CAST

CAST
Ідентифікатори
Символи CAST, BS-17, PLACK, calpastatin
Зовнішні ІД OMIM: 114090 MGI: 1098236 HomoloGene: 7658 GeneCards: CAST
Онтологія гена
Молекулярна функція

peptidase inhibitor activity
cysteine-type endopeptidase inhibitor activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
endopeptidase inhibitor activity
RNA binding
cadherin binding
calcium-dependent cysteine-type endopeptidase inhibitor activity
protease binding

Клітинна компонента

ендоплазматичний ретикулум
мембрана
гіалоплазма

Біологічний процес

negative regulation of peptidase activity
negative regulation of type B pancreatic cell apoptotic process
inhibition of cysteine-type endopeptidase activity
presynaptic active zone organization

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
831
12380
Ensembl
ENSG00000153113
ENSMUSG00000021585
UniProt
P20810
P51125
RefSeq (мРНК)
NM_001042440
NM_001042441
NM_001042442
NM_001042443
NM_001042444
NM_001042445
NM_001042446
NM_001190442
NM_001284212
NM_001284213
NM_001750
NM_173060
NM_173061
NM_173062
NM_173063
NM_001330626
NM_001330627
NM_001330628
NM_001330629
NM_001330630
NM_001330631
NM_001330632
NM_001330633
NM_001330634
NM_001375317
NM_001301153
NM_001301155
NM_001301156
NM_001301157
NM_001301158
NM_001301160
NM_001301181
NM_009817
RefSeq (білок)
NP_001035905
NP_001035906
NP_001035907
NP_001035908
NP_001035909
NP_001035910
NP_001035911
NP_001177371
NP_001271141
NP_001271142
NP_001317555
NP_001317556
NP_001317557
NP_001317558
NP_001317559
NP_001317560
NP_001317561
NP_001317562
NP_001317563
NP_001741
NP_775083
NP_001362246
NP_001288082
NP_001288084
NP_001288085
NP_001288086
NP_001288087
NP_001288089
NP_001288110
NP_033947
Локус (UCSC) Хр. 5: 96.53 – 96.78 Mb Хр. 13: 74.84 – 74.96 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CAST (англ. Calpastatin) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 708 амінокислот, а молекулярна маса — 76 573[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNPTETKAIPVSQQMEGPHLPNKKKHKKQAVKTEPEKKSQSTKLSVVHEK
KSQEGKPKEHTEPKSLPKQASDTGSNDAHNKKAVSRSAEQQPSEKSTEPK
TKPQDMISAGGESVAGITAISGKPGDKKKEKKSLTPAVPVESKPDKPSGK
SGMDAALDDLIDTLGGPEETEEENTTYTGPEVSDPMSSTYIEELGKREVT
IPPKYRELLAKKEGITGPPADSSKPIGPDDAIDALSSDFTCGSPTAAGKK
TEKEESTEVLKAQSAGTVRSAAPPQEKKRKVEKDTMSDQALEALSASLGT
RQAEPELDLRSIKEVDEAKAKEEKLEKCGEDDETIPSEYRLKPATDKDGK
PLLPEPEEKPKPRSESELIDELSEDFDRSECKEKPSKPTEKTEESKAAAP
APVSEAVCRTSMCSIQSAPPEPATLKGTVPDDAVEALADSLGKKEADPED
GKPVMDKVKEKAKEEDREKLGEKEETIPPDYRLEEVKDKDGKPLLPKESK
EQLPPMSEDFLLDALSEDFSGPQNASSLKFEDAKLAAAISEVVSQTPAST
TQAGAPPRDTSQSDKDLDDALDKLSDSLGQRQPDPDENKPMEDKVKEKAK
AEHRDKLGERDDTIPPEYRHLLDDNGQDKPVKPPTKKSEDSKKPADDQDP
IDALSGDLDSCPSTTETSQNTAKDKCKKAASSSKAPKNGGKAKDSAKTTE
ETSKPKDD

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібітор тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Despres N., Talbot G., Plouffe B., Boire G., Menard H.A. (1995). Detection and expression of a cDNA clone that encodes a polypeptide containing two inhibitory domains of human calpastatin and its recognition by rheumatoid arthritis sera. J. Clin. Invest. 95: 1891—1896. PMID 7706496 DOI:10.1172/JCI117870
  • Wang L.F., Wei S.G., Miao S.Y., Liu Q.Y., Koide S.S. (1994). Calpastatin gene in human testis. Biochem. Mol. Biol. Int. 33: 245—252. PMID 7951045

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1515 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
  4. UniProt, P20810 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 5
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»