ARAP2

ARAP2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1X40, 2COD

Ідентифікатори
Символи ARAP2, CENTD1, PARX, ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2
Зовнішні ІД OMIM: 606645 MGI: 2684416 HomoloGene: 9064 GeneCards: ARAP2
Пов'язані генетичні захворювання
бічний аміотрофічний склероз[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• зв'язування з іоном металу
• GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity
• phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма

Біологічний процес

• GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity
• regulation of small GTPase mediated signal transduction
• GO:0072468 сигнальна трансдукція

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
116984
212285
Ensembl
ENSG00000047365
ENSMUSG00000037999
UniProt
Q8WZ64
Q8BZ05
RefSeq (мРНК)
NM_015230
NM_139182
NM_178407
RefSeq (білок)
NP_056045
н/д
Локус (UCSC) Хр. 4: 35.95 – 36.24 Mb Хр. 5: 62.76 – 62.92 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ARAP2 (англ. ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 704 амінокислот, а молекулярна маса — 193 452[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSSVSEVNVDIKDFLMSINLEQYLLHFHESGFTTVKDCAAINDSLLQKIG
ISPTGHRRRILKQLQIILSKMQDIPIYANVHKTKKNDDPSKDYHVPSSDQ
NICIELSNSGSVQTSSPPQLETVRKNLEDSDASVERSQYPQSDDKLSPPK
RDFPTAEEPHLNLGSLNDSLFGSDNIKIESLITKKTVDHTVEEQQTEKVK
LITENLSKLPNADSECLSFVGCSTSGTNSGNGTNGLLEGSPPSPFFKFQG
EMIVNDLYVPSSPILAPVRSRSKLVSRPSRSFLLRHRPVPEIPGSTKGVS
GSYFRERRNVATSTEKSVAWQNSNEENSSSIFPYGETFLFQRLENSKKRS
IKNEFLTQGEALKGEAATATNSFIIKSSIYDNRKEKISEDKVEDIWIPRE
DKNNFLIDTASESEYSTVEECFQSLRRKNSKASKSRTQKALILDSVNRHS
YPLSSTSGNADSSAVSSQAISPYACFYGASAKKVKSGWLDKLSPQGKRMF
QKRWVKFDGLSISYYNNEKEMYSKGIIPLSAISTVRVQGDNKFEVVTTQR
TFVFRVEKEEERNDWISILLNALKSQSLTSQSQAVVTPEKCGYLELRGYK
AKIFTVLSGNSVWLCKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEI
ITPYRSFSFTAETEKEKQDWIEAVQQSIAETLSDYEVAEKIWFNESNRSC
ADCKAPDPDWASINLCVVICKKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDASIWSNE
LIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGKFR
KTLLASLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMCATGDPVHSTP
YLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESSQSTFLCDFLY
QAPSAASKLSSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTININE
VICLAIHKEDFYLNTGPIFIFEIYLPSERVFLFGAETSQAQRKWTEAIAK
HFVPLFAENLTEADYDLIGQLFYKDCHALDQWRKGWFAMDKSSLHFCLQM
QEVQGDRMHLRRLQELTISTMVQNGEKLDVLLLVEKGRTLYIHGHTKLDF
TVWHTAIEKAAGTDGNALQDQQLSKNDVPIIVNSCIAFVTQYGLGCKYIY
QKNGDPLHISELLESFKKDARSFKLRAGKHQLEDVTAVLKSFLSDIDDAL
LTKELYPYWISALDTQDDKERIKKYGAFIRSLPGVNRATLAAIIEHLYRV
QKCSEINHMNAHNLALVFSSCLFQTKGQTSEEVNVIEDLINNYVEIFEVK
EDQVKQMDIENSFITKWKDTQVSQAGDLLIEVYVERKEPDCSIIIRISPV
MEAEELTNDILAIKNIIPTKGDIWATFEVIENEELERPLHYKENVLEQVL
RWSSLAEPGSAYLVVKRFLTADTIKHCSDRSTLGSIKEGILKIKEEPSKI
LSGNKFQDRYFVLRDGFLFLYKDVKSSKHDKMFSLSSMKFYRGVKKKMKP
PTSWGLTAYSEKHHWHLCCDSSRTQTEWMTSIFIAQHEYDIWPPAGKERK
RSITKNPKIGGLPLIPIQHEGNATLARKNIESARAELERLRLSEKCDKES
VDSSLKERASMVAHCLEHKDDKLRNRPRKHRSFNCLEDTEPEAPLGQPKG
HKGLKTLRKTEDRNSKATLDSDHKLPSRVIEELNVVLQRSRTLPKELQDE
QILK

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ARAP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16924 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  5. ↑ UniProt, Q8WZ64 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 4
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.