CARMIL1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3LK2, 3LK3 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CARMIL1, CARMIL, CARMIL1a, LRRC16, dJ501N12.1, dJ501N12.5, LRRC16A, leucine rich repeat containing 16A, capping protein regulator and myosin 1 linker 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609593 MGI: 1915982 HomoloGene: 9757 GeneCards: CARMIL1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • filamentous actin • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • macropinosome • cell leading edge • екзосома • цитоскелет • клітинне ядро • lamellipodium • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck |
---|
Біологічний процес | • barbed-end actin filament uncapping • positive regulation of lamellipodium organization • negative regulation of barbed-end actin filament capping • positive regulation of actin filament polymerization • ruffle organization • actin filament organization • positive regulation of cell migration • actin filament network formation • зсідання крові • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • macropinocytosis • urate metabolic process • cell migration • positive regulation of stress fiber assembly • lamellipodium assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_026825 NM_177807 NM_001311122 NM_001384122 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001298051 NP_081101 NP_001371051 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 25.28 – 25.62 Mb | Хр. 13: 24.2 – 24.46 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CARMIL1 (англ. Capping protein regulator and myosin 1 linker 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 371 амінокислот, а молекулярна маса — 151 557[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTEESSDVPR | | ELIESIKDVI | | GRKIKISVKK | | KVKLEVKGDK | | VENKVLVLTS |
CRAFLVTARI | | PTKLELTFSY | | LEIHGVVCSK | | SAQMIVETEK | | CSISMKMASP |
EDVSEVLAHI | | GTCLRKIFPG | | LSPVRIMKKV | | SMEPSERLAS | | LQALWDSQTV |
AEQGPCGGFS | | QMYACVCDWL | | GFSYREEVQW | | DVDTIYLTQD | | TRELNLQDFS |
HLDHRDLIPI | | IAALEYNQWF | | TKLSSKDLKL | | STDVCEQILR | | VVSRSNRLEE |
LVLENAGLRT | | DFAQKLASAL | | AHNPNSGLHT | | INLAGNPLED | | RGVSSLSIQF |
AKLPKGLKHL | | NLSKTSLSPK | | GVNSLSQSLS | | ANPLTASTLV | | HLDLSGNVLR |
GDDLSHMYNF | | LAQPNAIVHL | | DLSNTECSLD | | MVCGALLRGC | | LQYLAVLNLS |
RTVFSHRKGK | | EVPPSFKQFF | | SSSLALMHIN | | LSGTKLSPEP | | LKALLLGLAC |
NHNLKGVSLD | | LSNCELRSGG | | AQVLEGCIAE | | IHNITSLDIS | | DNGLESDLST |
LIVWLSKNRS | | IQHLALGKNF | | NNMKSKNLTP | | VLDNLVQMIQ | | DEESPLQSLS |
LADSKLKTEV | | TIIINALGSN | | TSLTKVDISG | | NGMGDMGAKM | | LAKALQINTK |
LRTVIWDKNN | | ITAQGFQDIA | | VAMEKNYTLR | | FMPIPMYDAS | | QALKTNPEKT |
EDALQKIENY | | LLRNHETRKY | | LQEQAYRLQQ | | GIVTSTTQQM | | IDRICVKVQD |
HLNSLRNCGG | | DAIQEDLKSA | | ERLMRDAKNS | | KTLLPNLYHV | | GGASWAGASG |
LLSSPIQETL | | ESMAGEVTRV | | VDEQLKALLE | | SMVDAAENLC | | PNVMKKAHIR |
QDLIHASTEK | | ISIPRTFVKN | | VLLEQSGIDI | | LNKISEVKLT | | VASFLSDRIV |
DEILDALSHC | | HHKLADHFSR | | RGKTLPQQES | | LEIELAEEKP | | VKRSIITVEE |
LTEIERLEDL | | DTCMMTPKSK | | RKSIHSRMLR | | PVSRAFEMEF | | DLDKALEEVP |
IHIEDPPFPS | | LRQEKRSSGF | | ISELPSEEGK | | KLEHFTKLRP | | KRNKKQQPTQ |
AAVCAANIVS | | QDGEQNGLMG | | RVDEGVDEFF | | TKKVTKMDSK | | KWSTRGSESH |
ELNEGGDEKK | | KRDSRKSSGF | | LNLIKSRSKS | | ERPPTILMTE | | EPSSPKGAVR |
SPPVDCPRKD | | TKAAEHNGNS | | ERIEEIKTPD | | SFEESQGEEI | | GKVERSDSKS |
SPQAGRRYGV | | QVMGSGLLAE | | MKAKQEKRAA | | CAQKKLGNDA | | VSQDSSSPAL |
SGVERSDGGG | | AVPKLHPGLP | | ENRFGLGTPE | | KNTKAEPKAE | | AGSRSRSSSS |
TPTSPKPLLQ | | SPKPSLAARP | | VIPQKPRTAS | | RPDDIPDSPS | | SPKVALLPPV |
LKKVPSDKER | | DGQSSPQPSP | | RTFSQEVSRR | | SWGQQAQEYQ | | EQKQRSSSKD |
GHQGSKSNDS | | GEEAEKEFIF | | V |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.
Література
- Liang Y., Niederstrasser H., Edwards M., Jackson C.E., Cooper J.A. (2009). Distinct roles for CARMIL isoforms in cell migration. Mol. Biol. Cell. 20: 5290—5305. PMID 19846667 DOI:10.1091/mbc.E08-10-1071
- Lanier M.H., McConnell P., Cooper J.A. (2016). Cell migration and invadopodia formation require a membrane-binding domain of CARMIL2. J. Biol. Chem. 291: 1076—1091. PMID 26578515 DOI:10.1074/jbc.M115.676882
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21581 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q5VZK9 (англ.) . Архів оригіналу за 14 листопада 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |