CAST |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CAST, BS-17, PLACK, calpastatin |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 114090 MGI: 1098236 HomoloGene: 7658 GeneCards: CAST |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • peptidase inhibitor activity • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • endopeptidase inhibitor activity • RNA binding • cadherin binding • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase inhibitor activity • protease binding |
---|
Клітинна компонента | • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of peptidase activity • negative regulation of type B pancreatic cell apoptotic process • inhibition of cysteine-type endopeptidase activity • presynaptic active zone organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b3/PBB_GE_CAST_212586_at_fs.png/250px-PBB_GE_CAST_212586_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8e/PBB_GE_CAST_207467_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_CAST_207467_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a6/PBB_GE_CAST_208908_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CAST_208908_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001042440 NM_001042441 NM_001042442 NM_001042443 NM_001042444
| NM_001042445 NM_001042446 NM_001190442 NM_001284212 NM_001284213 NM_001750 NM_173060 NM_173061 NM_173062 NM_173063 NM_001330626 NM_001330627 NM_001330628 NM_001330629 NM_001330630 NM_001330631 NM_001330632 NM_001330633 NM_001330634 NM_001375317 |
| NM_001301153 NM_001301155 NM_001301156 NM_001301157 NM_001301158
| NM_001301160 NM_001301181 NM_009817 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001035905 NP_001035906 NP_001035907 NP_001035908 NP_001035909
| NP_001035910 NP_001035911 NP_001177371 NP_001271141 NP_001271142 NP_001317555 NP_001317556 NP_001317557 NP_001317558 NP_001317559 NP_001317560 NP_001317561 NP_001317562 NP_001317563 NP_001741 NP_775083 NP_001362246 |
| NP_001288082 NP_001288084 NP_001288085 NP_001288086 NP_001288087
| NP_001288089 NP_001288110 NP_033947 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 96.53 – 96.78 Mb | Хр. 13: 74.84 – 74.96 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CAST (англ. Calpastatin) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 708 амінокислот, а молекулярна маса — 76 573[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNPTETKAIP | | VSQQMEGPHL | | PNKKKHKKQA | | VKTEPEKKSQ | | STKLSVVHEK |
KSQEGKPKEH | | TEPKSLPKQA | | SDTGSNDAHN | | KKAVSRSAEQ | | QPSEKSTEPK |
TKPQDMISAG | | GESVAGITAI | | SGKPGDKKKE | | KKSLTPAVPV | | ESKPDKPSGK |
SGMDAALDDL | | IDTLGGPEET | | EEENTTYTGP | | EVSDPMSSTY | | IEELGKREVT |
IPPKYRELLA | | KKEGITGPPA | | DSSKPIGPDD | | AIDALSSDFT | | CGSPTAAGKK |
TEKEESTEVL | | KAQSAGTVRS | | AAPPQEKKRK | | VEKDTMSDQA | | LEALSASLGT |
RQAEPELDLR | | SIKEVDEAKA | | KEEKLEKCGE | | DDETIPSEYR | | LKPATDKDGK |
PLLPEPEEKP | | KPRSESELID | | ELSEDFDRSE | | CKEKPSKPTE | | KTEESKAAAP |
APVSEAVCRT | | SMCSIQSAPP | | EPATLKGTVP | | DDAVEALADS | | LGKKEADPED |
GKPVMDKVKE | | KAKEEDREKL | | GEKEETIPPD | | YRLEEVKDKD | | GKPLLPKESK |
EQLPPMSEDF | | LLDALSEDFS | | GPQNASSLKF | | EDAKLAAAIS | | EVVSQTPAST |
TQAGAPPRDT | | SQSDKDLDDA | | LDKLSDSLGQ | | RQPDPDENKP | | MEDKVKEKAK |
AEHRDKLGER | | DDTIPPEYRH | | LLDDNGQDKP | | VKPPTKKSED | | SKKPADDQDP |
IDALSGDLDS | | CPSTTETSQN | | TAKDKCKKAA | | SSSKAPKNGG | | KAKDSAKTTE |
ETSKPKDD |
Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібітор тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Despres N., Talbot G., Plouffe B., Boire G., Menard H.A. (1995). Detection and expression of a cDNA clone that encodes a polypeptide containing two inhibitory domains of human calpastatin and its recognition by rheumatoid arthritis sera. J. Clin. Invest. 95: 1891—1896. PMID 7706496 DOI:10.1172/JCI117870
- Wang L.F., Wei S.G., Miao S.Y., Liu Q.Y., Koide S.S. (1994). Calpastatin gene in human testis. Biochem. Mol. Biol. Int. 33: 245—252. PMID 7951045
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1515 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P20810 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |