BASP1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

BASP1

Ідентифікатори

Символи

BASP1, CAP-23, CAP23, NAP-22, NAP22, brain abundant membrane attached signal protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 605940 MGI: 1917600 HomoloGene: 38168 GeneCards: BASP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001106 transcription corepressor activity • protein domain specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • везикула • nuclear speck • cell projection • мембрана • growth cone • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • COP9 signalosome • екзосома • цитоскелет • клітинне ядро
Біологічний процес	• substantia nigra development • diaphragm development • positive regulation of metanephric ureteric bud development • positive regulation of heart growth • glomerular visceral epithelial cell differentiation • thorax and anterior abdomen determination • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • gonad development • metanephric mesenchyme development • mesenchymal to epithelial transition
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10409


70350

Ensembl


ENSG00000176788


ENSMUSG00000045763

UniProt


P80723


Q91XV3

RefSeq (мРНК)


NM_006317 NM_001271606


NM_027395

RefSeq (білок)


NP_001258535 NP_006308


NP_081671

Локус (UCSC)

Хр. 5: 17.07 – 17.28 Mb

Хр. 15: 25.36 – 25.41 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

BASP1 (англ. Brain abundant membrane attached signal protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 227 амінокислот, а молекулярна маса — 22 693^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGGKLSKKKK	GYNVNDEKAK	EKDKKAEGAA	TEEEGTPKES	EPQAAAEPAE
AKEGKEKPDQ	DAEGKAEEKE	GEKDAAAAKE	EAPKAEPEKT	EGAAEAKAEP
PKAPEQEQAA	PGPAAGGEAP	KAAEAAAAPA	ESAAPAAGEE	PSKEEGEPKK
TEAPAAPAAQ	ETKSDGAPAS	DSKPGSSEAA	PSSKETPAAT	EAPSSTPKAQ
GPAASAEEPK	PVEAPAANSD	QTVTVKE

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
G: Гліцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:957 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.
↑ UniProt, P80723 (англ.) . Архів оригіналу за 17 червня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.