BOP1

Ідентифікатори

Символи

BOP1, block of proliferation 1, BOP1 ribosomal biogenesis factor

Зовнішні ІД

OMIM: 610596 MGI: 1334460 HomoloGene: 6612 GeneCards: BOP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ribonucleoprotein complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• ядерце • клітинне ядро • PeBoW complex • нуклеоплазма • preribosome, large subunit precursor • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• ribosomal large subunit biogenesis • cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • проліферація • ribosome biogenesis • regulation of cell cycle • rRNA processing • maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • ribosomal large subunit assembly • regulation of signal transduction by p53 class mediator • maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23246


12181

Ensembl


ENSG00000261236 ENSG00000285301


ENSMUSG00000022557

UniProt


Q14137


P97452

RefSeq (мРНК)


NM_015201


NM_013481

RefSeq (білок)


NP_056016


NP_038509

Локус (UCSC)

Хр. 8: 144.26 – 144.29 Mb

Хр. 15: 76.34 – 76.36 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

BOP1 (англ. Block of proliferation 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 746 амінокислот, а молекулярна маса — 83 630^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGSRGAGRT	AAPSVRPEKR	RSEPELEPEP	EPEPPLLCTS	PLSHSTGSDS
GVSDSEESVF	SGLEDSGSDS	SEDDDEGDEE	GEDGALDDEG	HSGIKKTTEE
QVQASTPCPR	TEMASARIGD	EYAEDSSDEE	DIRNTVGNVP	LEWYDDFPHV
GYDLDGRRIY	KPLRTRDELD	QFLDKMDDPD	YWRTVQDPMT	GRDLRLTDEQ
VALVRRLQSG	QFGDVGFNPY	EPAVDFFSGD	VMIHPVTNRP	ADKRSFIPSL
VEKEKVSRMV	HAIKMGWIQP	RRPRDPTPSF	YDLWAQEDPN	AVLGRHKMHV
PAPKLALPGH	AESYNPPPEY	LLSEEERLAW	EQQEPGERKL	SFLPRKFPSL
RAVPAYGRFI	QERFERCLDL	YLCPRQRKMR	VNVDPEDLIP	KLPRPRDLQP
FPTCQALVYR	GHSDLVRCLS	VSPGGQWLVS	GSDDGSLRLW	EVATARCVRT
VPVGGVVKSV	AWNPSPAVCL	VAAAVEDSVL	LLNPALGDRL	VAGSTDQLLS
AFVPPEEPPL	QPARWLEASE	EERQVGLRLR	ICHGKPVTQV	TWHGRGDYLA
VVLATQGHTQ	VLIHQLSRRR	SQSPFRRSHG	QVQRVAFHPA	RPFLLVASQR
SVRLYHLLRQ	ELTKKLMPNC	KWVSSLAVHP	AGDNVICGSY	DSKLVWFDLD
LSTKPYRMLR	HHKKALRAVA	FHPRYPLFAS	GSDDGSVIVC	HGMVYNDLLQ
NPLLVPVKVL	KGHVLTRDLG	VLDVIFHPTQ	PWVFSSGADG	TVRLFT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесінг рРНК, біогенез рибосом, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Sloan K.E., Bohnsack M.T., Watkins N.J. (2013). The 5S RNP couples p53 homeostasis to ribosome biogenesis and nucleolar stress. Cell Rep. 5: 237—247. PMID 24120868 DOI:10.1016/j.celrep.2013.08.049

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15519 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q14137 (англ.) . Архів оригіналу за 12 лютого 2017. Процитовано 7 вересня 2017.