BHLHE40

BHLHE40
Ідентифікатори
Символи BHLHE40, BHLHB2, DEC1, HLHB2, SHARP-2, STRA13, Stra14, basic helix-loop-helix family member e40, Clast5, SHARP2
Зовнішні ІД OMIM: 604256 MGI: 1097714 HomoloGene: 2722 GeneCards: BHLHE40
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
protein dimerization activity
protein homodimerization activity
MRF binding
GO:0001106 transcription corepressor activity
protein domain specific binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
bHLH transcription factor binding
E-box binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
protein heterodimerization activity
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
transcription factor binding
sequence-specific DNA binding
sequence-specific double-stranded DNA binding

Клітинна компонента

цитоплазма
клітинне ядро
ядерні тільця

Біологічний процес

GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
response to light stimulus
ритмічний процес
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
circadian regulation of gene expression
transcription, DNA-templated
negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
entrainment of circadian clock by photoperiod
циркадний ритм
somitogenesis
Сигнальний шлях Notch
диференціація клітин
regulation of neurogenesis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8553
20893
Ensembl
ENSG00000134107
ENSMUSG00000030103
UniProt
O14503
O35185
RefSeq (мРНК)
NM_003670
NM_011498
RefSeq (білок)
NP_003661
NP_035628
Локус (UCSC) Хр. 3: 4.98 – 4.99 Mb Хр. 6: 108.64 – 108.64 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

BHLHE40 (англ. Basic helix-loop-helix family member e40) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 412 амінокислот, а молекулярна маса — 45 510[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MERIPSAQPPPACLPKAPGLEHGDLPGMYPAHMYQVYKSRRGIKRSEDSK
ETYKLPHRLIEKKRRDRINECIAQLKDLLPEHLKLTTLGHLEKAVVLELT
LKHVKALTNLIDQQQQKIIALQSGLQAGELSGRNVETGQEMFCSGFQTCA
REVLQYLAKHENTRDLKSSQLVTHLHRVVSELLQGGTSRKPSDPAPKVMD
FKEKPSSPAKGSEGPGKNCVPVIQRTFAHSSGEQSGSDTDTDSGYGGESE
KGDLRSEQPCFKSDHGRRFTMGERIGAIKQESEEPPTKKNRMQLSDDEGH
FTSSDLISSPFLGPHPHQPPFCLPFYLIPPSATAYLPMLEKCWYPTSVPV
LYPGLNASAAALSSFMNPDKISAPLLMPQRLPSPLPAHPSVDSSVLLQAL
KPIPPLNLETKD

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Ivanova A.V., Ivanov S.V., Danilkovitch-Miagkova A., Lerman M.I. (2001). Regulation of STRA13 by the von Hippel-Lindau tumor suppressor protein, hypoxia, and the UBC9/ubiquitin proteasome degradation pathway. J. Biol. Chem. 276: 15306—15315. PMID 11278694 DOI:10.1074/jbc.M010516200
  • Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
  • Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1046 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, O14503 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.