CALD1

Ідентифікатори

Символи

CALD1, CDM, H-CAD, HCAD, L-CAD, LCAD, NAG22, caldesmon 1, h-CD

Зовнішні ІД

OMIM: 114213 HomoloGene: 137424 GeneCards: CALD1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• myosin binding • actin binding • tropomyosin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calmodulin binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • міофібрила • цитоскелет • actin cytoskeleton • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • actin cap
Біологічний процес	• м'язове скорочення
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


800


25687

Ensembl


ENSG00000122786


ENSRNOG00000010233

UniProt


Q05682


Q62736

RefSeq (мРНК)


NM_004342 NM_033138 NM_033139 NM_033140 NM_033157


NM_013146

RefSeq (білок)


NP_004333 NP_149129 NP_149130 NP_149131 NP_149347


NP_037278

Локус (UCSC)

Хр. 7: 134.74 – 134.97 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CALD1 (англ. Caldesmon 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 793 амінокислот, а молекулярна маса — 93 231^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDDFERRREL	RRQKREEMRL	EAERIAYQRN	DDDEEEAARE	RRRRARQERL
RQKQEEESLG	QVTDQVEVNA	QNSVPDEEAK	TTTTNTQVEG	DDEAAFLERL
ARREERRQKR	LQEALERQKE	FDPTITDASL	SLPSRRMQND	TAENETTEKE
EKSESRQERY	EIEETETVTK	SYQKNDWRDA	EENKKEDKEK	EEEEEEKPKR
GSIGENQVEV	MVEEKTTESQ	EETVVMSLKN	GQISSEEPKQ	EEEREQGSDE
ISHHEKMEEE	DKERAEAERA	RLEAEERERI	KAEQDKKIAD	ERARIEAEEK
AAAQERERRE	AEERERMREE	EKRAAEERQR	IKEEEKRAAE	ERQRIKEEEK
RAAEERQRIK	EEEKRAAEER	QRARAEEEEK	AKVEEQKRNK	QLEEKKHAMQ
ETKIKGEKVE	QKIEGKWVNE	KKAQEDKLQT	AVLKKQGEEK	GTKVQAKREK
LQEDKPTFKK	EEIKDEKIKK	DKEPKEEVKS	FMDRKKGFTE	VKSQNGEFMT
HKLKHTENTF	SRPGGRASVD	TKEAEGAPQV	EAGKRLEELR	RRRGETESEE
FEKLKQKQQE	AALELEELKK	KREERRKVLE	EEEQRRKQEE	ADRKLREEEE
KRRLKEEIER	RRAEAAEKRQ	KMPEDGLSDD	KKPFKCFTPK	GSSLKIEERA
EFLNKSVQKS	SGVKSTHQAA	IVSKIDSRLE	QYTSAIEGTK	SAKPTKPAAS
DLPVPAEGVR	NIKSMWEKGN	VFSSPTAAGT	PNKETAGLKV	GVSSRINEWL
TKTPDGNKSP	APKPSDLRPG	DVSSKRNLWE	KQSVDKVTSP	TKV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до м'язових білків, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Humphrey M.B., Herrera-Sosa H., Gonzalez G., Lee R., Bryan J. (1992). Cloning of cDNAs encoding human caldesmons. Gene. 112: 197—204. PMID 1555769 DOI:10.1016/0378-1119(92)90376-Z
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Huber P.A.J., Redwood C.S., Avent N.D., Tanner M.J.A., Marston S.B. (1993). Identification of functioning regulatory sites and a new myosin binding site in the C-terminal 288 amino acids of caldesmon expressed from a human clone. J. Muscle Res. Cell Motil. 14: 385—391. PMID 8227296 DOI:10.1007/BF00121289
Novy R.E., Lin J.L.-C., Lin J.J.-C. (1991). Characterization of cDNA clones encoding a human fibroblast caldesmon isoform and analysis of caldesmon expression in normal and transformed cells. J. Biol. Chem. 266: 16917—16924. PMID 1885618

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1441 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q05682 (англ.) . Архів оригіналу за 4 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.