CALD1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CALD1, CDM, H-CAD, HCAD, L-CAD, LCAD, NAG22, caldesmon 1, h-CD |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 114213 HomoloGene: 137424 GeneCards: CALD1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • myosin binding • actin binding • tropomyosin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calmodulin binding • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • міофібрила • цитоскелет • actin cytoskeleton • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • actin cap |
---|
Біологічний процес | • м'язове скорочення |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bb/PBB_GE_CALD1_201617_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_CALD1_201617_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/df/PBB_GE_CALD1_201616_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CALD1_201616_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/05/PBB_GE_CALD1_201615_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_CALD1_201615_x_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_004342 NM_033138 NM_033139 NM_033140 NM_033157 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_004333 NP_149129 NP_149130 NP_149131 NP_149347 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 134.74 – 134.97 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CALD1 (англ. Caldesmon 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 793 амінокислот, а молекулярна маса — 93 231[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDDFERRREL | | RRQKREEMRL | | EAERIAYQRN | | DDDEEEAARE | | RRRRARQERL |
RQKQEEESLG | | QVTDQVEVNA | | QNSVPDEEAK | | TTTTNTQVEG | | DDEAAFLERL |
ARREERRQKR | | LQEALERQKE | | FDPTITDASL | | SLPSRRMQND | | TAENETTEKE |
EKSESRQERY | | EIEETETVTK | | SYQKNDWRDA | | EENKKEDKEK | | EEEEEEKPKR |
GSIGENQVEV | | MVEEKTTESQ | | EETVVMSLKN | | GQISSEEPKQ | | EEEREQGSDE |
ISHHEKMEEE | | DKERAEAERA | | RLEAEERERI | | KAEQDKKIAD | | ERARIEAEEK |
AAAQERERRE | | AEERERMREE | | EKRAAEERQR | | IKEEEKRAAE | | ERQRIKEEEK |
RAAEERQRIK | | EEEKRAAEER | | QRARAEEEEK | | AKVEEQKRNK | | QLEEKKHAMQ |
ETKIKGEKVE | | QKIEGKWVNE | | KKAQEDKLQT | | AVLKKQGEEK | | GTKVQAKREK |
LQEDKPTFKK | | EEIKDEKIKK | | DKEPKEEVKS | | FMDRKKGFTE | | VKSQNGEFMT |
HKLKHTENTF | | SRPGGRASVD | | TKEAEGAPQV | | EAGKRLEELR | | RRRGETESEE |
FEKLKQKQQE | | AALELEELKK | | KREERRKVLE | | EEEQRRKQEE | | ADRKLREEEE |
KRRLKEEIER | | RRAEAAEKRQ | | KMPEDGLSDD | | KKPFKCFTPK | | GSSLKIEERA |
EFLNKSVQKS | | SGVKSTHQAA | | IVSKIDSRLE | | QYTSAIEGTK | | SAKPTKPAAS |
DLPVPAEGVR | | NIKSMWEKGN | | VFSSPTAAGT | | PNKETAGLKV | | GVSSRINEWL |
TKTPDGNKSP | | APKPSDLRPG | | DVSSKRNLWE | | KQSVDKVTSP | | TKV |
Кодований геном білок за функціями належить до м'язових білків, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- Humphrey M.B., Herrera-Sosa H., Gonzalez G., Lee R., Bryan J. (1992). Cloning of cDNAs encoding human caldesmons. Gene. 112: 197—204. PMID 1555769 DOI:10.1016/0378-1119(92)90376-Z
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Huber P.A.J., Redwood C.S., Avent N.D., Tanner M.J.A., Marston S.B. (1993). Identification of functioning regulatory sites and a new myosin binding site in the C-terminal 288 amino acids of caldesmon expressed from a human clone. J. Muscle Res. Cell Motil. 14: 385—391. PMID 8227296 DOI:10.1007/BF00121289
- Novy R.E., Lin J.L.-C., Lin J.J.-C. (1991). Characterization of cDNA clones encoding a human fibroblast caldesmon isoform and analysis of caldesmon expression in normal and transformed cells. J. Biol. Chem. 266: 16917—16924. PMID 1885618
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1441 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q05682 (англ.) . Архів оригіналу за 4 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |