ARID4B

Ідентифікатори

Символи

ARID4B, BCAA, BRCAA1, RBBP1L1, RBP1L1, SAP180, AT-rich interaction domain 4B

Зовнішні ІД

OMIM: 609696 MGI: 2137512 HomoloGene: 12847 GeneCards: ARID4B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone deacetylase activity • молекулярна функція • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • компонент клітини
Біологічний процес	• regulation of gene expression by genetic imprinting • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • establishment of Sertoli cell barrier • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H4-K20 trimethylation • transcription, DNA-templated • histone H3-K9 trimethylation • Сперматогенез • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • histone deacetylation • GO:0022610 життєдіяльність • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51742


94246

Ensembl


ENSG00000054267


ENSMUSG00000039219

UniProt


Q4LE39


A2CG63

RefSeq (мРНК)


NM_001206794 NM_016374 NM_031371


NM_194262 NM_198122

RefSeq (білок)


NP_001193723 NP_057458 NP_112739


NP_919238 NP_937755

Локус (UCSC)

Хр. 1: 235.13 – 235.33 Mb

Хр. 13: 14.24 – 14.37 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ARID4B (англ. AT-rich interaction domain 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 312 амінокислот, а молекулярна маса — 147 809^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKALDEPPYL	TVGTDVSAKY	RGAFCEAKIK	TAKRLVKVKV	TFRHDSSTVE
VQDDHIKGPL	KVGAIVEVKN	LDGAYQEAVI	NKLTDASWYT	VVFDDGDEKT
LRRSSLCLKG	ERHFAESETL	DQLPLTNPEH	FGTPVIGKKT	NRGRRSNHIP
EEESSSSSSD	EDEDDRKQID	ELLGKVVCVD	YISLDKKKAL	WFPALVVCPD
CSDEIAVKKD	NILVRSFKDG	KFTSVPRKDV	HEITSDTAPK	PDAVLKQAFE
QALEFHKSRT	IPANWKTELK	EDSSSSEAEE	EEEEEDDEKE	KEDNSSEEEE
EIEPFPEERE	NFLQQLYKFM	EDRGTPINKR	PVLGYRNLNL	FKLFRLVHKL
GGFDNIESGA	VWKQVYQDLG	IPVLNSAAGY	NVKCAYKKYL	YGFEEYCRSA
NIEFQMALPE	KVVNKQCKEC	ENVKEIKVKE	ENETEIKEIK	MEEERNIIPR
EEKPIEDEIE	RKENIKPSLG	SKKNLLESIP	THSDQEKEVN	IKKPEDNENL
DDKDDDTTRV	DESLNIKVEA	EEEKAKSGDE	TNKEEDEDDE	EAEEEEEEEE
EEEDEDDDDN	NEEEEFECYP	PGMKVQVRYG	RGKNQKMYEA	SIKDSDVEGG
EVLYLVHYCG	WNVRYDEWIK	ADKIVRPADK	NVPKIKHRKK	IKNKLDKEKD
KDEKYSPKNC	KLRRLSKPPF	QTNPSPEMVS	KLDLTDAKNS	DTAHIKSIEI
TSILNGLQAS	ESSAEDSEQE	DERGAQDMDN	NGKEESKIDH	LTNNRNDLIS
KEEQNSSSLL	EENKVHADLV	ISKPVSKSPE	RLRKDIEVLS	EDTDYEEDEV
TKKRKDVKKD	TTDKSSKPQI	KRGKRRYCNT	EECLKTGSPG	KKEEKAKNKE
SLCMENSSNS	SSDEDEEETK	AKMTPTKKYN	GLEEKRKSLR	TTGFYSGFSE
VAEKRIKLLN	NSDERLQNSR	AKDRKDVWSS	IQGQWPKKTL	KELFSDSDTE
AAASPPHPAP	EEGVAEESLQ	TVAEEESCSP	SVELEKPPPV	NVDSKPIEEK
TVEVNDRKAE	FPSSGSNSVL	NTPPTTPESP	SSVTVTEGSR	QQSSVTVSEP
LAPNQEEVRS	IKSETDSTIE	VDSVAGELQD	LQSEGNSSPA	GFDASVSSSS
SNQPEPEHPE	KACTGQKRVK	DAQGGGSSSK	KQKRSHKATV	VNNKKKGKGT
NSSDSEELSA	GESITKSQPV	KSVSTGMKSH	STKSPARTQS	PGKCGKNGDK
DPDLKEPSNR	LPKVYKWSFQ	MSDLENMTSA	ERITILQEKL	QEIRKHYLSL
KSEVASIDRR	RKRLKKKERE	SAATSSSSSS	PSSSSITAAV	MLTLAEPSMS
SASQNGMSVE	CR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Cao J.-N., Gao T.-W., Stanbridge E.J., Irie R. (2001). RBP1L1, a retinoblastoma-binding protein-related gene encoding an antigenic epitope abundantly expressed in human carcinomas and normal testis. J. Natl. Cancer Inst. 93: 1159—1165. PMID 11481388 DOI:10.1093/jnci/93.15.1159
Fleischer T.C., Yun U.J., Ayer D.E. (2003). Identification and characterization of three new components of the mSin3A corepressor complex. Mol. Cell. Biol. 23: 3456—3467. PMID 12724404 DOI:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15550 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q4LE39 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.