ATG10 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

ATG10

Ідентифікатори

Символи

ATG10, APG10, APG10L, pp12616, autophagy related 10

Зовнішні ІД

OMIM: 610800 MGI: 1914045 HomoloGene: 12036 GeneCards: ATG10

Онтологія гена
Молекулярна функція	• Atg12 transferase activity • transferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• автофагія • protein transport • protein modification by small protein conjugation • macroautophagy • positive regulation of protein modification process • ER overload response • protein lipidation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


83734


66795

Ensembl


ENSG00000152348


ENSMUSG00000021619

UniProt


Q9H0Y0


Q8R1P4

RefSeq (мРНК)


NM_001131028 NM_031482


NM_025770

RefSeq (білок)


NP_001124500 NP_113670

NP_080046 NP_001391846 NP_001391847 NP_001391848 NP_001391849
NP_001391850 NP_001391851 NP_001391852 NP_001391854 NP_001391855 NP_001391856 NP_001391857

Локус (UCSC)

Хр. 5: 81.97 – 82.28 Mb

Хр. 13: 91.08 – 91.37 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ATG10 (англ. Autophagy related 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 220 амінокислот, а молекулярна маса — 25 279^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEEDEFIGEK	TFQRYCAEFI	KHSQQIGDSW	EWRPSKDCSD	GYMCKIHFQI
KNGSVMSHLG	ASTHGQTCLP	MEEAFELPLD	DCEVIETAAA	SEVIKYEYHV
LYSCSYQVPV	LYFRASFLDG	RPLTLKDIWE	GVHECYKMRL	LQGPWDTITQ
QEHPILGQPF	FVLHPCKTNE	FMTPVLKNSQ	KINKNVNYIT	SWLSIVGPVV
GLNLPLSYAK	ATSQDERNVP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до лігаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20315 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H0Y0 (англ.) . Архів оригіналу за 25 жовтня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.