BTAF1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | BTAF1, MOT1, TAF(II)170, TAF172, TAFII170, B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605191 MGI: 2147538 HomoloGene: 31978 GeneCards: BTAF1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • nucleotide binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of chromatin binding |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/68/PBB_GE_BTAF1_209430_at_fs.png/250px-PBB_GE_BTAF1_209430_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 91.92 – 92.03 Mb | Хр. 19: 36.9 – 36.99 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
BTAF1 (англ. B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 849 амінокислот, а молекулярна маса — 206 887[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAVSRLDRLF | | ILLDTGTTPV | | TRKAAAQQLG | | EVVKLHPHEL | | NNLLSKVLIY |
LRSANWDTRI | | AAGQAVEAIV | | KNVPEWNPVP | | RTRQEPTSES | | SMEDSPTTER |
LNFDRFDICR | | LLQHGASLLG | | SAGAEFEVQD | | EKSGEVDPKE | | RIARQRKLLQ |
KKLGLNMGEA | | IGMSTEELFN | | DEDLDYTPTS | | ASFVNKQPTL | | QAAELIDSEF |
RAGMSNRQKN | | KAKRMAKLFA | | KQRSRDAVET | | NEKSNDSTDG | | EPEEKRRKIA |
NVVINQSAND | | SKVLIDNIPD | | SSSLIEETNE | | WPLESFCEEL | | CNDLFNPSWE |
VRHGAGTGLR | | EILKAHGKSG | | GKMGDSTLEE | | MIQQHQEWLE | | DLVIRLLCVF |
ALDRFGDFVS | | DEVVAPVRET | | CAQTLGVVLK | | HMNETGVHKT | | VDVLLKLLTQ |
EQWEVRHGGL | | LGIKYALAVR | | QDVINTLLPK | | VLTRIIEGLQ | | DLDDDVRAVA |
AASLVPVVES | | LVYLQTQKVP | | FIINTLWDAL | | LELDDLTAST | | NSIMTLLSSL |
LTYPQVQQCS | | IQQSLTVLVP | | RVWPFLHHTI | | SSVRRAALET | | LFTLLSTQDQ |
NSSSWLIPIL | | PDMLRHIFQF | | CVLESSQEIL | | DLIHKVWMEL | | LSKASVQYVV |
AAACPWMGAW | | LCLMMQPSHL | | PIDLNMLLEV | | KARAKEKTGG | | KVRQGQSQNK |
EVLQEYIAGA | | DTIMEDPATR | | DFVVMRARMM | | AAKLLGALCC | | CICDPGVNVV |
TQEIKPAESL | | GQLLLFHLNS | | KSALQRISVA | | LVICEWAALQ | | KECKAVTLAV |
QPRLLDILSE | | HLYYDEIAVP | | FTRMQNECKQ | | LISSLADVHI | | EVGNRVNNNV |
LTIDQASDLV | | TTVFNEATSS | | FDLNPQVLQQ | | LDSKRQQVQM | | TVTETNQEWQ |
VLQLRVHTFA | | ACAVVSLQQL | | PEKLNPIIKP | | LMETIKKEEN | | TLVQNYAAQC |
IAKLLQQCTT | | RTPCPNSKII | | KNLCSSLCVD | | PYLTPCVTCP | | VPTQSGQENS |
KGSTSEKDGM | | HHTVTKHRGI | | ITLYRHQKAA | | FAITSRRGPT | | PKAVKAQIAD |
LPAGSSGNIL | | VELDEAQKPY | | LVQRRGAEFA | | LTTIVKHFGG | | EMAVKLPHLW |
DAMVGPLRNT | | IDINNFDGKS | | LLDKGDSPAQ | | ELVNSLQVFE | | TAAASMDSEL |
HPLLVQHLPH | | LYMCLQYPST | | AVRHMAARCV | | GVMSKIATME | | TMNIFLEKVL |
PWLGAIDDSV | | KQEGAIEALA | | CVMEQLDVGI | | VPYIVLLVVP | | VLGRMSDQTD |
SVRFMATQCF | | ATLIRLMPLE | | AGIPDPPNMS | | AELIQLKAKE | | RHFLEQLLDG |
KKLENYKIPV | | PINAELRKYQ | | QDGVNWLAFL | | NKYKLHGILC | | DDMGLGKTLQ |
SICILAGDHC | | HRAQEYARSK | | LAECMPLPSL | | VVCPPTLTGH | | WVDEVGKFCS |
REYLNPLHYT | | GPPTERIRLQ | | HQVKRHNLIV | | ASYDVVRNDI | | DFFRNIKFNY |
CILDEGHVIK | | NGKTKLSKAV | | KQLTANYRII | | LSGTPIQNNV | | LELWSLFDFL |
MPGFLGTERQ | | FAARYGKPIL | | ASRDARSSSR | | EQEAGVLAMD | | ALHRQVLPFL |
LRRMKEDVLQ | | DLPPKIIQDY | | YCTLSPLQVQ | | LYEDFAKSRA | | KCDVDETVSS |
ATLSEETEKP | | KLKATGHVFQ | | ALQYLRKLCN | | HPALVLTPQH | | PEFKTTAEKL |
AVQNSSLHDI | | QHAPKLSALK | | QLLLDCGLGN | | GSTSESGTES | | VVAQHRILIF |
CQLKSMLDIV | | EHDLLKPHLP | | SVTYLRLDGS | | IPPGQRHSIV | | SRFNNDPSID |
VLLLTTHVGG | | LGLNLTGADT | | VVFVEHDWNP | | MRDLQAMDRA | | HRIGQKRVVN |
VYRLITRGTL | | EEKIMGLQKF | | KMNIANTVIS | | QENSSLQSMG | | TDQLLDLFTL |
DKDGKAEKAD | | TSTSGKASMK | | SILENLSDLW | | DQEQYDSEYS | | LENFMHSLK |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- van der Knaap J.A., Borst J.W., van der Vliet P.C., Gentz R., Timmers H.T.M. (1997). Cloning of the cDNA for the TATA-binding protein-associated factorII170 subunit of transcription factor B-TFIID reveals homology to global transcription regulators in yeast and Drosophila. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 11827—11832. PMID 9342322 DOI:10.1073/pnas.94.22.11827
- Chicca J.J. II, Auble D.T., Pugh B.F. (1998). Cloning and biochemical characterization of TAF-172, a human homolog of yeast Mot1. Mol. Cell. Biol. 18: 1701—1710. PMID 9488487 DOI:10.1128/MCB.18.3.1701
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17307 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O14981 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |