APEX1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1BIX, 1CQH, 4LND, 4QH9, 5DFF, 4QHD, 1E9N, 3U8U, 5DFI, 1HD7, 5DG0, 5DFJ, 4QHE, 5DFH, 1DE9, 4IEM, 2ISI, 1DE8, 2O3H, 1CQG, 1DEW, 5CFG

Ідентифікатори

Символи

APEX1, APE, APE1, APEN, APEX, APX, HAP1, REF1, apurinic/apyrimidinic endodeoxyribonuclease 1

Зовнішні ІД

OMIM: 107748 MGI: 88042 HomoloGene: 1241 GeneCards: APEX1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • nuclease activity • endonuclease activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • lyase activity • class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • exonuclease activity • phosphodiesterase I activity • double-stranded DNA 3'-5' exodeoxyribonuclease activity • endodeoxyribonuclease activity • chromatin DNA binding • endoribonuclease activity • uracil DNA N-glycosylase activity • phosphoric diester hydrolase activity • site-specific endodeoxyribonuclease activity, specific for altered base • double-stranded telomeric DNA binding • oxidoreductase activity • double-stranded DNA exodeoxyribonuclease activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • NF-kappaB binding • RNA-DNA hybrid ribonuclease activity • damaged DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • 3'-5' exonuclease activity • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • RNA binding • class III/IV DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • центросома • внутрішньоклітинний • мітохондрія • клітинне ядро • perinuclear region of cytoplasm • рибосома • transcription regulator complex • nuclear speck • нуклеоплазма • ядерце • ендоплазматичний ретикулум
Біологічний процес	• GO:0100026 Репарація ДНК • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • cellular response to DNA damage stimulus • DNA recombination • positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • negative regulation of smooth muscle cell migration • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • DNA demethylation • cellular response to cAMP • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • transcription, DNA-templated • response to organonitrogen compound • cellular response to hydrogen peroxide • cellular response to peptide hormone stimulus • regulation of mRNA stability • cellular response to organonitrogen compound • cell redox homeostasis • GO:0010260 старіння людини • base-excision repair • telomere maintenance • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • telomere maintenance via base-excision repair • regulation of apoptotic process • positive regulation of nucleic acid-templated transcription
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


328


11792

Ensembl


ENSG00000100823


ENSMUSG00000035960

UniProt


P27695


P28352

RefSeq (мРНК)


NM_001244249 NM_001641 NM_080648 NM_080649


NM_009687

RefSeq (білок)


NP_001231178 NP_001632 NP_542379 NP_542380


NP_033817

Локус (UCSC)

Хр. 14: 20.46 – 20.46 Mb

Хр. 14: 51.16 – 51.16 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

APEX1 (англ. DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 263 амінокислот, а молекулярна маса — 29 190^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPKRGKKGAV	AEDGDELRTE	PEAKKSKTAA	KKNDKEAAGE	GPALYEDPPD
QKTSPSGKPA	TLKICSWNVD	GLRAWIKKKG	LDWVKEEAPD	ILCLQETKCS
ENKLPAELQE	LPGLSHQYWS	APSDKEGYSG	VGLLSRQCPL	KVSYGIGDEE
HDQEGRVIVA	EFDSFVLVTA	YVPNAGRGLV	RLEYRQRWDE	AFRKFLKGLA
SRKPLVLCGD	LNVAHEEIDL	RNPKGNKKNA	GFTPQERQGF	GELLQAVPLA
DSFRHLYPNT	PYA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії.

Література

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:587 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.
↑ UniProt, G3V3M6 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.