AP2M1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1H6E, 2JKT, 2JKR, 2VGL, 2BP5

Ідентифікатори

Символи

AP2M1, AP50, CLAPM1, mu2, adaptor related protein complex 2 mu 1 subunit, adaptor related protein complex 2 subunit mu 1, MRD60

Зовнішні ІД

OMIM: 601024 MGI: 1298405 HomoloGene: 3000 GeneCards: AP2M1

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• lipid binding • clathrin adaptor activity • transporter activity • transmembrane transporter binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signal sequence binding • low-density lipoprotein particle receptor binding
Клітинна компонента	• екзосома • lysosomal membrane • AP-2 adaptor complex • endocytic vesicle membrane • гіалоплазма • мембрана • endolysosome membrane • clathrin adaptor complex • clathrin-coated pit • clathrin-coated endocytic vesicle membrane • клітинна мембрана • clathrin-coated endocytic vesicle
Біологічний процес	• ephrin receptor signaling pathway • GO:0019049, GO:0030683 mitigation of host defenses by virus • clathrin-dependent endocytosis • negative regulation of protein localization to plasma membrane • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • ендоцитоз • protein transport • vesicle-mediated transport • intracellular protein transport • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • microtubule-based movement • membrane organization • low-density lipoprotein particle receptor catabolic process • low-density lipoprotein particle clearance • GO:0015915 транспорт • vesicle budding from membrane • receptor internalization • regulation of vesicle size
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1173


11773

Ensembl


ENSG00000161203


ENSMUSG00000022841

UniProt


Q96CW1


P84091

RefSeq (мРНК)


NM_004068 NM_001025205 NM_001311198


NM_009679 NM_001302970

RefSeq (білок)


NP_001020376 NP_001298127 NP_004059


NP_001289899 NP_033809

Локус (UCSC)

Хр. 3: 184.17 – 184.18 Mb

Хр. 16: 20.35 – 20.36 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

AP2M1 (англ. Adaptor related protein complex 2 mu 1 subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 435 амінокислот, а молекулярна маса — 49 655^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MIGGLFIYNH	KGEVLISRVY	RDDIGRNAVD	AFRVNVIHAR	QQVRSPVTNI
ARTSFFHVKR	SNIWLAAVTK	QNVNAAMVFE	FLYKMCDVMA	AYFGKISEEN
IKNNFVLIYE	LLDEILDFGY	PQNSETGALK	TFITQQGIKS	QHQTKEEQSQ
ITSQVTGQIG	WRREGIKYRR	NELFLDVLES	VNLLMSPQGQ	VLSAHVSGRV
VMKSYLSGMP	ECKFGMNDKI	VIEKQGKGTA	DETSKSGKQS	IAIDDCTFHQ
CVRLSKFDSE	RSISFIPPDG	EFELMRYRTT	KDIILPFRVI	PLVREVGRTK
LEVKVVIKSN	FKPSLLAQKI	EVRIPTPLNT	SGVQVICMKG	KAKYKASENA
IVWKIKRMAG	MKESQISAEI	ELLPTNDKKK	WARPPISMNF	EVPFAPSGLK
VRYLKVFEPK	LNYSDHDVIK	WVRYIGRSGI	YETRC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nakatsu F., Ohno H. (2003). Adaptor protein complexes as the key regulators of protein sorting in the post-Golgi network. Cell Struct. Funct. 28: 419—429. PMID 14745134 DOI:10.1247/csf.28.419
Motley A., Bright N.A., Seaman M.N.J., Robinson M.S. (2003). Clathrin-mediated endocytosis in AP-2-depleted cells. J. Cell Biol. 162: 909—918. PMID 12952941 DOI:10.1083/jcb.200305145
Fraile-Ramos A., Kohout T.A., Waldhoer M., Marsh M. (2003). Endocytosis of the viral chemokine receptor US28 does not require beta-arrestins but is dependent on the clathrin-mediated pathway. Traffic. 4: 243—253. PMID 12694563 DOI:10.1034/j.1600-0854.2003.00079.x
Owen D.J., Collins B.M., Evans P.R. (2004). Adaptors for clathrin coats: structure and function. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 20: 153—191. PMID 15473838 DOI:10.1146/annurev.cellbio.20.010403.104543
Huang F., Khvorova A., Marshall W., Sorkin A. (2004). Analysis of clathrin-mediated endocytosis of epidermal growth factor receptor by RNA interference. J. Biol. Chem. 279: 16657—16661. PMID 14985334 DOI:10.1074/jbc.C400046200

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Adaptor related protein complex 2 subunit mu 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:564 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q96CW1 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.