| ARHGEF2 |
|---|
|
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | ARHGEF2, GEF, GEF-H1, GEFH1, LFP40, P40, Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 2, NEDMHM, Lfc |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 607560 MGI: 103264 HomoloGene: 3468 GeneCards: ARHGEF2 |
|---|
| |
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| бічний аміотрофічний склероз[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • microtubule binding
• zinc ion binding
• transcription factor binding
• зв'язування з іоном металу
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• guanyl-nucleotide exchange factor activity
|
|---|
| Клітинна компонента | • цитоплазма
• везикула
• гіалоплазма
• комплекс Ґольджі
• cell projection
• мембрана
• focal adhesion
• bicellular tight junction
• веретено поділу
• клітинна мембрана
• dendritic shaft
• ruffle membrane
• міжклітинні контакти
• neuronal cell body
• мікротрубочка
• цитоскелет
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• podosome
• GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
• GO:0009327 protein-containing complex
• glutamatergic synapse
• postsynaptic density, intracellular component
|
|---|
| Біологічний процес | • GO:0007243 intracellular signal transduction
• negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to osmotic stress
• negative regulation of necroptotic process
• actin filament organization
• процес імунної системи
• negative regulation of neurogenesis
• cellular response to tumor necrosis factor
• поділ клітини
• cellular response to muramyl dipeptide
• cellular hyperosmotic response
• negative regulation of microtubule depolymerization
• regulation of cell population proliferation
• positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors
• GO:0000767 cell morphogenesis
• establishment of mitotic spindle orientation
• positive regulation of interleukin-6 production
• positive regulation of tumor necrosis factor production
• positive regulation of apoptotic process
• positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation
• клітинний цикл
• regulation of Rho protein signal transduction
• intracellular protein transport
• вроджений імунітет
• regulation of small GTPase mediated signal transduction
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• negative regulation of podosome assembly
• G protein-coupled receptor signaling pathway
• positive regulation of neuron differentiation
• asymmetric neuroblast division
• positive regulation of neuron migration
• multicellular organism development
• нейробіологія розвитку
• диференціація клітин
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | NM_001162383
NM_001162384
NM_004723
NM_001350110
NM_001350111
| | NM_001350112 |
| | NM_001198911
NM_001198912
NM_001198913
NM_008487
NM_001377126 |
|
|---|
| RefSeq (білок) | NP_001155855
NP_001155856
NP_004714
NP_001337039
NP_001337040
| | NP_001337041 |
| | NP_001185840
NP_001185841
NP_001185842
NP_032513
NP_001364055 |
|
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 1: 155.95 – 156.01 Mb | Хр. 3: 88.51 – 88.56 Mb |
|---|
| PubMed search | [2] | [3] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ARHGEF2 (англ. Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 986 амінокислот, а молекулярна маса — 111 543[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MSRIESLTRA | | RIDRSRELAS | | KTREKEKMKE | | AKDARYTNGH | | LFTTISVSGM |
| TMCYACNKSI | | TAKEALICPT | | CNVTIHNRCK | | DTLANCTKVK | | QKQQKAALLK |
| NNTALQSVSL | | RSKTTIRERP | | SSAIYPSDSF | | RQSLLGSRRG | | RSSLSLAKSV |
| STTNIAGHFN | | DESPLGLRRI | | LSQSTDSLNM | | RNRTLSVESL | | IDEAEVIYSE |
| LMSDFEMDEK | | DFAADSWSLA | | VDSSFLQQHK | | KEVMKQQDVI | | YELIQTELHH |
| VRTLKIMTRL | | FRTGMLEELH | | LEPGVVQGLF | | PCVDELSDIH | | TRFLSQLLER |
| RRQALCPGST | | RNFVIHRLGD | | LLISQFSGPS | | AEQMCKTYSE | | FCSRHSKALK |
| LYKELYARDK | | RFQQFIRKVT | | RPAVLKRHGV | | QECILLVTQR | | ITKYPLLISR |
| ILQHSHGIEE | | ERQDLTTALG | | LVKELLSNVD | | EGIYQLEKGA | | RLQEIYNRMD |
| PRAQTPVPGK | | GPFGREELLR | | RKLIHDGCLL | | WKTATGRFKD | | VLVLLMTDVL |
| VFLQEKDQKY | | IFPTLDKPSV | | VSLQNLIVRD | | IANQEKGMFL | | ISAAPPEMYE |
| VHTASRDDRS | | TWIRVIQQSV | | RTCPSREDFP | | LIETEDEAYL | | RRIKMELQQK |
| DRALVELLRE | | KVGLFAEMTH | | FQAEEDGGSG | | MALPTLPRGL | | FRSESLESPR |
| GERLLQDAIR | | EVEGLKDLLV | | GPGVELLLTP | | REPALPLEPD | | SGGNTSPGVT |
| ANGEARTFNG | | SIELCRADSD | | SSQRDRNGNQ | | LRSPQEEALQ | | RLVNLYGLLH |
| GLQAAVAQQD | | TLMEARFPEG | | PERREKLCRA | | NSRDGEAGRA | | GAAPVAPEKQ |
| ATELALLQRQ | | HALLQEELRR | | CRRLGEERAT | | EAGSLEARLR | | ESEQARALLE |
| REAEEARRQL | | AALGQTEPLP | | AEAPWARRPV | | DPRRRSLPAG | | DALYLSFNPP |
| QPSRGTDRLD | | LPVTTRSVHR | | NFEDRERQEL | | GSPEERLQDS | | SDPDTGSEEE |
| GSSRLSPPHS | | PRDFTRMQDI | | PEETESRDGE | | AVASES |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, щільних контактах.
Література
- Ren Y., Li R., Zheng Y., Busch H. (1998). Cloning and characterization of GEF-H1, a microtubule-associated guanine nucleotide exchange factor for Rac and Rho GTPases. J. Biol. Chem. 273: 34954—34960. PMID 9857026 DOI:10.1074/jbc.273.52.34954
- Krendel M., Zenke F.T., Bokoch G.M. (2002). Nucleotide exchange factor GEF-H1 mediates cross-talk between microtubules and the actin cytoskeleton. Nat. Cell Biol. 4: 294—301. PMID 11912491 DOI:10.1038/ncb773
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Callow M.G., Zozulya S., Gishizky M.L., Jallal B., Smeal T. (2005). PAK4 mediates morphological changes through the regulation of GEF-H1. J. Cell Sci. 118: 1861—1872. PMID 15827085 DOI:10.1242/jcs.02313
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Birkenfeld J., Nalbant P., Yoon S.-H., Bokoch G.M. (2008). Cellular functions of GEF-H1, a microtubule-regulated Rho-GEF: is altered GEF-H1 activity a crucial determinant of disease pathogenesis?. Trends Cell Biol. 18: 210—219. PMID 18394899 DOI:10.1016/j.tcb.2008.02.006
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ARHGEF2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:682 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q92974 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
| На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
