BRD8

Ідентифікатори

Символи

BRD8, SMAP, SMAP2, p120, bromodomain containing 8

Зовнішні ІД

OMIM: 602848 MGI: 1925906 HomoloGene: 41790 GeneCards: BRD8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
Клітинна компонента	• мітохондрія • клітинне ядро • нуклеоплазма • Swr1 complex • NuA4 histone acetyltransferase complex
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H2A acetylation • regulation of growth • cell surface receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція • histone H4 acetylation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • intracellular receptor signaling pathway • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10902


78656

Ensembl


ENSG00000112983


ENSMUSG00000003778

UniProt


Q9H0E9


Q8R3B7

RefSeq (мРНК)

NM_001164326 NM_001300961 NM_001300962 NM_001300966 NM_006696
NM_139199 NM_183359


NM_001289606 NM_001289607 NM_030147 NM_001361136

RefSeq (білок)

NP_001157798 NP_001287890 NP_001287891 NP_001287895 NP_006687
NP_631938


NP_001276535 NP_001276536 NP_084423 NP_001348065

Локус (UCSC)

Хр. 5: 138.14 – 138.18 Mb

Хр. 18: 34.73 – 34.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

BRD8 (англ. Bromodomain containing 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 235 амінокислот, а молекулярна маса — 135 336^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATGTGKHKL	LSTGPTEPWS	IREKLCLASS	VMRSGDQNWV	SVSRAIKPFA
EPGRPPDWFS	QKHCASQYSE	LLETTETPKR	KRGEKGEVVE	TVEDVIVRKL
TAERVEELKK	VIKETQERYR	RLKRDAELIQ	AGHMDSRLDE	LCNDIATKKK
LEEEEAEVKR	KATDAAYQAR	QAVKTPPRRL	PTVMVRSPID	SASPGGDYPL
GDLTPTTMEE	ATSGVNESEM	AVASGHLNST	GVLLEVGGVL	PMIHGGEIQQ
TPNTVAASPA	ASGAPTLSRL	LEAGPTQFTT	PLASFTTVAS	EPPVKLVPPP
VESVSQATIV	MMPALPAPSS	APAVSTTESV	APVSQPDNCV	PMEAVGDPHT
VTVSMDSSEI	SMIINSIKEE	CFRSGVAEAP	VGSKAPSIDG	KEELDLAEKM
DIAVSYTGEE	LDFETVGDII	AIIEDKVDDH	PEVLDVAAVE	AALSFCEEND
DPQSLPGPWE	HPIQQERDKP	VPLPAPEMTV	KQERLDFEET	ENKGIHELVD
IREPSAEIKV	EPAEPEPVIS	GAEIVAGVVP	ATSMEPPELR	SQDLDEELGS
TAAGEIVEAD	VAIGKGDETP	LTNVKTEASP	ESMLSPSHGS	NPIEDPLEAE
TQHKFEMSDS	LKEESGTIFG	SQIKDAPGED	EEEDGVSEAA	SLEEPKEEDQ
GEGYLSEMDN	EPPVSESDDG	FSIHNATLQS	HTLADSIPSS	PASSQFSVCS
EDQEAIQAQK	IWKKAIMLVW	RAAANHRYAN	VFLQPVTDDI	APGYHSIVQR
PMDLSTIKKN	IENGLIRSTA	EFQRDIMLMF	QNAVMYNSSD	HDVYHMAVEM
QRDVLEQIQQ	FLATQLIMQT	SESGISAKSL	RGRDSTRKQD	ASEKDSVPMG
SPAFLLSLFM	GHEWVWLDSE	QDHPNDSELS	NDCRSLFSSW	DSSLDLDVGN
WRETEDPEAE	ELEESSPERE	PSELLVGDGG	SEESQEAARK	ASHQNLLHFL
SEVAYLMEPL	CISSNESSEG	CCPPSGTRQE	GREIKASEGE	RELCRETEEL
SAKGDPLVAE	KPLGENGKPE	VASAPSVICT	VQGLLTESEE	GEAQQESKGE
DQGEVYVSEM	EDQPPSGECD	DAFNIKETPL	VDTLFSHATS	SKLTDLSQDD
PVQDHLLFKK	TLLPVWKMIA	SHRFSSPFLK	PVSERQAPGY	KDVVKRPMDL
TSLKRNLSKG	RIRTMAQFLR	DLMLMFQNAV	MYNDSDHHVY	HMAVEMRQEV
LEQIQVLNIW	LDKRKGSSSL	EGEPANPVDD	GKPVF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, регуляція росту, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у ядрі.

Література

Nielsen M.S., Petersen C.M., Gliemann J., Madsen P. (1996). Cloning and sequencing of a human cDNA encoding a putative transcription factor containing a bromodomain. Biochim. Biophys. Acta. 1306: 14—16. PMID 8611617 DOI:10.1016/0167-4781(95)00239-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Monden T., Wondisford F.E., Hollenberg A.N. (1997). Isolation and characterization of a novel ligand-dependent thyroid hormone receptor-coactivating protein. J. Biol. Chem. 272: 29834—29841. PMID 9368056 DOI:10.1074/jbc.272.47.29834
Doyon Y., Cote J. (2004). The highly conserved and multifunctional NuA4 HAT complex. Curr. Opin. Genet. Dev. 14: 147—154. PMID 15196461 DOI:10.1016/j.gde.2004.02.009
Doyon Y., Selleck W., Lane W.S., Tan S., Cote J. (2004). Structural and functional conservation of the NuA4 histone acetyltransferase complex from yeast to humans. Mol. Cell. Biol. 24: 1884—1896. PMID 14966270 DOI:10.1128/MCB.24.5.1884-1896.2004
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19874 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H0E9 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 5 вересня 2017.