CAPN6 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CAPN6

Ідентифікатори

Символи

CAPN6, CANPX, CAPNX, CalpM, DJ914P14.1, calpain 6, calpamodulin

Зовнішні ІД

OMIM: 300146 MGI: 1100850 HomoloGene: 7252 GeneCards: CAPN6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• microtubule binding • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • веретено поділу • spindle microtubule • мікротрубочка • внутрішньоклітинний • цитоскелет • гіалоплазма
Біологічний процес	• regulation of cytoskeleton organization • microtubule bundle formation • протеоліз
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


827


12338

Ensembl


ENSG00000077274


ENSMUSG00000067276

UniProt


Q9Y6Q1


O35646

RefSeq (мРНК)


NM_014289


NM_007603

RefSeq (білок)


NP_055104


NP_031629

Локус (UCSC)

Хр. X: 111.25 – 111.27 Mb

Хр. X: 142.59 – 142.61 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CAPN6 (англ. Calpain 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 641 амінокислот, а молекулярна маса — 74 576^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGPPLKLFKN	QKYQELKQEC	IKDSRLFCDP	TFLPENDSLF	YNRLLPGKVV
WKRPQDICDD	PHLIVGNISN	HQLTQGRLGH	KPMVSAFSCL	AVQESHWTKT
IPNHKEQEWD	PQKTEKYAGI	FHFRFWHFGE	WTEVVIDDLL	PTINGDLVFS
FSTSMNEFWN	ALLEKAYAKL	LGCYEALDGL	TITDIIVDFT	GTLAETVDMQ
KGRYTELVEE	KYKLFGELYK	TFTKGGLICC	SIESPNQEEQ	EVETDWGLLK
GHTYTMTDIR	KIRLGERLVE	VFSAEKVYMV	RLRNPLGRQE	WSGPWSEISE
EWQQLTASDR	KNLGLVMSDD	GEFWMSLEDF	CRNFHKLNVC	RNVNNPIFGR
KELESVLGCW	TVDDDPLMNR	SGGCYNNRDT	FLQNPQYIFT	VPEDGHKVIM
SLQQKDLRTY	RRMGRPDNYI	IGFELFKVEM	NRKFRLHHLY	IQERAGTSTY
IDTRTVFLSK	YLKKGNYVLV	PTMFQHGRTS	EFLLRIFSEV	PVQLRELTLD
MPKMSCWNLA	RGYPKVVTQI	TVHSAEDLEK	KYANETVNPY	LVIKCGKEEV
RSPVQKNTVH	AIFDTQAIFY	RRTTDIPIIV	QVWNSRKFCD	QFLGQVTLDA
DPSDCRDLKS	LYLRKKGGPT	AKVKQGHISF	KVISSDDLTE	L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Dear T.N., Matena K., Vingron M., Boehm T. (1997). A new subfamily of vertebrate calpains lacking a calmodulin-like domain: implications for calpain regulation and evolution. Genomics. 45: 175—184. PMID 9339374 DOI:10.1006/geno.1997.4870
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1483 (англ.) . Архів оригіналу за 12 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y6Q1 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.