CACHD1

Ідентифікатори

Символи

CACHD1, cache domain containing 1

Зовнішні ІД

MGI: 2444177 HomoloGene: 10854 GeneCards: CACHD1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• voltage-gated calcium channel activity
Клітинна компонента	• мембрана • integral component of membrane • voltage-gated calcium channel complex
Біологічний процес	• calcium ion transport • ion transport • calcium ion transmembrane transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57685


320508

Ensembl


ENSG00000158966


ENSMUSG00000028532

UniProt


Q5VU97


Q6PDJ1

RefSeq (мРНК)


NM_001293274 NM_020925


NM_198037

RefSeq (білок)


NP_001280203 NP_065976


NP_932154

Локус (UCSC)

Хр. 1: 64.47 – 64.69 Mb

Хр. 4: 100.63 – 100.89 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CACHD1 (англ. Cache domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 274 амінокислот, а молекулярна маса — 142 290^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARQPEEEET	AVARARRPPL	WLLCLVACWL	LGAGAEADFS	ILDEAQVLAS
QMRRLAAEEL	GVVTMQRIFN	SFVYTEKISN	GESEVQQLAK	KIREKFNRYL
DVVNRNKQVV	EASYTAHLTS	PLTAIQDCCT	IPPSMMEFDG	NFNTNVSRTI
SCDRLSTTVN	SRAFNPGRDL	NSVLADNLKS	NPGIKWQYFS	SEEGIFTVFP
AHKFRCKGSY	EHRSRPIYVS	TVRPQSKHIV	VILDHGASVT	DTQLQIAKDA
AQVILSAIDE	HDKISVLTVA	DTVRTCSLDQ	CYKTFLSPAT	SETKRKMSTF
VSSVKSSDSP	TQHAVGFQKA	FQLIRSTNNN	TKFQANTDMV	IIYLSAGITS
KDSSEEDKKA	TLQVINEENS	FLNNSVMILT	YALMNDGVTG	LKELAFLRDL
AEQNSGKYGV	PDRMALPVIK	GSMMVLNQLS	NLETTVGRFY	TNLPNRMIDE
AVFSLPFSDE	MGDGLIMTVS	KPCYFGNLLL	GIVGVDVNLA	YILEDVTYYQ
DSLASYTFLI	DDKGYTLMHP	SLTRPYLLSE	PPLHTDIIHY	ENIPKFELVR
QNILSLPLGS	QIIAVPVNSS	LSWHINKLRE	TGKEAYNVSY	AWKMVQDTSF
ILCIVVIQPE	IPVKQLKNLN	TVPSSKLLYH	RLDLLGQPSA	CLHFKQLATL
ESPTIMLSAG	SFSSPYEHLS	QPETKRMVEH	YTAYLSDNTR	LIANPGLKFS
VRNEVMATSH	VTDEWMTQME	MSSLNTYIVR	RYIATPNGVL	RIYPGSLMDK
AFDPTRRQWY	LHAVANPGLI	SLTGPYLDVG	GAGYVVTISH	TIHSSSTQLS
SGHTVAVMGI	DFTLRYFYKV	LMDLLPVCNQ	DGGNKIRCFI	MEDRGYLVAH
PTLIDPKGHA	PVEQQHITHK	EPLVANDILN	HPNFVKKNLC	NSFSDRTVQR
FYKFNTSLAG	DLTNLVHGSH	CSKYRLARIP	GTNAFVGIVN	ETCDSLAFCA
CSMVDRLCLN	CHRMEQNECE	CPCECPLEVN	ECTGNLTNAE	NRNPSCEVHQ
EPVTYTAIDP	GLQDALHQCV	NSRCSQRLES	GDCFGVLDCE	WCMVDSDGKT
HLDKPYCAPQ	KECFGGIVGA	KSPYVDDMGA	IGDEVITLNM	IKSAPVGPVA
GGIMGCIMVL	VLAVYAYRHQ	IHRRSHQHMS	PLAAQEMSVR	MSNLENDRDE
RDDDSHEDRG	IISNTRFIAA	VIERHAHSPE	RRRRYWGRSG	TESDHGYSTM
SPQEDSENPP	CNNDPLSAGV	DVGNHDEDLD	LDTPPQTAAL	LSHKFHHYRS
HHPTLHHSHH	LQAAVTVHTV	DAEC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29314 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q5VU97 (англ.) . Архів оригіналу за 6 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.