ARHGEF5

Ідентифікатори

Символи

ARHGEF5, GEF5, P60, TIM, TIM1, Rho guanine nucleotide exchange factor 5

Зовнішні ІД

OMIM: 600888 MGI: 1858952 HomoloGene: 66300 GeneCards: ARHGEF5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipid binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • cell projection • клітинна мембрана • нуклеоплазма • міжклітинні контакти • podosome • клітинне ядро • cell periphery • гіалоплазма
Біологічний процес	• GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of actin cytoskeleton organization • positive regulation of JUN kinase activity • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of podosome assembly • myeloid dendritic cell chemotaxis • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • positive regulation of protein import • regulation of ERK1 and ERK2 cascade • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of cytoskeleton organization • actin cytoskeleton organization • positive regulation of stress fiber assembly • positive regulation of apoptotic process • regulation of small GTPase mediated signal transduction • G protein-coupled receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7984


54324

Ensembl


ENSG00000050327


ENSMUSG00000033542

UniProt


Q12774


E9Q7D5

RefSeq (мРНК)


NM_001002861 NM_005435


NM_133674

RefSeq (білок)


NP_005426


NP_598435

Локус (UCSC)

Хр. 7: 144.36 – 144.38 Mb

Хр. 6: 43.24 – 43.27 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ARHGEF5 (англ. Rho guanine nucleotide exchange factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 597 амінокислот, а молекулярна маса — 176 799^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAEEAQRGA	SPPISAIEEF	SIIPEAPMRS	SQVSALGLEA	QEDEDPSYKW
REEHRLSATQ	QSELRDVCDY	AIETMPSFPK	EGSADVEPNQ	ESLVAEACDT
PEHWEAVPQS	LAGRQARTLA	PPELWACPIQ	SEHLDMAPFS	SDLGSEEEEV
EFWPGLTSLT	LGSGQAEEEE	ETSSDNSGQT	RYYSPCEEHP	AETNQNEGSE
SGTIRQGEEL	PPEELQESQG	LLHPQEVQVL	EEQGQQEAGF	RGEGTLREDV
CADGLLGEEQ	MIEQVNDEKG	EQKQKQEQVQ	DVMLGRQGER	MGLTGEPEGL
NDGEWEQEDM	ERKAQGQGGP	EQGEERKREL	QVPEENRADS	QDEKSQTFLG
KSEEVTGKQE	DHGIKEKGVP	VSGQEAKEPE	SWDGGRLGAV	GRARSREEEN
EHHGPSMPAL	IAPEDSPHCD	LFPGASYLMT	QIPGTQTESR	AEELSPAALS
PSLEPIRCSH	QPISLLGSFL	TEESPDKEID	QNSQQEESRL	RKGTVSSQGT
EVVFASASVT	PPRTPDSAPP	SPAEAYPITP	ASVSARPPVA	FPRRETSCAA
RAPETASAPL	SMDDPSPCGT	SEMCPAALYG	FPSTGTSPPR	PPANSTGTVQ
HLRSDSFPGS	HRTEQTPDLV	GMLLSYSHSE	LPQRPPKPAI	YSSVTPRRDR
RSGRDYSTVS	ASPTALSTLK	QDSQESISNL	ERPSSPPSIQ	PWVSPHNPAF
ATESPAYGSS	PSFVSMEDVR	IHEPLPPPPP	QRRDTHPSVV	ETDGHARVVV
PTLKQHSHPP	PLALGSGLHA	PHKGPLPQAS	DPAVARQHRP	LPSTPDSSHH
AQATPRWRYN	KPLPPTPDLP	QPHLPPISAP	GSSRIYRPLP	PLPIIDPPTE
PPPLPPKSRG	RSRSTRGGHM	NSGGHAKTRP	ACQDWTVPLP	ASAGRTSWPP
ATARSTESFT	STSRSKSEVS	PGMAFSNMTN	FLCPSSPTTP	WTPELQGPTS
KDEAGVSEHP	EAPAREPLRR	TTPQQGASGP	GRSPVGQARQ	PEKPSHLHLE
KASSWPHRRD	SGRPPGDSSG	QAVAPSEGAN	KHKGWSRQGL	RRPSILPEGS
SDSRGPAVEK	HPGPSDTVVF	REKKPKEVMG	GFSRRCSKLI	NSSQLLYQEY
SDVVLNKEIQ	SQQRLESLSE	TPGPSSPRQP	RKALVSSESY	LQRLSMASSG
SLWQEIPVVR	NSTVLLSMTH	EDQKLQEVKF	ELIVSEASYL	RSLNIAVDHF
QLSTSLRATL	SNQEHQWLFS	RLQDVRDVSA	TFLSDLEENF	ENNIFSFQVC
DVVLNHAPDF	RRVYLPYVTN	QTYQERTFQS	LMNSNSNFRE	VLEKLESDPV
CQRLSLKSFL	ILPFQRITRL	KLLLQNILKR	TQPGSSEEAE	ATKAHHALEQ
LIRDCNNNVQ	SMRRTEELIY	LSQKIEFECK	IFPLISQSRW	LVKSGELTAL
EFSASPGLRR	KLNTRPVHLH	LFNDCLLLSR	PREGSRFLVF	DHAPFSSIRG
EKCEMKLHGP	HKNLFRLFLR	QNTQGAQAEF	LFRTETQSEK	LRWISALAMP
REELDLLECY	NSPQVQCLRA	YKPRENDELA	LEKADVVMVT	QQSSDGWLEG
VRLSDGERGW	FPVQQVEFIS	NPEVRAQNLK	EAHRVKTAKL	QLVEQQA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Xie X., Chang S.W., Tatsumoto T., Chan A.M., Miki T. (2005). TIM, a Dbl-related protein, regulates cell shape and cytoskeletal organization in a Rho-dependent manner. Cell. Signal. 17: 461—471. PMID 15601624 DOI:10.1016/j.cellsig.2004.09.012
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Chan A.M.-L., McGovern E.S., Catalano G., Fleming T.P., Miki T. (1994). Expression cDNA cloning of a novel oncogene with sequence similarity to regulators of small GTP-binding proteins. Oncogene. 9: 1057—1063. PMID 8134109

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13209 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q12774 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2018. Процитовано 7 вересня 2017.