
75547
Ensembl
ENSG00000170776
ENSMUSG00000066406
UniProt
Q12802
E9Q394
RefSeq (мРНК)
NM_144767
NM_001270546
NM_006738
NM_007200
NM_032162
NM_029332
RefSeq (білок)
NP_001257475
NP_006729
NP_009131
NP_083608
Локус (UCSC) Хр. 15: 85.38 – 85.75 Mb Хр. 7: 75.46 – 75.75 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

AKAP13 (англ. A-kinase anchoring protein 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 813 амінокислот, а молекулярна маса — 307 550[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKLNPQQAPLYGDCVVTVLLAEEDKAEDDVVFYLVFLGSTLRHCTSTRKV
SSDTLETIAPGHDCCETVKVQLCASKEGLPVFVVAEEDFHFVQDEAYDAA
QFLATSAGNQQALNFTRFLDQSGPPSGDVNSLDKKLVLAFRHLKLPTEWN
VLGTDQSLHDAGPRETLMHFAVRLGLLRLTWFLLQKPGGRGALSIHNQEG
ATPVSLALERGYHKLHQLLTEENAGEPDSWSSLSYEIPYGDCSVRHHREL
DIYTLTSESDSHHEHPFPGDGCTGPIFKLMNIQQQLMKTNLKQMDSLMPL
MMTAQDPSSAPETDGQFLPCAPEPTDPQRLSSSEETESTQCCPGSPVAQT
ESPCDLSSIVEEENTDRSCRKKNKGVERKGEEVEPAPIVDSGTVSDQDSC
LQSLPDCGVKGTEGLSSCGNRNEETGTKSSGMPTDQESLSSGDAVLQRDL
VMEPGTAQYSSGGELGGISTTNVSTPDTAGEMEHGLMNPDATVWKNVLQG
GESTKERFENSNIGTAGASDVHVTSKPVDKISVPNCAPAASSLDGNKPAE
SSLAFSNEETSTEKTAETETSRSREESADAPVDQNSVVIPAAAKDKISDG
LEPYTLLAAGIGEAMSPSDLALLGLEEDVMPHQNSETNSSHAQSQKGKSS
PICSTTGDDKLCADSACQQNTVTSSGDLVAKLCDNIVSESESTTARQPSS
QDPPDASHCEDPQAHTVTSDPVRDTQERADFCPFKVVDNKGQRKDVKLDK
PLTNMLEVVSHPHPVVPKMEKELVPDQAVISDSTFSLANSPGSESVTKDD
ALSFVPSQKEKGTATPELHTATDYRDGPDGNSNEPDTRPLEDRAVGLSTS
STAAELQHGMGNTSLTGLGGEHEGPAPPAIPEALNIKGNTDSSLQSVGKA
TLALDSVLTEEGKLLVVSESSAAQEQDKDKAVTCSSIKENALSSGTLQEE
QRTPPPGQDTQQFHEKSISADCAKDKALQLSNSPGASSAFLKAETEHNKE
VAPQVSLLTQGGAAQSLVPPGASLATESRQEALGAEHNSSALLPCLLPDG
SDGSDALNCSQPSPLDVGVKNTQSQGKTSACEVSGDVTVDVTGVNALQGM
AEPRRENISHNTQDILIPNVLLSQEKNAVLGLPVALQDKAVTDPQGVGTP
EMIPLDWEKGKLEGADHSCTMGDAEEAQIDDEAHPVLLQPVAKELPTDME
LSAHDDGAPAGVREVMRAPPSGRERSTPSLPCMVSAQDAPLPKGADLIEE
AASRIVDAVIEQVKAAGALLTEGEACHMSLSSPELGPLTKGLESAFTEKV
STFPPGESLPMGSTPEEATGSLAGCFAGREEPEKIILPVQGPEPAAEMPD
VKAEDEVDFRASSISEEVAVGSIAATLKMKQGPMTQAINRENWCTIEPCP
DAASLLASKQSPECENFLDVGLGRECTSKQGVLKRESGSDSDLFHSPSDD
MDSIIFPKPEEEHLACDITGSSSSTDDTASLDRHSSHGSDVSLSQILKPN
RSRDRQSLDGFYSHGMGAEGRESESEPADPGDVEEEEMDSITEVPANCSV
LRSSMRSLSPFRRHSWGPGKNAASDAEMNHRSSMRVLGDVVRRPPIHRRS
FSLEGLTGGAGVGNKPSSSLEVSSANAEELRHPFSGEERVDSLVSLSEED
LESDQREHRMFDQQICHRSKQQGFNYCTSAISSPLTKSISLMTISHPGLD
NSRPFHSTFHNTSANLTESITEENYNFLPHSPSKKDSEWKSGTKVSRTFS
YIKNKMSSSKKSKEKEKEKDKIKEKEKDSKDKEKDKKTVNGHTFSSIPVV
GPISCSQCMKPFTNKDAYTCANCSAFVHKGCRESLASCAKVKMKQPKGSL
