CASP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1PYO, 2P2C, 3R5J, 3R6G, 3R6L, 3R7B, 3R7N, 3R7S, 3RJM

Ідентифікатори

Символи

CASP2, CASP-2, ICH1, NEDD-2, NEDD2, PPP1R57, caspase 2

Зовнішні ІД

OMIM: 600639 MGI: 97295 HomoloGene: 7254 GeneCards: CASP2

Реагує на сполуку

emricasan^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity • protein domain specific binding • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • hydrolase activity • identical protein binding • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • мітохондрія • клітинне ядро
Біологічний процес	• DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • execution phase of apoptosis • protein processing • GO:0010260 старіння людини • positive regulation of apoptotic signaling pathway • luteolysis • cellular response to mechanical stimulus • positive regulation of neuron apoptotic process • brain development • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • positive regulation of apoptotic process • ectopic germ cell programmed cell death • apoptotic signaling pathway • neural retina development • GO:0097285 апоптоз • regulation of apoptotic process • протеоліз • negative regulation of apoptotic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


835


12366

Ensembl


ENSG00000106144


ENSMUSG00000029863

UniProt


P42575


P29594

RefSeq (мРНК)


NM_032983 NM_001224 NM_032982 NM_032984


NM_007610

RefSeq (білок)


NP_001215 NP_116764 NP_116765


NP_031636

Локус (UCSC)

Хр. 7: 143.29 – 143.31 Mb

Хр. 6: 42.24 – 42.26 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CASP2 (англ. Caspase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 452 амінокислот, а молекулярна маса — 50 685^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAPSAGSWS	TFQHKELMAA	DRGRRILGVC	GMHPHHQETL	KKNRVVLAKQ
LLLSELLEHL	LEKDIITLEM	RELIQAKVGS	FSQNVELLNL	LPKRGPQAFD
AFCEALRETK	QGHLEDMLLT	TLSGLQHVLP	PLSCDYDLSL	PFPVCESCPL
YKKLRLSTDT	VEHSLDNKDG	PVCLQVKPCT	PEFYQTHFQL	AYRLQSRPRG
LALVLSNVHF	TGEKELEFRS	GGDVDHSTLV	TLFKLLGYDV	HVLCDQTAQE
MQEKLQNFAQ	LPAHRVTDSC	IVALLSHGVE	GAIYGVDGKL	LQLQEVFQLF
DNANCPSLQN	KPKMFFIQAC	RGDETDRGVD	QQDGKNHAGS	PGCEESDAGK
EKLPKMRLPT	RSDMICGYAC	LKGTAAMRNT	KRGSWYIEAL	AQVFSERACD
MHVADMLVKV	NALIKDREGY	APGTEFHRCK	EMSEYCSTLC	RHLYLFPGHP
PT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

Wang L., Miura M., Bergeron L., Zhu H., Yuan J. (1994). Ich-1, an Ice/ced-3-related gene, encodes both positive and negative regulators of programmed cell death. Cell. 78: 739—750. PMID 8087842 DOI:10.1016/S0092-8674(94)90422-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Xue D., Shaham S., Horvitz H.R. (1996). The Caenorhabditis elegans cell-death protein CED-3 is a cysteine protease with substrate specificities similar to those of the human CPP32 protease. Genes Dev. 10: 1073—1083. PMID 8654923 DOI:10.1101/gad.10.9.1073
Koseki T., Inohara N., Chen S., Nunez G. (1998). ARC, an inhibitor of apoptosis expressed in skeletal muscle and heart that interacts selectively with caspases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 5156—5160. PMID 9560245 DOI:10.1073/pnas.95.9.5156
Tinel A., Tschopp J. (2004). The PIDDosome, a protein complex implicated in activation of caspase-2 in response to genotoxic stress. Science. 304: 843—846. PMID 15073321 DOI:10.1126/science.1095432
Vakifahmetoglu H., Olsson M., Orrenius S., Zhivotovsky B. (2006). Functional connection between p53 and caspase-2 is essential for apoptosis induced by DNA damage. Oncogene. 25: 5683—5692. PMID 16652156 DOI:10.1038/sj.onc.1209569

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Caspase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1503 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P42575 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.