ATG3

ATG3
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4NAW

Ідентифікатори
Символи ATG3, APG3-LIKE, APG3, autophagy related 3, APG3L, PC3-96
Зовнішні ІД OMIM: 609606 MGI: 1915091 HomoloGene: 6836 GeneCards: ATG3
Пов'язані генетичні захворювання
бронхіальна астма[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• ubiquitin-like protein transferase activity
• enzyme binding
• Atg12 transferase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• Atg8 ligase activity
• transferase activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма
• cytoplasmic ubiquitin ligase complex

Біологічний процес

• regulation of cilium assembly
• mitochondrial fragmentation involved in apoptotic process
• автофагія
• protein transport
• autophagy of nucleus
• autophagy of mitochondrion
• autophagosome assembly
• Убіквітин-залежний протеоліз
• protein targeting to membrane
• macroautophagy
• negative regulation of phagocytosis

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
64422
67841
Ensembl
ENSG00000144848
ENSMUSG00000022663
UniProt
Q9NT62
Q9CPX6
RefSeq (мРНК)
NM_001278712
NM_022488
NM_026402
NM_001356366
RefSeq (білок)
NP_001265641
NP_071933
NP_080678
NP_001343295
Локус (UCSC) Хр. 3: 112.53 – 112.56 Mb Хр. 16: 44.98 – 45.01 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ATG3 (англ. Autophagy related 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 314 амінокислот, а молекулярна маса — 35 864[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MQNVINTVKGKALEVAEYLTPVLKESKFKETGVITPEEFVAAGDHLVHHC
PTWQWATGEELKVKAYLPTGKQFLVTKNVPCYKRCKQMEYSDELEAIIEE
DDGDGGWVDTYHNTGITGITEAVKEITLENKDNIRLQDCSALCEEEEDED
EGEAADMEEYEESGLLETDEATLDTRKIVEACKAKTDAGGEDAILQTRTY
DLYITYDKYYQTPRLWLFGYDEQRQPLTVEHMYEDISQDHVKKTVTIENH
PHLPPPPMCSVHPCRHAEVMKKIIETVAEGGGELGVHMYLLIFLKFVQAV
IPTIEYDYTRHFTM

Кодований геном білок за функцією належить до лігаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

  • Tanida I., Tanida-Miyake E., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2002). Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p. J. Biol. Chem. 277: 13739—13744. PMID 11825910 DOI:10.1074/jbc.M200385200
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Tanida I., Nishitani T., Nemoto T., Ueno T., Kominami E. (2002). Mammalian Apg12p, but not the Apg12p.Apg5p conjugate, facilitates LC3 processing. Biochem. Biophys. Res. Commun. 296: 1164—1170. PMID 12207896 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02057-0
  • Tanida I., Sou Y.S., Minematsu-Ikeguchi N., Ueno T., Kominami E. (2006). Atg8L/Apg8L is the fourth mammalian modifier of mammalian Atg8 conjugation mediated by human Atg4B, Atg7 and Atg3. FEBS J. 273: 2553—2562. PMID 16704426 DOI:10.1111/j.1742-4658.2006.05260.x
  • Tanida I., Yamasaki M., Komatsu M., Ueno T. (2012). The FAP motif within human ATG7, an autophagy-related E1-like enzyme, is essential for the E2-substrate reaction of LC3 lipidation. Autophagy. 8: 88—97. PMID 22170151 DOI:10.4161/auto.8.1.18339

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ATG3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20962 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. ↑ UniProt, Q9NT62 (англ.) . Архів оригіналу за 14 квітня 2018. Процитовано 18 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.