QAHDTSSLPTVIMRNKPSQPKERPRSAVLLVDETATTPIFANRRSQQSVS
LSKSVSIQNITGVGNDENMSNTWKFLSHSTDSLNKISKVNESTESLTDEG
VGTDMNEGQLLGDFEIESKQLEAESWSRIIDSKFLKQQKKDVVKRQEVIY
ELMQTEFHHVRTLKIMSGVYSQGMMADLLFEQQMVEKLFPCLDELISIHS
QFFQRILERKKESLVDKSEKNFLIKRIGDVLVNQFSGENAERLKKTYGKF
CGQHNQSVNYFKDLYAKDKRFQAFVKKKMSSSVVRRLGIPECILLVTQRI
TKYPVLFQRILQCTKDNEVEQEDLAQSLSLVKDVIGAVDSKVASYEKKVR
LNEIYTKTDSKSIMRMKSGQMFAKEDLKRKKLVRDGSVFLKNAAGRLKEV
QAVLLTDILVFLQEKDQKYIFASLDQKSTVISLKKLIVREVAHEEKGLFL
ISMGMTDPEMVEVHASSKEERNSWIQIIQDTINTLNRDEDEGIPSENEEE
KKMLDTRARELKEQLHQKDQKILLLLEEKEMIFRDMAECSTPLPEDCSPT
HSPRVLFRSNTEEALKGGPLMKSAINEVEILQGLVSGNLGGTLGPTVSSP
IEQDVVGPVSLPRRAETFGGFDSHQMNASKGGEKEEGDDGQDLRRTESDS
GLKKGGNANLVFMLKRNSEQVVQSVVHLYELLSALQGVVLQQDSYIEDQK
LVLSERALTRSLSRPSSLIEQEKQRSLEKQRQDLANLQKQQAQYLEEKRR
REREWEARERELREREALLAQREEEVQQGQQDLEKEREELQQKKGTYQYD
LERLRAAQKQLEREQEQLRREAERLSQRQTERDLCQVSHPHTKLMRIPSF
FPSPEEPPSPSAPSIAKSGSLDSELSVSPKRNSISRTHKDKGPFHILSST
SQTNKGPEGQSQAPASTSASTRLFGLTKPKEKKEKKKKNKTSRSQPGDGP
ASEVSAEGEEIFC

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

  • Diviani D., Soderling J., Scott J.D. (2001). AKAP-Lbc anchors protein kinase A and nucleates Galpha 12-selective Rho-mediated stress fiber formation. J. Biol. Chem. 276: 44247—44257. PMID 11546812 DOI:10.1074/jbc.M106629200
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Driggers P.H., Segars J.H., Rubino D.M. (2001). The proto-oncoprotein Brx activates estrogen receptor beta by a p38 mitogen-activated protein kinase pathway. J. Biol. Chem. 276: 46792—46797. PMID 11579095 DOI:10.1074/jbc.M106927200
  • Iwashita S., Fujii M., Mukai H., Ono Y., Miyamoto M. (2004). Lbc proto-oncogene product binds to and could be negatively regulated by metastasis suppressor nm23-H2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 320: 1063—1068. PMID 15249197 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.06.067
  • Diviani D., Abuin L., Cotecchia S., Pansier L. (2004). Anchoring of both PKA and 14-3-3 inhibits the Rho-GEF activity of the AKAP-Lbc signaling complex. EMBO J. 23: 2811—2820. PMID 15229649 DOI:10.1038/sj.emboj.7600287
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:371 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. ↑ UniProt, Q12802 (англ.) . Архів оригіналу за 25 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 15
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.