ATG7

Ідентифікатори

Символи

ATG7, APG7-LIKE, APG7L, GSA7, autophagy related 7, SCAR31

Зовнішні ІД

OMIM: 608760 MGI: 1921494 HomoloGene: 4662 GeneCards: ATG7

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • transcription factor binding • ubiquitin activating enzyme activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin-like modifier activating enzyme activity • Atg12 activating enzyme activity • Atg8 activating enzyme activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • GO:0035085 Аксонема • extracellular region • аксон • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • гіалоплазма • phagophore assembly site
Біологічний процес	• GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • cellular response to hyperoxia • cellular response to starvation • membrane fusion • defense response to virus • positive regulation of protein modification process • positive regulation of apoptotic process • protein transport • protein lipidation • suppression by virus of host autophagy • Убіквітин-залежний протеоліз • автофагія • GO:0010260 старіння людини • response to glucose • macroautophagy • response to nutrient levels • neutrophil degranulation • negative regulation of cell death • cellular response to morphine • negative regulation of mitochondrial DNA replication • regulation of neuron death • response to fluoride • negative regulation of oxidative stress-induced neuron death • autophagy of mitochondrion • autophagosome assembly • C-terminal protein lipidation • cellular response to nitrogen starvation • piecemeal microautophagy of the nucleus • late nucleophagy • positive regulation of autophagy • regulation of circadian rhythm • chaperone-mediated autophagy • protein modification by small protein conjugation • ритмічний процес
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10533


74244

Ensembl


ENSG00000197548


ENSMUSG00000030314

UniProt


O95352


Q9D906

RefSeq (мРНК)

NM_001136031 NM_001144912 NM_006395 NM_001349232 NM_001349233
NM_001349234 NM_001349235 NM_001349236 NM_001349237 NM_001349238


NM_001253717 NM_001253718 NM_028835 NM_001379130

RefSeq (білок)

NP_001129503 NP_001138384 NP_006386 NP_001336161 NP_001336162
NP_001336163 NP_001336164 NP_001336165 NP_001336166 NP_001336167


NP_001240646 NP_001240647 NP_083111 NP_001366059

Локус (UCSC)

Хр. 3: 11.27 – 11.56 Mb

Хр. 6: 114.62 – 114.84 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ATG7 (англ. Autophagy related 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 703 амінокислот, а молекулярна маса — 77 960^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAATGDPGL	SKLQFAPFSS	ALDVGFWHEL	TQKKLNEYRL	DEAPKDIKGY
YYNGDSAGLP	ARLTLEFSAF	DMSAPTPARC	CPAIGTLYNT	NTLESFKTAD
KKLLLEQAAN	EIWESIKSGT	ALENPVLLNK	FLLLTFADLK	KYHFYYWFCY
PALCLPESLP	LIQGPVGLDQ	RFSLKQIEAL	ECAYDNLCQT	EGVTALPYFL
IKYDENMVLV	SLLKHYSDFF	QGQRTKITIG	VYDPCNLAQY	PGWPLRNFLV
LAAHRWSSSF	QSVEVVCFRD	RTMQGARDVA	HSIIFEVKLP	EMAFSPDCPK
AVGWEKNQKG	GMGPRMVNLS	ECMDPKRLAE	SSVDLNLKLM	CWRLVPTLDL
DKVVSVKCLL	LGAGTLGCNV	ARTLMGWGVR	HITFVDNAKI	SYSNPVRQPL
YEFEDCLGGG	KPKALAAADR	LQKIFPGVNA	RGFNMSIPMP	GHPVNFSSVT
LEQARRDVEQ	LEQLIESHDV	VFLLMDTRES	RWLPAVIAAS	KRKLVINAAL
GFDTFVVMRH	GLKKPKQQGA	GDLCPNHPVA	SADLLGSSLF	ANIPGYKLGC
YFCNDVVAPG	DSTRDRTLDQ	QCTVSRPGLA	VIAGALAVEL	MVSVLQHPEG
GYAIASSSDD	RMNEPPTSLG	LVPHQIRGFL	SRFDNVLPVS	LAFDKCTACS
SKVLDQYERE	GFNFLAKVFN	SSHSFLEDLT	GLTLLHQETQ	AAEIWDMSDD
ETI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Yuan W., Stromhaug P.E., Dunn W.A. Jr. (1999). Glucose-induced autophagy of peroxisomes in Pichia pastoris requires a unique E1-like protein. Mol. Biol. Cell. 10: 1353—1366. PMID 10233149 DOI:10.1091/mbc.10.5.1353
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tanida I., Tanida-Miyake E., Ueno T., Kominami E. (2001). The human homolog of Saccharomyces cerevisiae Apg7p is a Protein-activating enzyme for multiple substrates including human Apg12p, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3. J. Biol. Chem. 276: 1701—1706. PMID 11096062 DOI:10.1074/jbc.C000752200
Tanida I., Tanida-Miyake E., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2002). Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p. J. Biol. Chem. 277: 13739—13744. PMID 11825910 DOI:10.1074/jbc.M200385200
Sou Y.S., Tanida I., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2006). Phosphatidylserine in addition to phosphatidylethanolamine is an in vitro target of the mammalian Atg8 modifiers, LC3, GABARAP, and GATE-16. J. Biol. Chem. 281: 3017—3024. PMID 16303767 DOI:10.1074/jbc.M505888200
Lee I.H., Finkel T. (2009). Regulation of autophagy by the p300 acetyltransferase. J. Biol. Chem. 284: 6322—6328. PMID 19124466 DOI:10.1074/jbc.M807135200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16935 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, O95352 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.