CDC40

Ідентифікатори

Символи

CDC40, EHB3, PRP17, PRPF17, cell division cycle 40, PCH15

Зовнішні ІД

OMIM: 605585 MGI: 1918963 HomoloGene: 5716 GeneCards: CDC40

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • U2-type catalytic step 2 spliceosome • nuclear speck
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • Сплайсинг РНК • RNA export from nucleus
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51362


71713

Ensembl


ENSG00000168438


ENSMUSG00000038446

UniProt


O60508


Q9DC48

RefSeq (мРНК)


NM_015891


NM_027879

RefSeq (білок)


NP_056975


NP_082155

Локус (UCSC)

Хр. 6: 110.18 – 110.25 Mb

Хр. 10: 40.71 – 40.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDC40 (англ. Cell division cycle 40) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 579 амінокислот, а молекулярна маса — 65 521^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAAIAALAA	SYGSGSGSES	DSDSESSRCP	LPAADSLMHL	TKSPSSKPSL
AVAVDSAPEV	AVKEDLETGV	HLDPAVKEVQ	YNPTYETMFA	PEFGPENPFR
TQQMAAPRNM	LSGYAEPAHI	NDFMFEQQRR	TFATYGYALD	PSLDNHQVSA
KYIGSVEEAE	KNQGLTVFET	GQKKTEKRKK	FKENDASNID	GFLGPWAKYV
DEKDVAKPSE	EEQKELDEIT	AKRQKKGKQE	EEKPGEEKTI	LHVKEMYDYQ
GRSYLHIPQD	VGVNLRSTMP	PEKCYLPKKQ	IHVWSGHTKG	VSAVRLFPLS
GHLLLSCSMD	CKIKLWEVYG	ERRCLRTFIG	HSKAVRDICF	NTAGTQFLSA
AYDRYLKLWD	TETGQCISRF	TNRKVPYCVK	FNPDEDKQNL	FVAGMSDKKI
VQWDIRSGEI	VQEYDRHLGA	VNTIVFVDEN	RRFVSTSDDK	SLRVWEWDIP
VDFKYIAEPS	MHSMPAVTLS	PNGKWLACQS	MDNQILIFGA	QNRFRLNKKK
IFKGHMVAGY	ACQVDFSPDM	SYVISGDGNG	KLNIWDWKTT	KLYSRFKAHD
KVCIGAVWHP	HETSKVITCG	WDGLIKLWD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК. Локалізований у ядрі.

Література

Zhou Z., Reed R. (1998). Human homologs of yeast prp16 and prp17 reveal conservation of the mechanism for catalytic step II of pre-mRNA splicing. EMBO J. 17: 2095—2106. PMID 9524131 DOI:10.1093/emboj/17.7.2095
Lindsey L.A., Garcia-Blanco M.A. (1998). Functional conservation of the human homolog of the yeast pre-mRNA splicing factor Prp17p. J. Biol. Chem. 273: 32771—32775. PMID 9830021 DOI:10.1074/jbc.273.49.32771
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17350 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, O60508 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.