ARHGAP5

ARHGAP5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2EE4, 2EE5

Ідентифікатори
Символи ARHGAP5, GFI2, RhoGAP5, p190-B, p190BRhoGAP, Rho GTPase activating protein 5
Зовнішні ІД OMIM: 602680 MGI: 1332637 HomoloGene: 907 GeneCards: ARHGAP5
Онтологія гена
Молекулярна функція

GTP binding
SH2 domain binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity
GO:0006184 GTPase activity

Клітинна компонента

ендоплазматичний ретикулум
мембрана
цитоплазма
гіалоплазма
клітинна мембрана

Біологічний процес

адгезія клітин
regulation of small GTPase mediated signal transduction
Rho protein signal transduction
GO:0072468 сигнальна трансдукція
mammary gland development
GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
394
11855
Ensembl
ENSG00000100852
ENSMUSG00000035133
UniProt
Q13017
P97393
RefSeq (мРНК)
NM_001030055
NM_001173
NM_009706
RefSeq (білок)
NP_001025226
NP_001164
NP_033836
Локус (UCSC) Хр. 14: 32.08 – 32.16 Mb Хр. 12: 52.55 – 52.62 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ARHGAP5 (англ. Rho GTPase activating protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 502 амінокислот, а молекулярна маса — 172 460[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MMAKNKEPRPPSYTISIVGLSGTEKDKGNCGVGKSCLCNRFVRSKADEYY
PEHTSVLSTIDFGGRVVNNDHFLYWGDIIQNSEDGVECKIHVIEQTEFID
DQTFLPHRSTNLQPYIKRAAASKLQSAEKLMYICTDQLGLEQDFEQKQMP
EGKLNVDGFLLCIDVSQGCNRKFDDQLKFVNNLFVQLSKSKKPVIIAATK
CDECVDHYLREVQAFASNKKNLLVVETSARFNVNIETCFTALVQMLDKTR
SKPKIIPYLDAYKTQRQLVVTATDKFEKLVQTVRDYHATWKTVSNKLKNH
PDYEEYINLEGTRKARNTFSKHIEQLKQEHIRKRREEYINTLPRAFNTLL
PNLEEIEHLNWSEALKLMEKRADFQLCFVVLEKTPWDETDHIDKINDRRI
PFDLLSTLEAEKVYQNHVQHLISEKRRVEMKEKFKKTLEKIQFISPGQPW
EEVMCFVMEDEAYKYITEADSKEVYGRHQREIVEKAKEEFQEMLFEHSEL
FYDLDLNATPSSDKMSEIHTVLSEEPRYKALQKLAPDRESLLLKHIGFVY
HPTKETCLSGQNCTDIKVEQLLASSLLQLDHGRLRLYHDSTNIDKVNLFI
LGKDGLAQELANEIRTQSTDDEYALDGKIYELDLRPVDAKSPYFLSQLWT
AAFKPHGCFCVFNSIESLSFIGEFIGKIRTEASQIRKDKYMANLPFTLIL
ANQRDSISKNLPILRHQGQQLANKLQCPFVDVPAGTYPRKFNETQIKQAL
RGVLESVKHNLDVVSPIPANKDLSEADLRIVMCAMCGDPFSVDLILSPFL
DSHSCSAAQAGQNNSLMLDKIIGEKRRRIQITILSYHSSIGVRKDELVHG
YILVYSAKRKASMGMLRAFLSEVQDTIPVQLVAVTDSQADFFENEAIKEL
MTEGEHIATEITAKFTALYSLSQYHRQTEVFTLFFSDVLEKKNMIENSYL
SDNTRESTHQSEDVFLPSPRDCFPYNNYPDSDDDTEAPPPYSPIGDDVQL
LPTPSDRSRYRLDLEGNEYPIHSTPNCHDHERNHKVPPPIKPKPVVPKTN
VKKLDPNLLKTIEAGIGKNPRKQTSRVPLAHPEDMDPSDNYAEPIDTIFK
QKGYSDEIYVVPDDSQNRIKIRNSFVNNTQGDEENGFSDRTSKSHGERRP
SKYKYKSKTLFSKAKSYYRRTHSDASDDEAFTTSKTKRKGRHRGSEEDPL
LSPVETWKGGIDNPAITSDQELDDKKMKKKTHKVKEDKKQKKKTKNFNPP
TRRNWESNYFGMPLQDLVTAEKPIPLFVEKCVEFIEDTGLCTEGLYRVSG
NKTDQDNIQKQFDQDHNINLVSMEVTVNAVAGALKAFFADLPDPLIPYSL
HPELLEAAKIPDKTERLHALKEIVKKFHPVNYDVFRYVITHLNRVSQQHK
INLMTADNLSICFWPTLMRPDFENREFLSTTKIHQSVVETFIQQCQFFFY
NGEIVETTNIVAPPPPSNPGQLVEPMVPLQLPPPLQPQLIQPQLQTDPLG
II

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Zhan X., Desiderio D.M. (2006). Nitroproteins from a human pituitary adenoma tissue discovered with a nitrotyrosine affinity column and tandem mass spectrometry. Anal. Biochem. 354: 279—289. PMID 16777052 DOI:10.1016/j.ab.2006.05.024

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:675 (англ.) . Архів оригіналу за 1 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, Q13017 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 14
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.