APOBEC2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b9/Protein_APOBEC2_PDB_2nyt.png/250px-Protein_APOBEC2_PDB_2nyt.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | APOBEC2, ARCD1, ARP1, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604797 MGI: 1343178 HomoloGene: 4941 GeneCards: APOBEC2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines • zinc ion binding • каталітична активність • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • RNA binding • cytidine deaminase activity • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • DNA demethylation • mRNA processing • mRNA modification • cytidine deamination • cytidine to uridine editing |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/cd/PBB_GE_APOBEC2_206160_at_fs.png/250px-PBB_GE_APOBEC2_206160_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 41.05 – 41.06 Mb | Хр. 17: 48.73 – 48.74 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
APOBEC2 (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 224 амінокислот, а молекулярна маса — 25 703[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAQKEEAAVA | | TEAASQNGED | | LENLDDPEKL | | KELIELPPFE | | IVTGERLPAN |
FFKFQFRNVE | | YSSGRNKTFL | | CYVVEAQGKG | | GQVQASRGYL | | EDEHAAAHAE |
EAFFNTILPA | | FDPALRYNVT | | WYVSSSPCAA | | CADRIIKTLS | | KTKNLRLLIL |
VGRLFMWEEP | | EIQAALKKLK | | EAGCKLRIMK | | PQDFEYVWQN | | FVEQEEGESK |
AFQPWEDIQE | | NFLYYEEKLA | | DILK |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Guo J.U., Su Y., Zhong C., Ming G.L., Song H. (2011). Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain. Cell. 145: 423—434. PMID 21496894 DOI:10.1016/j.cell.2011.03.022
- Prochnow C., Bransteitter R., Klein M.G., Goodman M.F., Chen X.S. (2007). The APOBEC-2 crystal structure and functional implications for the deaminase AID. Nature. 445: 447—451. PMID 17187054 DOI:10.1038/nature05492
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:605 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y235 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |