BOP1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | BOP1, block of proliferation 1, BOP1 ribosomal biogenesis factor |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610596 MGI: 1334460 HomoloGene: 6612 GeneCards: BOP1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • ribonucleoprotein complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • ядерце • клітинне ядро • PeBoW complex • нуклеоплазма • preribosome, large subunit precursor • Рибонуклеопротеїни |
---|
Біологічний процес | • ribosomal large subunit biogenesis • cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • проліферація • ribosome biogenesis • regulation of cell cycle • rRNA processing • maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • ribosomal large subunit assembly • regulation of signal transduction by p53 class mediator • maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/df/PBB_GE_BOP1_212563_at_fs.png/250px-PBB_GE_BOP1_212563_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0c/PBB_GE_BOP1_216397_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_BOP1_216397_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000261236 ENSG00000285301 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 144.26 – 144.29 Mb | Хр. 15: 76.34 – 76.36 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
BOP1 (англ. Block of proliferation 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 746 амінокислот, а молекулярна маса — 83 630[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAGSRGAGRT | | AAPSVRPEKR | | RSEPELEPEP | | EPEPPLLCTS | | PLSHSTGSDS |
GVSDSEESVF | | SGLEDSGSDS | | SEDDDEGDEE | | GEDGALDDEG | | HSGIKKTTEE |
QVQASTPCPR | | TEMASARIGD | | EYAEDSSDEE | | DIRNTVGNVP | | LEWYDDFPHV |
GYDLDGRRIY | | KPLRTRDELD | | QFLDKMDDPD | | YWRTVQDPMT | | GRDLRLTDEQ |
VALVRRLQSG | | QFGDVGFNPY | | EPAVDFFSGD | | VMIHPVTNRP | | ADKRSFIPSL |
VEKEKVSRMV | | HAIKMGWIQP | | RRPRDPTPSF | | YDLWAQEDPN | | AVLGRHKMHV |
PAPKLALPGH | | AESYNPPPEY | | LLSEEERLAW | | EQQEPGERKL | | SFLPRKFPSL |
RAVPAYGRFI | | QERFERCLDL | | YLCPRQRKMR | | VNVDPEDLIP | | KLPRPRDLQP |
FPTCQALVYR | | GHSDLVRCLS | | VSPGGQWLVS | | GSDDGSLRLW | | EVATARCVRT |
VPVGGVVKSV | | AWNPSPAVCL | | VAAAVEDSVL | | LLNPALGDRL | | VAGSTDQLLS |
AFVPPEEPPL | | QPARWLEASE | | EERQVGLRLR | | ICHGKPVTQV | | TWHGRGDYLA |
VVLATQGHTQ | | VLIHQLSRRR | | SQSPFRRSHG | | QVQRVAFHPA | | RPFLLVASQR |
SVRLYHLLRQ | | ELTKKLMPNC | | KWVSSLAVHP | | AGDNVICGSY | | DSKLVWFDLD |
LSTKPYRMLR | | HHKKALRAVA | | FHPRYPLFAS | | GSDDGSVIVC | | HGMVYNDLLQ |
NPLLVPVKVL | | KGHVLTRDLG | | VLDVIFHPTQ | | PWVFSSGADG | | TVRLFT |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесінг рРНК, біогенез рибосом, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Sloan K.E., Bohnsack M.T., Watkins N.J. (2013). The 5S RNP couples p53 homeostasis to ribosome biogenesis and nucleolar stress. Cell Rep. 5: 237—247. PMID 24120868 DOI:10.1016/j.celrep.2013.08.049
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15519 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q14137 (англ.) . Архів оригіналу за 12 лютого 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |