ARHGEF5 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ARHGEF5, GEF5, P60, TIM, TIM1, Rho guanine nucleotide exchange factor 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600888 MGI: 1858952 HomoloGene: 66300 GeneCards: ARHGEF5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipid binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • cell projection • клітинна мембрана • нуклеоплазма • міжклітинні контакти • podosome • клітинне ядро • cell periphery • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of actin cytoskeleton organization • positive regulation of JUN kinase activity • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of podosome assembly • myeloid dendritic cell chemotaxis • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • positive regulation of protein import • regulation of ERK1 and ERK2 cascade • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of cytoskeleton organization • actin cytoskeleton organization • positive regulation of stress fiber assembly • positive regulation of apoptotic process • regulation of small GTPase mediated signal transduction • G protein-coupled receptor signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/37/PBB_GE_ARHGEF5_204765_at_fs.png/250px-PBB_GE_ARHGEF5_204765_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 144.36 – 144.38 Mb | Хр. 6: 43.24 – 43.27 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ARHGEF5 (англ. Rho guanine nucleotide exchange factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 597 амінокислот, а молекулярна маса — 176 799[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEAEEAQRGA | | SPPISAIEEF | | SIIPEAPMRS | | SQVSALGLEA | | QEDEDPSYKW |
REEHRLSATQ | | QSELRDVCDY | | AIETMPSFPK | | EGSADVEPNQ | | ESLVAEACDT |
PEHWEAVPQS | | LAGRQARTLA | | PPELWACPIQ | | SEHLDMAPFS | | SDLGSEEEEV |
EFWPGLTSLT | | LGSGQAEEEE | | ETSSDNSGQT | | RYYSPCEEHP | | AETNQNEGSE |
SGTIRQGEEL | | PPEELQESQG | | LLHPQEVQVL | | EEQGQQEAGF | | RGEGTLREDV |
CADGLLGEEQ | | MIEQVNDEKG | | EQKQKQEQVQ | | DVMLGRQGER | | MGLTGEPEGL |
NDGEWEQEDM | | ERKAQGQGGP | | EQGEERKREL | | QVPEENRADS | | QDEKSQTFLG |
KSEEVTGKQE | | DHGIKEKGVP | | VSGQEAKEPE | | SWDGGRLGAV | | GRARSREEEN |
EHHGPSMPAL | | IAPEDSPHCD | | LFPGASYLMT | | QIPGTQTESR | | AEELSPAALS |
PSLEPIRCSH | | QPISLLGSFL | | TEESPDKEID | | QNSQQEESRL | | RKGTVSSQGT |
EVVFASASVT | | PPRTPDSAPP | | SPAEAYPITP | | ASVSARPPVA | | FPRRETSCAA |
RAPETASAPL | | SMDDPSPCGT | | SEMCPAALYG | | FPSTGTSPPR | | PPANSTGTVQ |
HLRSDSFPGS | | HRTEQTPDLV | | GMLLSYSHSE | | LPQRPPKPAI | | YSSVTPRRDR |
RSGRDYSTVS | | ASPTALSTLK | | QDSQESISNL | | ERPSSPPSIQ | | PWVSPHNPAF |
ATESPAYGSS | | PSFVSMEDVR | | IHEPLPPPPP | | QRRDTHPSVV | | ETDGHARVVV |
PTLKQHSHPP | | PLALGSGLHA | | PHKGPLPQAS | | DPAVARQHRP | | LPSTPDSSHH |
AQATPRWRYN | | KPLPPTPDLP | | QPHLPPISAP | | GSSRIYRPLP | | PLPIIDPPTE |
PPPLPPKSRG | | RSRSTRGGHM | | NSGGHAKTRP | | ACQDWTVPLP | | ASAGRTSWPP |
ATARSTESFT | | STSRSKSEVS | | PGMAFSNMTN | | FLCPSSPTTP | | WTPELQGPTS |
KDEAGVSEHP | | EAPAREPLRR | | TTPQQGASGP | | GRSPVGQARQ | | PEKPSHLHLE |
KASSWPHRRD | | SGRPPGDSSG | | QAVAPSEGAN | | KHKGWSRQGL | | RRPSILPEGS |
SDSRGPAVEK | | HPGPSDTVVF | | REKKPKEVMG | | GFSRRCSKLI | | NSSQLLYQEY |
SDVVLNKEIQ | | SQQRLESLSE | | TPGPSSPRQP | | RKALVSSESY | | LQRLSMASSG |
SLWQEIPVVR | | NSTVLLSMTH | | EDQKLQEVKF | | ELIVSEASYL | | RSLNIAVDHF |
QLSTSLRATL | | SNQEHQWLFS | | RLQDVRDVSA | | TFLSDLEENF | | ENNIFSFQVC |
DVVLNHAPDF | | RRVYLPYVTN | | QTYQERTFQS | | LMNSNSNFRE | | VLEKLESDPV |
CQRLSLKSFL | | ILPFQRITRL | | KLLLQNILKR | | TQPGSSEEAE | | ATKAHHALEQ |
LIRDCNNNVQ | | SMRRTEELIY | | LSQKIEFECK | | IFPLISQSRW | | LVKSGELTAL |
EFSASPGLRR | | KLNTRPVHLH | | LFNDCLLLSR | | PREGSRFLVF | | DHAPFSSIRG |
EKCEMKLHGP | | HKNLFRLFLR | | QNTQGAQAEF | | LFRTETQSEK | | LRWISALAMP |
REELDLLECY | | NSPQVQCLRA | | YKPRENDELA | | LEKADVVMVT | | QQSSDGWLEG |
VRLSDGERGW | | FPVQQVEFIS | | NPEVRAQNLK | | EAHRVKTAKL | | QLVEQQA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах, клітинних відростках.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Xie X., Chang S.W., Tatsumoto T., Chan A.M., Miki T. (2005). TIM, a Dbl-related protein, regulates cell shape and cytoskeletal organization in a Rho-dependent manner. Cell. Signal. 17: 461—471. PMID 15601624 DOI:10.1016/j.cellsig.2004.09.012
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Chan A.M.-L., McGovern E.S., Catalano G., Fleming T.P., Miki T. (1994). Expression cDNA cloning of a novel oncogene with sequence similarity to regulators of small GTP-binding proteins. Oncogene. 9: 1057—1063. PMID 8134109
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13209 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q12774 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2018. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |