BTAF1

Ідентифікатори

Символи

BTAF1, MOT1, TAF(II)170, TAF172, TAFII170, B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 605191 MGI: 2147538 HomoloGene: 31978 GeneCards: BTAF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • nucleotide binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of chromatin binding
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9044


107182

Ensembl


ENSG00000095564


ENSMUSG00000040565

UniProt


O14981 Q2M1V9


E9QAE3

RefSeq (мРНК)


NM_003972


NM_001080706

RefSeq (білок)


NP_003963 NP_003963.1


NP_001074175

Локус (UCSC)

Хр. 10: 91.92 – 92.03 Mb

Хр. 19: 36.9 – 36.99 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

BTAF1 (англ. B-TFIID TATA-box binding protein associated factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 849 амінокислот, а молекулярна маса — 206 887^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVSRLDRLF	ILLDTGTTPV	TRKAAAQQLG	EVVKLHPHEL	NNLLSKVLIY
LRSANWDTRI	AAGQAVEAIV	KNVPEWNPVP	RTRQEPTSES	SMEDSPTTER
LNFDRFDICR	LLQHGASLLG	SAGAEFEVQD	EKSGEVDPKE	RIARQRKLLQ
KKLGLNMGEA	IGMSTEELFN	DEDLDYTPTS	ASFVNKQPTL	QAAELIDSEF
RAGMSNRQKN	KAKRMAKLFA	KQRSRDAVET	NEKSNDSTDG	EPEEKRRKIA
NVVINQSAND	SKVLIDNIPD	SSSLIEETNE	WPLESFCEEL	CNDLFNPSWE
VRHGAGTGLR	EILKAHGKSG	GKMGDSTLEE	MIQQHQEWLE	DLVIRLLCVF
ALDRFGDFVS	DEVVAPVRET	CAQTLGVVLK	HMNETGVHKT	VDVLLKLLTQ
EQWEVRHGGL	LGIKYALAVR	QDVINTLLPK	VLTRIIEGLQ	DLDDDVRAVA
AASLVPVVES	LVYLQTQKVP	FIINTLWDAL	LELDDLTAST	NSIMTLLSSL
LTYPQVQQCS	IQQSLTVLVP	RVWPFLHHTI	SSVRRAALET	LFTLLSTQDQ
NSSSWLIPIL	PDMLRHIFQF	CVLESSQEIL	DLIHKVWMEL	LSKASVQYVV
AAACPWMGAW	LCLMMQPSHL	PIDLNMLLEV	KARAKEKTGG	KVRQGQSQNK
EVLQEYIAGA	DTIMEDPATR	DFVVMRARMM	AAKLLGALCC	CICDPGVNVV
TQEIKPAESL	GQLLLFHLNS	KSALQRISVA	LVICEWAALQ	KECKAVTLAV
QPRLLDILSE	HLYYDEIAVP	FTRMQNECKQ	LISSLADVHI	EVGNRVNNNV
LTIDQASDLV	TTVFNEATSS	FDLNPQVLQQ	LDSKRQQVQM	TVTETNQEWQ
VLQLRVHTFA	ACAVVSLQQL	PEKLNPIIKP	LMETIKKEEN	TLVQNYAAQC
IAKLLQQCTT	RTPCPNSKII	KNLCSSLCVD	PYLTPCVTCP	VPTQSGQENS
KGSTSEKDGM	HHTVTKHRGI	ITLYRHQKAA	FAITSRRGPT	PKAVKAQIAD
LPAGSSGNIL	VELDEAQKPY	LVQRRGAEFA	LTTIVKHFGG	EMAVKLPHLW
DAMVGPLRNT	IDINNFDGKS	LLDKGDSPAQ	ELVNSLQVFE	TAAASMDSEL
HPLLVQHLPH	LYMCLQYPST	AVRHMAARCV	GVMSKIATME	TMNIFLEKVL
PWLGAIDDSV	KQEGAIEALA	CVMEQLDVGI	VPYIVLLVVP	VLGRMSDQTD
SVRFMATQCF	ATLIRLMPLE	AGIPDPPNMS	AELIQLKAKE	RHFLEQLLDG
KKLENYKIPV	PINAELRKYQ	QDGVNWLAFL	NKYKLHGILC	DDMGLGKTLQ
SICILAGDHC	HRAQEYARSK	LAECMPLPSL	VVCPPTLTGH	WVDEVGKFCS
REYLNPLHYT	GPPTERIRLQ	HQVKRHNLIV	ASYDVVRNDI	DFFRNIKFNY
CILDEGHVIK	NGKTKLSKAV	KQLTANYRII	LSGTPIQNNV	LELWSLFDFL
MPGFLGTERQ	FAARYGKPIL	ASRDARSSSR	EQEAGVLAMD	ALHRQVLPFL
LRRMKEDVLQ	DLPPKIIQDY	YCTLSPLQVQ	LYEDFAKSRA	KCDVDETVSS
ATLSEETEKP	KLKATGHVFQ	ALQYLRKLCN	HPALVLTPQH	PEFKTTAEKL
AVQNSSLHDI	QHAPKLSALK	QLLLDCGLGN	GSTSESGTES	VVAQHRILIF
CQLKSMLDIV	EHDLLKPHLP	SVTYLRLDGS	IPPGQRHSIV	SRFNNDPSID
VLLLTTHVGG	LGLNLTGADT	VVFVEHDWNP	MRDLQAMDRA	HRIGQKRVVN
VYRLITRGTL	EEKIMGLQKF	KMNIANTVIS	QENSSLQSMG	TDQLLDLFTL
DKDGKAEKAD	TSTSGKASMK	SILENLSDLW	DQEQYDSEYS	LENFMHSLK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

van der Knaap J.A., Borst J.W., van der Vliet P.C., Gentz R., Timmers H.T.M. (1997). Cloning of the cDNA for the TATA-binding protein-associated factorII170 subunit of transcription factor B-TFIID reveals homology to global transcription regulators in yeast and Drosophila. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 11827—11832. PMID 9342322 DOI:10.1073/pnas.94.22.11827
Chicca J.J. II, Auble D.T., Pugh B.F. (1998). Cloning and biochemical characterization of TAF-172, a human homolog of yeast Mot1. Mol. Cell. Biol. 18: 1701—1710. PMID 9488487 DOI:10.1128/MCB.18.3.1701

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17307 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O14981 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.