CAPN9 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1ZIV, 2P0R | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CAPN9, GC36, nCL-4, calpain 9 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606401 MGI: 1920897 HomoloGene: 38208 GeneCards: CAPN9 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
короткозорість[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity |
---|
Клітинна компонента | • внутрішньоклітинний • цитоплазма • компонент клітини |
---|
Біологічний процес | • травлення • протеоліз • sarcomere organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_006615 NM_016452 NM_001319676 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001306605 NP_006606 NP_057536 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 230.75 – 230.8 Mb | Хр. 8: 125.3 – 125.35 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CAPN9 (англ. Calpain 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 690 амінокислот, а молекулярна маса — 79 097[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPYLYRAPGP | | QAHPVPKDAR | | ITHSSGQSFE | | QMRQECLQRG | | TLFEDADFPA |
SNSSLFYSER | | PQIPFVWKRP | | GEIVKNPEFI | | LGGATRTDIC | | QGELGDCWLL |
AAIASLTLNQ | | KALARVIPQD | | QSFGPGYAGI | | FHFQFWQHSE | | WLDVVIDDRL |
PTFRDRLVFL | | HSADHNEFWS | | ALLEKAYAKL | | NGSYEALKGG | | SAIEAMEDFT |
GGVAETFQTK | | EAPENFYEIL | | EKALKRGSLL | | GCFIDTRSAA | | ESEARTPFGL |
IKGHAYSVTG | | IDQVSFRGQR | | IELIRIRNPW | | GQVEWNGSWS | | DSSPEWRSVG |
PAEQKRLCHT | | ALDDGEFWMA | | FKDFKAHFDK | | VEICNLTPDA | | LEEDAIHKWE |
VTVHQGSWVR | | GSTAGGCRNF | | LDTFWTNPQI | | KLSLTEKDEG | | QEECSFLVAL |
MQKDRRKLKR | | FGANVLTIGY | | AIYECPDKDE | | HLNKDFFRYH | | ASRARSKTFI |
NLREVSDRFK | | LPPGEYILIP | | STFEPHQEAD | | FCLRIFSEKK | | AITRDMDGNV |
DIDLPEPPKP | | TPPDQETEEE | | QRFRALFEQV | | AGEDMEVTAE | | ELEYVLNAVL |
QKKKDIKFKK | | LSLISCKNII | | SLMDTSGNGK | | LEFDEFKVFW | | DKLKQWINLF |
LRFDADKSGT | | MSTYELRTAL | | KAAGFQLSSH | | LLQLIVLRYA | | DEELQLDFDD |
FLNCLVRLEN | | ASRVFQALST | | KNKEFIHLNI | | NEFIHLTMNI |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію.
Література
- Lee H.-J., Sorimachi H., Jeong S.-Y., Ishiura S., Suzuki K. (1998). Molecular cloning and characterization of a novel tissue-specific calpain predominantly expressed in the digestive tract. Biol. Chem. 379: 175—183. PMID 9524069 DOI:10.1515/bchm.1998.379.2.175
- Yoshikawa Y., Mukai H., Hino F., Asada K., Kato I. (2000). Isolation of two novel genes, down-regulated in gastric cancer. Jpn. J. Cancer Res. 91: 459—463. PMID 10835488 DOI:10.1111/j.1349-7006.2000.tb00967.x
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CAPN9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1486 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O14815 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |