ARHGAP5 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2EE4, 2EE5 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ARHGAP5, GFI2, RhoGAP5, p190-B, p190BRhoGAP, Rho GTPase activating protein 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602680 MGI: 1332637 HomoloGene: 907 GeneCards: ARHGAP5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GTP binding • SH2 domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0006184 GTPase activity |
---|
Клітинна компонента | • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • адгезія клітин • regulation of small GTPase mediated signal transduction • Rho protein signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • mammary gland development • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 14: 32.08 – 32.16 Mb | Хр. 12: 52.55 – 52.62 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ARHGAP5 (англ. Rho GTPase activating protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 502 амінокислот, а молекулярна маса — 172 460[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MMAKNKEPRP | | PSYTISIVGL | | SGTEKDKGNC | | GVGKSCLCNR | | FVRSKADEYY |
PEHTSVLSTI | | DFGGRVVNND | | HFLYWGDIIQ | | NSEDGVECKI | | HVIEQTEFID |
DQTFLPHRST | | NLQPYIKRAA | | ASKLQSAEKL | | MYICTDQLGL | | EQDFEQKQMP |
EGKLNVDGFL | | LCIDVSQGCN | | RKFDDQLKFV | | NNLFVQLSKS | | KKPVIIAATK |
CDECVDHYLR | | EVQAFASNKK | | NLLVVETSAR | | FNVNIETCFT | | ALVQMLDKTR |
SKPKIIPYLD | | AYKTQRQLVV | | TATDKFEKLV | | QTVRDYHATW | | KTVSNKLKNH |
PDYEEYINLE | | GTRKARNTFS | | KHIEQLKQEH | | IRKRREEYIN | | TLPRAFNTLL |
PNLEEIEHLN | | WSEALKLMEK | | RADFQLCFVV | | LEKTPWDETD | | HIDKINDRRI |
PFDLLSTLEA | | EKVYQNHVQH | | LISEKRRVEM | | KEKFKKTLEK | | IQFISPGQPW |
EEVMCFVMED | | EAYKYITEAD | | SKEVYGRHQR | | EIVEKAKEEF | | QEMLFEHSEL |
FYDLDLNATP | | SSDKMSEIHT | | VLSEEPRYKA | | LQKLAPDRES | | LLLKHIGFVY |
HPTKETCLSG | | QNCTDIKVEQ | | LLASSLLQLD | | HGRLRLYHDS | | TNIDKVNLFI |
LGKDGLAQEL | | ANEIRTQSTD | | DEYALDGKIY | | ELDLRPVDAK | | SPYFLSQLWT |
AAFKPHGCFC | | VFNSIESLSF | | IGEFIGKIRT | | EASQIRKDKY | | MANLPFTLIL |
ANQRDSISKN | | LPILRHQGQQ | | LANKLQCPFV | | DVPAGTYPRK | | FNETQIKQAL |
RGVLESVKHN | | LDVVSPIPAN | | KDLSEADLRI | | VMCAMCGDPF | | SVDLILSPFL |
DSHSCSAAQA | | GQNNSLMLDK | | IIGEKRRRIQ | | ITILSYHSSI | | GVRKDELVHG |
YILVYSAKRK | | ASMGMLRAFL | | SEVQDTIPVQ | | LVAVTDSQAD | | FFENEAIKEL |
MTEGEHIATE | | ITAKFTALYS | | LSQYHRQTEV | | FTLFFSDVLE | | KKNMIENSYL |
SDNTRESTHQ | | SEDVFLPSPR | | DCFPYNNYPD | | SDDDTEAPPP | | YSPIGDDVQL |
LPTPSDRSRY | | RLDLEGNEYP | | IHSTPNCHDH | | ERNHKVPPPI | | KPKPVVPKTN |
VKKLDPNLLK | | TIEAGIGKNP | | RKQTSRVPLA | | HPEDMDPSDN | | YAEPIDTIFK |
QKGYSDEIYV | | VPDDSQNRIK | | IRNSFVNNTQ | | GDEENGFSDR | | TSKSHGERRP |
SKYKYKSKTL | | FSKAKSYYRR | | THSDASDDEA | | FTTSKTKRKG | | RHRGSEEDPL |
LSPVETWKGG | | IDNPAITSDQ | | ELDDKKMKKK | | THKVKEDKKQ | | KKKTKNFNPP |
TRRNWESNYF | | GMPLQDLVTA | | EKPIPLFVEK | | CVEFIEDTGL | | CTEGLYRVSG |
NKTDQDNIQK | | QFDQDHNINL | | VSMEVTVNAV | | AGALKAFFAD | | LPDPLIPYSL |
HPELLEAAKI | | PDKTERLHAL | | KEIVKKFHPV | | NYDVFRYVIT | | HLNRVSQQHK |
INLMTADNLS | | ICFWPTLMRP | | DFENREFLST | | TKIHQSVVET | | FIQQCQFFFY |
NGEIVETTNI | | VAPPPPSNPG | | QLVEPMVPLQ | | LPPPLQPQLI | | QPQLQTDPLG |
II |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhan X., Desiderio D.M. (2006). Nitroproteins from a human pituitary adenoma tissue discovered with a nitrotyrosine affinity column and tandem mass spectrometry. Anal. Biochem. 354: 279—289. PMID 16777052 DOI:10.1016/j.ab.2006.05.024
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:675 (англ.) . Архів оригіналу за 1 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13017 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |