ATG7 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ATG7, APG7-LIKE, APG7L, GSA7, autophagy related 7, SCAR31 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608760 MGI: 1921494 HomoloGene: 4662 GeneCards: ATG7 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein homodimerization activity • transcription factor binding • ubiquitin activating enzyme activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin-like modifier activating enzyme activity • Atg12 activating enzyme activity • Atg8 activating enzyme activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • GO:0035085 Аксонема • extracellular region • аксон • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • гіалоплазма • phagophore assembly site |
---|
Біологічний процес | • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • cellular response to hyperoxia • cellular response to starvation • membrane fusion • defense response to virus • positive regulation of protein modification process • positive regulation of apoptotic process • protein transport • protein lipidation • suppression by virus of host autophagy • Убіквітин-залежний протеоліз • автофагія • GO:0010260 старіння людини • response to glucose • macroautophagy • response to nutrient levels • neutrophil degranulation • negative regulation of cell death • cellular response to morphine • negative regulation of mitochondrial DNA replication • regulation of neuron death • response to fluoride • negative regulation of oxidative stress-induced neuron death • autophagy of mitochondrion • autophagosome assembly • C-terminal protein lipidation • cellular response to nitrogen starvation • piecemeal microautophagy of the nucleus • late nucleophagy • positive regulation of autophagy • regulation of circadian rhythm • chaperone-mediated autophagy • protein modification by small protein conjugation • ритмічний процес |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/90/PBB_GE_ATG7_218673_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_ATG7_218673_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001136031 NM_001144912 NM_006395 NM_001349232 NM_001349233
| NM_001349234 NM_001349235 NM_001349236 NM_001349237 NM_001349238 |
| | NM_001253717 NM_001253718 NM_028835 NM_001379130 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001129503 NP_001138384 NP_006386 NP_001336161 NP_001336162
| NP_001336163 NP_001336164 NP_001336165 NP_001336166 NP_001336167 |
| | NP_001240646 NP_001240647 NP_083111 NP_001366059 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 11.27 – 11.56 Mb | Хр. 6: 114.62 – 114.84 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ATG7 (англ. Autophagy related 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 703 амінокислот, а молекулярна маса — 77 960[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAATGDPGL | | SKLQFAPFSS | | ALDVGFWHEL | | TQKKLNEYRL | | DEAPKDIKGY |
YYNGDSAGLP | | ARLTLEFSAF | | DMSAPTPARC | | CPAIGTLYNT | | NTLESFKTAD |
KKLLLEQAAN | | EIWESIKSGT | | ALENPVLLNK | | FLLLTFADLK | | KYHFYYWFCY |
PALCLPESLP | | LIQGPVGLDQ | | RFSLKQIEAL | | ECAYDNLCQT | | EGVTALPYFL |
IKYDENMVLV | | SLLKHYSDFF | | QGQRTKITIG | | VYDPCNLAQY | | PGWPLRNFLV |
LAAHRWSSSF | | QSVEVVCFRD | | RTMQGARDVA | | HSIIFEVKLP | | EMAFSPDCPK |
AVGWEKNQKG | | GMGPRMVNLS | | ECMDPKRLAE | | SSVDLNLKLM | | CWRLVPTLDL |
DKVVSVKCLL | | LGAGTLGCNV | | ARTLMGWGVR | | HITFVDNAKI | | SYSNPVRQPL |
YEFEDCLGGG | | KPKALAAADR | | LQKIFPGVNA | | RGFNMSIPMP | | GHPVNFSSVT |
LEQARRDVEQ | | LEQLIESHDV | | VFLLMDTRES | | RWLPAVIAAS | | KRKLVINAAL |
GFDTFVVMRH | | GLKKPKQQGA | | GDLCPNHPVA | | SADLLGSSLF | | ANIPGYKLGC |
YFCNDVVAPG | | DSTRDRTLDQ | | QCTVSRPGLA | | VIAGALAVEL | | MVSVLQHPEG |
GYAIASSSDD | | RMNEPPTSLG | | LVPHQIRGFL | | SRFDNVLPVS | | LAFDKCTACS |
SKVLDQYERE | | GFNFLAKVFN | | SSHSFLEDLT | | GLTLLHQETQ | | AAEIWDMSDD |
ETI |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Yuan W., Stromhaug P.E., Dunn W.A. Jr. (1999). Glucose-induced autophagy of peroxisomes in Pichia pastoris requires a unique E1-like protein. Mol. Biol. Cell. 10: 1353—1366. PMID 10233149 DOI:10.1091/mbc.10.5.1353
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tanida I., Tanida-Miyake E., Ueno T., Kominami E. (2001). The human homolog of Saccharomyces cerevisiae Apg7p is a Protein-activating enzyme for multiple substrates including human Apg12p, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3. J. Biol. Chem. 276: 1701—1706. PMID 11096062 DOI:10.1074/jbc.C000752200
- Tanida I., Tanida-Miyake E., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2002). Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p. J. Biol. Chem. 277: 13739—13744. PMID 11825910 DOI:10.1074/jbc.M200385200
- Sou Y.S., Tanida I., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2006). Phosphatidylserine in addition to phosphatidylethanolamine is an in vitro target of the mammalian Atg8 modifiers, LC3, GABARAP, and GATE-16. J. Biol. Chem. 281: 3017—3024. PMID 16303767 DOI:10.1074/jbc.M505888200
- Lee I.H., Finkel T. (2009). Regulation of autophagy by the p300 acetyltransferase. J. Biol. Chem. 284: 6322—6328. PMID 19124466 DOI:10.1074/jbc.M807135200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16935 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O95352 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |