CCL1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1EL0, 4OIJ, 4OIK

Ідентифікатори

Символи

CCL1, I-309, P500, SCYA1, SISe, TCA3, C-C motif chemokine ligand 1

Зовнішні ІД

OMIM: 182281 MGI: 98258 HomoloGene: 55541 GeneCards: CCL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity • CCR chemokine receptor binding • chemokine activity
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір
Біологічний процес	• chemokine-mediated signaling pathway • cellular response to tumor necrosis factor • cellular calcium ion homeostasis • neutrophil chemotaxis • хемотаксис • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • cellular response to interleukin-1 • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to interferon-gamma • lymphocyte chemotaxis • inflammatory response • GO:0022415 viral process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • positive regulation of monocyte chemotaxis • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • positive regulation of inflammatory response • monocyte chemotaxis • eosinophil chemotaxis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6346


20290

Ensembl


ENSG00000108702


ENSMUSG00000020702

UniProt


P22362


P10146

RefSeq (мРНК)


NM_002981


NM_011329

RefSeq (білок)


NP_002972


NP_035459

Локус (UCSC)

Хр. 17: 34.36 – 34.36 Mb

Хр. 11: 82.07 – 82.2 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CCL1 (англ. C-C motif chemokine ligand 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 96 амінокислот, а молекулярна маса — 10 992^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQIITTALVC		LLLAGMWPED		VDSKSMQVPF		SRCCFSFAEQ		EIPLRAILCY
RNTSSICSNE		GLIFKLKRGK		EACALDTVGW		VQRHRKMLRH		CPSKRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі, як хемотаксис. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
Miller M.D., Krangel M.S. (1992). The human cytokine I-309 is a monocyte chemoattractant. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 2950—2954. PMID 1557400 DOI:10.1073/pnas.89.7.2950
Miller M.D., Hata S., Waal Malefyt R., Krangel M.S. (1989). A novel polypeptide secreted by activated human T lymphocytes. J. Immunol. 143: 2907—2916. PMID 2809212

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10609 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 21 вересня 2017.
↑ UniProt, P22362 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.