ARIH1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1WD2, 2M9Y, 4KBL, 4KC9 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ARIH1, ARI, HARI, HHARI, UBCH7BP, ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605624 MGI: 1344363 HomoloGene: 111871 GeneCards: ARIH1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • ubiquitin-like protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • ubiquitin protein ligase binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • ubiquitin conjugating enzyme binding • zinc ion binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ubiquitin ligase complex • гіалоплазма • клітинне ядро • Тільце Кахаля • ядерні тільця • SCF ubiquitin ligase complex • Cul2-RING ubiquitin ligase complex • Cul3-RING ubiquitin ligase complex • Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex • Тільця Леві |
---|
Біологічний процес | • protein polyubiquitination • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 72.47 – 72.6 Mb | Хр. 9: 59.3 – 59.39 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ARIH1 (англ. Ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 557 амінокислот, а молекулярна маса — 64 118[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDSDEGYNYE | | FDEDEECSEE | | DSGAEEEEDE | | DDDEPDDDTL | | DLGEVELVEP |
GLGVGGERDG | | LLCGETGGGG | | GSALGPGGGG | | GGGGGGGGGG | | PGHEQEEDYR |
YEVLTAEQIL | | QHMVECIREV | | NEVIQNPATI | | TRILLSHFNW | | DKEKLMERYF |
DGNLEKLFAE | | CHVINPSKKS | | RTRQMNTRSS | | AQDMPCQICY | | LNYPNSYFTG |
LECGHKFCMQ | | CWSEYLTTKI | | MEEGMGQTIS | | CPAHGCDILV | | DDNTVMRLIT |
DSKVKLKYQH | | LITNSFVECN | | RLLKWCPAPD | | CHHVVKVQYP | | DAKPVRCKCG |
RQFCFNCGEN | | WHDPVKCKWL | | KKWIKKCDDD | | SETSNWIAAN | | TKECPKCHVT |
IEKDGGCNHM | | VCRNQNCKAE | | FCWVCLGPWE | | PHGSAWYNCN | | RYNEDDAKAA |
RDAQERSRAA | | LQRYLFYCNR | | YMNHMQSLRF | | EHKLYAQVKQ | | KMEEMQQHNM |
SWIEVQFLKK | | AVDVLCQCRA | | TLMYTYVFAF | | YLKKNNQSII | | FENNQADLEN |
ATEVLSGYLE | | RDISQDSLQD | | IKQKVQDKYR | | YCESRRRVLL | | QHVHEGYEKD |
LWEYIED |
Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ardley H.C., Tan N.G.S., Rose S.A., Markham A.F., Robinson P.A. (2001). Features of the parkin/ariadne-like ubiquitin ligase, HHARI, that regulate its interaction with the ubiquitin-conjugating enzyme, Ubch7. J. Biol. Chem. 276: 19640—19647. PMID 11278816 DOI:10.1074/jbc.M011028200
- Okumura F., Zou W., Zhang D.E. (2007). ISG15 modification of the eIF4E cognate 4EHP enhances cap structure-binding activity of 4EHP. Genes Dev. 21: 255—260. PMID 17289916 DOI:10.1101/gad.1521607
- Wenzel D.M., Lissounov A., Brzovic P.S., Klevit R.E. (2011). UBCH7 reactivity profile reveals parkin and HHARI to be RING/HECT hybrids. Nature. 474: 105—108. PMID 21532592 DOI:10.1038/nature09966
- Capili A.D., Edghill E.L., Wu K., Borden K.L. (2004). Structure of the C-terminal RING finger from a RING-IBR-RING/TRIAD motif reveals a novel zinc-binding domain distinct from a RING. J. Mol. Biol. 340: 1117—1129. PMID 15236971 DOI:10.1016/j.jmb.2004.05.035
- Spratt D.E., Mercier P., Shaw G.S. (2013). Structure of the HHARI catalytic domain shows glimpses of a HECT E3 ligase. PLoS ONE. 8: E74047—E74047. PMID 24058416 DOI:10.1371/journal.pone.0074047
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:689 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9Y4X5 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |