CCL21

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2L4N

Ідентифікатори

Символи

CCL21, 6Ckine, CKb9, ECL, SCYA21, SLC, TCA4, C-C motif chemokine ligand 21

Зовнішні ІД

OMIM: 602737 MGI: 1349183 HomoloGene: 2247 GeneCards: CCL21

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity • chemokine receptor binding • CCR7 chemokine receptor binding • chemokine activity • CCR chemokine receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір
Біологічний процес	• negative regulation of leukocyte tethering or rolling • release of sequestered calcium ion into cytosol • positive regulation of receptor-mediated endocytosis • positive regulation of protein kinase B signaling • positive regulation of cell motility • positive regulation of actin filament polymerization • monocyte chemotaxis • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • ruffle organization • positive regulation of cell-matrix adhesion • chemokine-mediated signaling pathway • cellular response to tumor necrosis factor • cell-cell signaling • T cell costimulation • cell maturation • positive regulation of JNK cascade • dendritic cell chemotaxis • negative regulation of dendritic cell dendrite assembly • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity • хемотаксис • response to prostaglandin E • positive regulation of dendritic cell antigen processing and presentation • dendritic cell dendrite assembly • positive regulation of pseudopodium assembly • mesangial cell-matrix adhesion • positive regulation of chemotaxis • cellular response to interleukin-1 • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • establishment of T cell polarity • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of glycoprotein biosynthetic process • cellular response to interferon-gamma • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • cell chemotaxis • lymphocyte chemotaxis • positive regulation of neutrophil chemotaxis • positive regulation of cell adhesion mediated by integrin • immunological synapse formation • positive regulation of filopodium assembly • positive regulation of T cell migration • positive regulation of myeloid dendritic cell chemotaxis • positive regulation of protein kinase activity • inflammatory response • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • negative regulation of dendritic cell apoptotic process • positive regulation of T cell chemotaxis • neutrophil chemotaxis • chemokine (C-C motif) ligand 21 signaling pathway • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • cellular response to chemokine
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6366


18829

Ensembl


ENSG00000137077


ENSMUSG00000094686

UniProt


O00585


P84444

RefSeq (мРНК)


NM_002989


NM_011124

RefSeq (білок)


NP_002980


NP_035254

Локус (UCSC)

Хр. 9: 34.71 – 34.71 Mb

Хр. 4: 42.77 – 42.77 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CCL21 (англ. C-C motif chemokine ligand 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 134 амінокислот, а молекулярна маса — 14 646^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQSLALSLL	ILVLAFGIPR	TQGSDGGAQD	CCLKYSQRKI	PAKVVRSYRK
QEPSLGCSIP	AILFLPRKRS	QAELCADPKE	LWVQQLMQHL	DKTPSPQKPA
QGCRKDRGAS	KTGKKGKGSK	GCKRTERSQT	PKGP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, хемотаксис. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hedrick J.A., Zlotnik A. (1997). Identification and characterization of a novel beta chemokine containing six conserved cysteines. J. Immunol. 159: 1589—1593. PMID 9257816

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10620 (англ.) . Архів оригіналу за 3 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O00585 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.